KLF5

KLF5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2EBT
Ідентифікатори
Символи	KLF5, BTEB2, CKLF, IKLF, Kruppel-like factor 5 (intestinal), Kruppel like factor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 602903 MGI: 1338056 HomoloGene: 37520 GeneCards: KLF5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • зв'язування з іоном металу; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor binding; • MRF binding;
Клітинна компонента	• комплекс Ґольджі; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • transcription regulator complex;
Біологічний процес	• regulation of microvillus assembly; • microvillus assembly; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • intestinal epithelial cell development; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • Ангіогенез; • skeletal muscle cell differentiation; • positive regulation of fat cell differentiation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound; • positive regulation of cell population proliferation; • cellular response to peptide; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • cell-cell signaling via exosome; • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; • регуляція експресії генів; • skeletal muscle satellite cell differentiation; • satellite cell activation involved in skeletal muscle regeneration; • myotube differentiation involved in skeletal muscle regeneration; • skeletal muscle tissue regeneration; • positive regulation of transcription by transcription factor localization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	688
	12224
	ENSG00000102554
	ENSMUSG00000005148
	Q13887
	Q9Z0Z7
	NM_001730; NM_001286818
	NM_009769
	NP_001273747; NP_001721
	NP_033899
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

KLF5 (англ. Kruppel like factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 457 амінокислот, а молекулярна маса — 50 792^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATRVLSMSA	RLGPVPQPPA	PQDEPVFAQL	KPVLGAANPA	RDAALFPGEE
LKHAHHRPQA	QPAPAQAPQP	AQPPATGPRL	PPEDLVQTRC	EMEKYLTPQL
PPVPIIPEHK	KYRRDSASVV	DQFFTDTEGL	PYSINMNVFL	PDITHLRTGL
YKSQRPCVTH	IKTEPVAIFS	HQSETTAPPP	APTQALPEFT	SIFSSHQTAA
PEVNNIFIKQ	ELPTPDLHLS	VPTQQGHLYQ	LLNTPDLDMP	SSTNQTAAMD
TLNVSMSAAM	AGLNTHTSAV	PQTAVKQFQG	MPPCTYTMPS	QFLPQQATYF
PPSPPSSEPG	SPDRQAEMLQ	NLTPPPSYAA	TIASKLAIHN	PNLPTTLPVN
SQNIQPVRYN	RRSNPDLEKR	RIHYCDYPGC	TKVYTKSSHL	KAHLRTHTGE
KPYKCTWEGC	DWRFARSDEL	TRHYRKHTGA	KPFQCGVCNR	SFSRSDHLAL
HMKRHQN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Shi H., Zhang Z., Wang X., Liu S., Teng C.T. (1999). Isolation and characterization of a gene encoding human Kruppel-like factor 5 (IKLF): binding to the CAAT/GT box of the mouse lactoferrin gene promoter. Nucleic Acids Res. 27: 4807—4815. PMID 10572182 DOI:10.1093/nar/27.24.4807
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6349 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13887 (англ.) . Архів оригіналу за 12 листопада 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 13

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6349 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q13887 (англ.) . Архів оригіналу за 12 листопада 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

KLF5

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук