Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MYF6
Ідентифікатори
Символи
MYF6 , CNM3, MRF4, bHLHc4, myf-6, Myf6, myogenic factor 6
Зовнішні ІД
OMIM : 159991 MGI: 97253 HomoloGene: 1850 GeneCards: MYF6
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • E-box binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро
Біологічний процес
• somitogenesis • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of muscle cell differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • muscle cell fate commitment • muscle organ development • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of skeletal muscle fiber development • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of myoblast fusion • skeletal muscle tissue regeneration • positive regulation of myoblast differentiation • muscle tissue morphogenesis • skeletal muscle cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • skeletal muscle tissue development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 80.71 – 80.71 Mb
Хр. 10: 107.33 – 107.33 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
MYF6 (англ. Myogenic factor 6 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 242 амінокислот , а молекулярна маса — 26 953[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MMMDLFETGS YFFYLDGENV TLQPLEVAEG SPLYPGSDGT LSPCQDQMPP
EAGSDSSGEE HVLAPPGLQP PHCPGQCLIW ACKTCKRKSA PTDRRKAATL
RERRRLKKIN EAFEALKRRT VANPNQRLPK VEILRSAISY IERLQDLLHR
LDQQEKMQEL GVDPFSYRPK QENLEGADFL RTCSSQWPSV SDHSRGLVIT
AKEGGASIDS SASSSLRCLS SIVDSISSEE RKLPCVEEVV EK
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин , міогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Braun T., Bober E., Winter B., Rosenthal N., Arnold H.H. (1990). Myf-6, a new member of the human gene family of myogenic determination factors: evidence for a gene cluster on chromosome 12 . EMBO J . 9 : 821—831. PMID 2311584
Kerst B., Perrot A., Osterziel K.-J., Huebner C., Speer A. (1998). MYF6 mutations resulting in A112S and A90D substitutions in patients with skeletal or cardiac muscle pathology. Hum. Mutat . 12 : 220—220.
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші