VPREB1

VPREB1
VPREB1
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2H32, 2H3N, 3BJ9
Идентификаторы
Псевдонимы	VPREB1, IGI, IGVPB, VPREB, CD179a, pre-B lymphocyte 1, V-set pre-B cell surrogate light chain 1
Внешние ID	OMIM: 605141 MGI: 98936 HomoloGene: 84741 GeneCards: VPREB1
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	22-я хромосома человека
Конец	22,245,515 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	16-я хромосома мыши
Конец	16,688,707 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	н/д
	Наибольшая экспрессия в
	choroid plexus of fourth ventricle;
	Дополнительные справочные данные
Ортологи
Ортологи
	7441
	22362
	ENSG00000169575
	ENSMUSG00000059305
	P12018
	P13372
	NM_007128; NM_001303509
	NM_016982
	NP_001290438; NP_009059
	NP_058678
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Йота-цепь иммуноглобулина (англ. Immunoglobulin iota chain; CD179a) — мембранный белок суперсемейства иммуноглобулинов. Продукт гена человека VPREB1^[5]^[6].

Функции

VpreB/CD179a — йота (ι)-цепь иммуноглобулина, полипептид, состоящий из 126 аминокислот, молекулярная масса 16-18 кДа. Экспрессирован на ранних стадиях развития B-лимфоцитов, а именно на проB-клетках и ранних преВ-клетках. Белок имеет структуру, сходную с иммуноглобулиновым доменом V типа, но не содержит последний бета-лист (бета-лист 7) типичного Ig V домена. Вместо этого C-конец белка не похож ни на один другой. VpreB/CD179a нековалентно ассоциирован с IGLL1/CD179b, образуя структуру, подобную лёгкой цепи иммуноглобулинов, которую называют суррогатной лёгкой цепью либо псевдолёгкой цепью. В этом комплексе неполный Ig V домен VpreB/CD179a дополняется экстра-бета-листом 7 молекулы IGLL1/CD179b. На поверхности ранних преВ-клеток гетеродимер CD179a/CD179b связан дисульфидной связью с мембранной тяжёлой мю-цепью в ассоциации со вспомогательным белковым гетеродимером Igα/Igβ (CD79a/CD79b). В результате этот комплекс формирует пре-B-клеточный рецептор. Хотя патологии, ассоциированные с CD179a ещё не описаны, недостаточность других компонентов рецептора, включая CD179b, Ig тяжёлую мю-цепь и CD79a, приводит к тяжёлому нарушению развития B-клеток и агаммаглобулинемии у человека. Пре-B-клеточный рецептор передаёт сигнал для (1) клеточной пролиферации, дифференциации проB- в преB-клетки; (2) аллельного исключения в генном локусе Ig тяжёлых цепей и (3) стимуляции V(D)J-рекомбинации Ig лёгких цепей. Таким образом, пре-B-клеточный рецептор функционирует как чек-пойнт ранних этапов развития B-клеток для контроля продукции Ig тяжёлых мю-цепей за счёт функциональной рекомбинации генов тяжёлых цепей, а также способности тяжёлых цепей связываться с лёгкими цепями^[6].

Примечания

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000169575 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000059305 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Bauer SR, Huebner K, Budarf M, Finan J, Erikson J, Emanuel BS, Nowell PC, Croce CM, Melchers F (Nov 1988). "The human Vpre B gene is located on chromosome 22 near a cluster of V lambda gene segments". Immunogenetics. 28 (5): 328—33. doi:10.1007/BF00364231. PMID 3139558. S2CID 6981867.
↑ ¹ ² Entrez Gene: VPREB1 pre-B lymphocyte gene 1 (неопр.).

