Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ETS1
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
1GVJ , 2NNY , 2STT , 2STW , 3MFK , 3RI4 , 3WTS , 3WTT , 3WTU , 3WTV , 3WTW , 3WTX , 3WTY , 3WTZ , 3WU0 , 3WU1 , 4L0Y , 4L0Z , 4L18 , 4LG0
Ідентифікатори
Символи
ETS1 , ETS-1, EWSR2, p54, c-ets-1, ETS proto-oncogene 1, transcription factor
Зовнішні ІД
OMIM : 164720 MGI: 95455 HomoloGene: 3837 GeneCards: ETS1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння , целіакія , системний червоний вовчак [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific double-stranded DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • histone acetyltransferase binding
Клітинна компонента
• цитоплазма • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• regulation of apoptotic process • pituitary gland development • response to estradiol • response to interleukin-1 • response to hypoxia • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of erythrocyte differentiation • cell motility • еструс • процес імунної системи • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1904576 response to antibiotic • жіноча вагітність • angiogenesis involved in wound healing • positive regulation of cell migration • response to mechanical stimulus • response to laminar fluid shear stress • negative regulation of cell cycle • regulation of angiogenesis • transcription by RNA polymerase II • regulation of extracellular matrix disassembly • transcription, DNA-templated • positive regulation of endothelial cell migration • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • PML body organization • response to wounding • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of cell population proliferation • hypothalamus development • negative regulation of inflammatory response • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • cellular response to hydrogen peroxide • positive regulation of inflammatory response • pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration • positive regulation of angiogenesis • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 11: 128.46 – 128.59 Mb
Хр. 9: 32.64 – 32.76 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
ETS1 (англ. ETS proto-oncogene 1, transcription factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот , а молекулярна маса — 50 408[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKAAVDLKPT LTIIKTEKVD LELFPSPDME CADVPLLTPS SKEMMSQALK
ATFSGFTKEQ QRLGIPKDPR QWTETHVRDW VMWAVNEFSL KGVDFQKFCM
NGAALCALGK DCFLELAPDF VGDILWEHLE ILQKEDVKPY QVNGVNPAYP
ESRYTSDYFI SYGIEHAQCV PPSEFSEPSF ITESYQTLHP ISSEELLSLK
YENDYPSVIL RDPLQTDTLQ NDYFAIKQEV VTPDNMCMGR TSRGKLGGQD
SFESIESYDS CDRLTQSWSS QSSFNSLQRV PSYDSFDSED YPAALPNHKP
KGTFKDYVRD RADLNKDKPV IPAAALAGYT GSGPIQLWQF LLELLTDKSC
QSFISWTGDG WEFKLSDPDE VARRWGKRKN KPKMNYEKLS RGLRYYYDKN
IIHKTAGKRY VYRFVCDLQS LLGYTPEELH AMLDVKPDAD E
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет , транскрипція , регуляція транскрипції , ацетилювання, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Majerus M.-A., Bibollet-Ruche F., Telliez J.-B., Wasylyk B., Bailleul B. (1992). Serum, AP-1 and Ets-1 stimulate the human ets-1 promoter. Nucleic Acids Res . 20 : 2699—2703. PMID 1614856 DOI :10.1093/nar/20.11.2699
Hahn S.L., Criqui-Filipe P., Wasylyk B. (1997). Modulation of ETS-1 transcriptional activity by huUBC9, a ubiquitin-conjugating enzyme. Oncogene . 15 : 1489—1495. PMID 9333025 DOI :10.1038/sj.onc.1201301
Li R., Pei H., Watson D.K., Papas T.S. (2000). EAP1/Daxx interacts with ETS1 and represses transcriptional activation of ETS1 target genes. Oncogene . 19 : 745—753. PMID 10698492 DOI :10.1038/sj.onc.1203385
Wasylyk C., Schlumberger S.E., Criqui-Filipe P., Wasylyk B. (2002). Sp100 interacts with ETS-1 and stimulates its transcriptional activity . Mol. Cell. Biol . 22 : 2687—2702. PMID 11909962 DOI :10.1128/MCB.22.8.2687-2702.2002
Russell L., Garrett-Sinha L.A. (2010). Transcription factor Ets-1 in cytokine and chemokine gene regulation. Cytokine . 51 : 217—226. PMID 20378371 DOI :10.1016/j.cyto.2010.03.006
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші