HAVCR2

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
HAVCR2
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

5F71

Идентификаторы
ПсевдонимыHAVCR2, HAVcr-2, KIM-3, TIM3, TIMD-3, TIMD3, Tim-3, CD366, hepatitis A virus cellular receptor 2, SPTCL
Внешние IDOMIM: 606652 MGI: 2159682 HomoloGene: 129541 GeneCards: HAVCR2
Расположение гена (человек)
5-я хромосома человека
Хр.5-я хромосома человека[1]
5-я хромосома человека
Расположение в геноме HAVCR2
Расположение в геноме HAVCR2
Локус5q33.3Начало157,085,422 bp[1]
Конец157,142,869 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
11-я хромосома мыши
Хр.11-я хромосома мыши[2]
11-я хромосома мыши
Расположение в геноме HAVCR2
Расположение в геноме HAVCR2
Локус11|11 B1.1Начало46,345,762 bp[2]
Конец46,372,082 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • C1 segment

  • upper lobe of left lung

  • decidua
Наибольшая экспрессия в
  • decidua

  • stroma of bone marrow

  • lumbar subsegment of spinal cord

  • endothelial cell of lymphatic vessel

  • primary visual cortex

  • dentate gyrus of hippocampal formation granule cell
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

84868

171285

Ensembl

ENSG00000135077

ENSMUSG00000020399

UniProt

Q8TDQ0

Q8VIM0

RefSeq (мРНК)

NM_032782

NM_134250

RefSeq (белок)

NP_116171

NP_599011

Локус (UCSC)Chr 5: 157.09 – 157.14 MbChr 11: 46.35 – 46.37 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

HAVCR2, или TIM-3 (англ. Hepatitis A virus cellular receptor 2, или T-cell immunoglobulin and mucin domain 3) — мембранный белок, продукт гена HAVCR2.

Белок был впервые описан в 2002 году на поверхности интерферон-гамма-продуцирующих CD4+ Th1 и CD8+ Tc1 клеток[5][6]. Позже экспрессия HAVCR2 была обнаружена также на клетках Th17[7], регуляторных T-клетках[8], а также на дендритных клетках, естественных киллерах, моноцитах[9].

Функции

[править | править код]

HAVCR2 является иммунным чекпоинтом вместе с другими ингибирующими рецепторами PD-1 и LAG3 и опосредует истощение CD8+ T-лимфоцитов[10]. Рецептор на поверхности CD4+ Th1-клеток также регулирует активацию макрофагов и усиливать экспериментальный аутоиммунный энцефаломиелит у мышей[5].

Основным лигандом HAVCR2 является галектин-9[11]. Взаимодействие с ним приводит к выходу кальция во внутриклеточную среду и вызывает апоптоз[12]. В результате это приводит к подавлению Th1- и Th17-клеточного иммунного ответа и вызывает иммунную толерантность. Другие лиганды HAVCR2 - фосфатидилсерин[13], HMGB1[14] и CEACAM1[15].

Структура

[править | править код]

Белок состоит из 301 аминокислоты, молекулярная масса — 33,4 кДа. HAVCR2 принадлежит к семейству рецепторных белков клеточной поверхности TIM. Белки семейства TIM являются гликопротеинами клеточной поверхности, в структуре которых присутствуют иммуноглобулино-подобный домен IgV и гликозилированный муциновый домен, расположенный вблизи мембраны[16], а также один трансмембранный домен и короткий C-концевой цитоплазматический фрагмент. Содержит 5 консервативных тирозиновых остатков, которые отвечают за взаимодействие с комплексом Т-клеточного рецептора[17][18] и отрицательно регулируют его функцию[19].

Примечания

[править | править код]
  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000135077 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020399 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ 1 2 Monney L., Sabatos C. A., Gaglia J. L., Ryu A., Waldner H., Chernova T., Manning S., Greenfield E. A., Coyle A. J., Sobel R. A., Freeman G. J., Kuchroo V. K. Th1-specific cell surface protein Tim-3 regulates macrophage activation and severity of an autoimmune disease (англ.) // Nature : journal. — 2002. — January (vol. 415, no. 6871). — P. 536—541. — doi:10.1038/415536a. — PMID 11823861.
  6. ↑ Entrez Gene: HAVCR2 hepatitis A virus cellular receptor 2.
  7. ↑ Hastings W. D., Anderson D. E., Kassam N., Koguchi K., Greenfield E. A., Kent S. C., Zheng X. X., Strom T. B., Hafler D. A., Kuchroo V. K. TIM-3 is expressed on activated human CD4+ T cells and regulates Th1 and Th17 cytokines (англ.) // European Journal of Immunology[англ.] : journal. — 2009. — September (vol. 39, no. 9). — P. 2492—2501. — doi:10.1002/eji.200939274. — PMID 19676072. — PMC 2759376.
  8. ↑ Gao X., Zhu Y., Li G., Huang H., Zhang G., Wang F., Sun J., Yang Q., Zhang X., Lu B. TIM-3 expression characterizes regulatory T cells in tumor tissues and is associated with lung cancer progression (англ.) // PLOS One : journal. — 2012. — Vol. 7, no. 2. — P. e30676. — doi:10.1371/journal.pone.0030676. — PMID 22363469. — PMC 3281852.
  9. ↑ Gleason M. K., Lenvik T. R., McCullar V., Felices M., O'Brien M. S., Cooley S. A., Verneris M. R., Cichocki F., Holman C. J., Panoskaltsis-Mortari A., Niki T., Hirashima M., Blazar B. R., Miller J. S. Tim-3 is an inducible human natural killer cell receptor that enhances interferon gamma production in response to galectin-9 (англ.) // Blood : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2012. — March (vol. 119, no. 13). — P. 3064—3072. — doi:10.1182/blood-2011-06-360321. — PMID 22323453. — PMC 3321868.
  10. ↑ Blackburn S. D., Shin H., Haining W. N., Zou T., Workman C. J., Polley A., Betts M. R., Freeman G. J., Vignali D. A., Wherry E. J. Coregulation of CD8+ T cell exhaustion by multiple inhibitory receptors during chronic viral infection (англ.) // Nature Immunology : journal. — 2009. — January (vol. 10, no. 1). — P. 29—37. — doi:10.1038/ni.1679. — PMID 19043418. — PMC 2605166.
  11. ↑ Wada J., Kanwar Y. S. Identification and characterization of galectin-9, a novel beta-galactoside-binding mammalian lectin (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 1997. — February (vol. 272, no. 9). — P. 6078—6086. — doi:10.1074/jbc.272.9.6078. — PMID 9038233.
  12. ↑ Zhu C., Anderson A. C., Schubart A., Xiong H., Imitola J., Khoury S. J., Zheng X. X., Strom T. B., Kuchroo V. K. The Tim-3 ligand galectin-9 negatively regulates T helper type 1 immunity (англ.) // Nature Immunology : journal. — 2005. — December (vol. 6, no. 12). — P. 1245—1252. — doi:10.1038/ni1271. — PMID 16286920.
  13. ↑ DeKruyff R. H., Bu X., Ballesteros A., Santiago C., Chim Y. L., Lee H. H., Karisola P., Pichavant M., Kaplan G. G., Umetsu D. T., Freeman G. J., Casasnovas J. M. T cell/transmembrane, Ig, and mucin-3 allelic variants differentially recognize phosphatidylserine and mediate phagocytosis of apoptotic cells (англ.) // Journal of Immunology?! : journal. — 2010. — February (vol. 184, no. 4). — P. 1918—1930. — doi:10.4049/jimmunol.0903059. — PMID 20083673. — PMC 3128800.
  14. ↑ Chiba S., Baghdadi M., Akiba H., Yoshiyama H., Kinoshita I., Dosaka-Akita H., Fujioka Y., Ohba Y., Gorman J. V., Colgan J. D., Hirashima M., Uede T., Takaoka A., Yagita H., Jinushi M. Tumor-infiltrating DCs suppress nucleic acid-mediated innate immune responses through interactions between the receptor TIM-3 and the alarmin HMGB1 (англ.) // Nature Immunology : journal. — 2012. — September (vol. 13, no. 9). — P. 832—842. — doi:10.1038/ni.2376. — PMID 22842346. — PMC 3622453.
  15. ↑ Huang Y. H., Zhu C., Kondo Y., Anderson A. C., Gandhi A., Russell A., Dougan S. K., Petersen B. S., Melum E., Pertel T., Clayton K. L., Raab M., Chen Q., Beauchemin N., Yazaki P. J., Pyzik M., Ostrowski M. A., Glickman J. N., Rudd C. E., Ploegh H. L., Franke A., Petsko G. A., Kuchroo V. K., Blumberg R. S. CEACAM1 regulates TIM-3-mediated tolerance and exhaustion (англ.) // Nature : journal. — 2015. — January (vol. 517, no. 7534). — P. 386—390. — doi:10.1038/nature13848. — PMID 25363763. — PMC 4297519.
  16. ↑ Cao E., Zang X., Ramagopal U. A., Mukhopadhaya A., Fedorov A., Fedorov E., Zencheck W. D., Lary J. W., Cole J. L., Deng H., Xiao H., Dilorenzo T. P., Allison J. P., Nathenson S. G., Almo S. C. T cell immunoglobulin mucin-3 crystal structure reveals a galectin-9-independent ligand-binding surface (англ.) // Immunity. — Cell Press, 2007. — March (vol. 26, no. 3). — P. 311—321. — doi:10.1016/j.immuni.2007.01.016. — PMID 17363302.
  17. ↑ Lee J., Su E. W., Zhu C., Hainline S., Phuah J., Moroco J. A., Smithgall T. E., Kuchroo V. K., Kane L. P. Phosphotyrosine-dependent coupling of Tim-3 to T-cell receptor signaling pathways (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2011. — October (vol. 31, no. 19). — P. 3963—3974. — doi:10.1128/MCB.05297-11. — PMID 21807895. — PMC 3187355.
  18. ↑ van de Weyer P. S., Muehlfeit M., Klose C., Bonventre J. V., Walz G., Kuehn E. W. A highly conserved tyrosine of Tim-3 is phosphorylated upon stimulation by its ligand galectin-9 (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications[англ.] : journal. — 2006. — December (vol. 351, no. 2). — P. 571—576. — doi:10.1016/j.bbrc.2006.10.079. — PMID 17069754.
  19. ↑ Tomkowicz B., Walsh E., Cotty A., Verona R., Sabins N., Kaplan F., Santulli-Marotto S., Chin C. N., Mooney J., Lingham R. B., Naso M., McCabe T. TIM-3 Suppresses Anti-CD3/CD28-Induced TCR Activation and IL-2 Expression through the NFAT Signaling Pathway (англ.) // PLOS One : journal. — 2015. — Vol. 10, no. 10. — P. e0140694. — doi:10.1371/journal.pone.0140694. — PMID 26492563. — PMC 4619610.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=HAVCR2&oldid=140608131