Литература

Tsubata T, Reth M (September 1990). "The products of pre-B cell-specific genes (lambda 5 and VpreB) and the immunoglobulin mu chain form a complex that is transported onto the cell surface". The Journal of Experimental Medicine. 172 (3): 973—6. doi:10.1084/jem.172.3.973. PMC 2188549. PMID 2117639.
Bauer SR, Kudo A, Melchers F (January 1988). "Structure and pre-B lymphocyte restricted expression of the VpreB in humans and conservation of its structure in other mammalian species". The EMBO Journal. 7 (1): 111—6. doi:10.1002/j.1460-2075.1988.tb02789.x. PMC 454222. PMID 3258819.
Guelpa-Fonlupt V, Bossy D, Alzari P, Fumoux F, Fougereau M, Schiff C (October 1994). "The human pre-B cell receptor: structural constraints for a tentative model of the pseudo-light (psi L) chain". Molecular Immunology. 31 (14): 1099—108. doi:10.1016/0161-5890(94)90105-8. PMID 7935499.
Ohnishi K, Takemori T (November 1994). "Molecular components and assembly of mu.surrogate light chain complexes in pre-B cell lines". The Journal of Biological Chemistry. 269 (45): 28347—53. PMID 7961773.
Guelpa-Fonlupt V, Tonnelle C, Blaise D, Fougereau M, Fumoux F (January 1994). "Discrete early pro-B and pre-B stages in normal human bone marrow as defined by surface pseudo-light chain expression". European Journal of Immunology. 24 (1): 257—64. doi:10.1002/eji.1830240140. PMID 8020565. S2CID 20176205.
Bornemann KD, Brewer JW, Perez E, Doerre S, Sita R, Corley RB (March 1997). "Secretion of soluble pre-B cell receptors by pre-B cells". Journal of Immunology. 158 (6): 2551—7. PMID 9058786.
Kawasaki K, Minoshima S, Nakato E, Shibuya K, Shintani A, Schmeits JL, Wang J, Shimizu N (March 1997). "One-megabase sequence analysis of the human immunoglobulin lambda gene locus". Genome Research. 7 (3): 250—61. doi:10.1101/gr.7.3.250. PMID 9074928.
Fang T, Smith BP, Roman CA (October 2001). "Conventional and surrogate light chains differentially regulate Ig mu and Dmu heavy chain maturation and surface expression". Journal of Immunology. 167 (7): 3846—57. doi:10.4049/jimmunol.167.7.3846. PMID 11564802.
Gisler R, Sigvardsson M (May 2002). "The human V-preB promoter is a target for coordinated activation by early B cell factor and E47". Journal of Immunology. 168 (10): 5130—8. doi:10.4049/jimmunol.168.10.5130. PMID 11994467.
Gauthier L, Rossi B, Roux F, Termine E, Schiff C (October 2002). "Galectin-1 is a stromal cell ligand of the pre-B cell receptor (BCR) implicated in synapse formation between pre-B and stromal cells and in pre-BCR triggering". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (20): 13014—9. Bibcode:2002PNAS...9913014G. doi:10.1073/pnas.202323999. PMC 130578. PMID 12271131.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). "A genome annotation-driven approach to cloning the human ORFeome". Genome Biology. 5 (10): R84. doi:10.1186/gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
Rossi B, Espeli M, Schiff C, Gauthier L (July 2006). "Clustering of pre-B cell integrins induces galectin-1-dependent pre-B cell receptor relocalization and activation". Journal of Immunology. 177 (2): 796—803. doi:10.4049/jimmunol.177.2.796. PMID 16818733.

[refGRCh38EnsemblENSG00000169575-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000169575 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000059305-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000059305 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid3139558-5] Bauer SR, Huebner K, Budarf M, Finan J, Erikson J, Emanuel BS, Nowell PC, Croce CM, Melchers F (Nov 1988). "The human Vpre B gene is located on chromosome 22 near a cluster of V lambda gene segments". Immunogenetics. 28 (5): 328—33. doi:10.1007/BF00364231. PMID 3139558. S2CID 6981867.

[entrez-6] ¹ ² Entrez Gene: VPREB1 pre-B lymphocyte gene 1 (неопр.).

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Белки: Кластеры дифференцировки
1-50	CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E) CD2 CD3 (γ, δ, ε) CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 (a) CD9 CD10 CD11 (a, b, c, d) CD13 CD14 CD15 CD16 (A, B) CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 (A, B) CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 (a, b, c, d) CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 (a, b, c, d, e, f) CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 (E, L, P) CD63 CD64 (A, B, C) CD66 (a, b, c, d, e, f) CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 (a, b) CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 (a, d, e, h, j, k) CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 (a, b) CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 (a, b) CD121 (a, b) CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 (a, b, c) CD157 CD158 (a, d, e, i, k) CD159 (a, c) CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 (a, b) CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 (a, b, g) CD174 CD177 CD178 CD179 (a, b) CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 (a, b) CD212 CD213a (1, 2) CD217 CD218 (a, b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 (a, b) CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD270 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD319 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350
351-400	CD351 CD352 CD353 CD354 CD355 CD357 CD358 CD360 CD361 CD362 CD363 CD364 CD365 CD366 CD367 CD368 CD369 CD370 CD371

VPREB1

Функции

Примечания

Литература

Навигация

Поиск