CELSR1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
CELSR1
Ідентифікатори
Символи CELSR1, CDHF9, FMI2, HFMI2, ME2, ADGRC1, cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1, LMPHM9
Зовнішні ІД OMIM: 604523 MGI: 1100883 HomoloGene: 7665 GeneCards: CELSR1
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_014246
NM_001378328
NM_009886
RefSeq (білок)
NP_055061
NP_001365257
NP_034016
Локус (UCSC) Хр. 22: 46.36 – 46.54 Mb Хр. 15: 85.78 – 85.92 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CELSR1 (англ. Cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 014 амінокислот, а молекулярна маса — 329 486[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAPPPPPVLPVLLLLAAAAALPAMGLRAAAWEPRVPGGTRAFALRPGCTY
AVGAACTPRAPRELLDVGRDGRLAGRRRVSGAGRPLPLQVRLVARSAPTA
LSRRLRARTHLPGCGARARLCGTGARLCGALCFPVPGGCAAAQHSALAAP
TTLPACRCPPRPRPRCPGRPICLPPGGSVRLRLLCALRRAAGAVRVGLAL
EAATAGTPSASPSPSPPLPPNLPEARAGPARRARRGTSGRGSLKFPMPNY
QVALFENEPAGTLILQLHAHYTIEGEEERVSYYMEGLFDERSRGYFRIDS
ATGAVSTDSVLDRETKETHVLRVKAVDYSTPPRSATTYITVLVKDTNDHS
PVFEQSEYRERVRENLEVGYEVLTIRASDRDSPINANLRYRVLGGAWDVF
QLNESSGVVSTRAVLDREEAAEYQLLVEANDQGRNPGPLSATATVYIEVE
DENDNYPQFSEQNYVVQVPEDVGLNTAVLRVQATDRDQGQNAAIHYSILS
GNVAGQFYLHSLSGILDVINPLDFEDVQKYSLSIKAQDGGRPPLINSSGV
VSVQVLDVNDNEPIFVSSPFQATVLENVPLGYPVVHIQAVDADSGENARL
HYRLVDTASTFLGGGSAGPKNPAPTPDFPFQIHNSSGWITVCAELDREEV
EHYSFGVEAVDHGSPPMSSSTSVSITVLDVNDNDPVFTQPTYELRLNEDA
AVGSSVLTLQARDRDANSVITYQLTGGNTRNRFALSSQRGGGLITLALPL
DYKQEQQYVLAVTASDGTRSHTAHVLINVTDANTHRPVFQSSHYTVSVSE
DRPVGTSIATLSANDEDTGENARITYVIQDPVPQFRIDPDSGTMYTMMEL
DYENQVAYTLTIMAQDNGIPQKSDTTTLEILILDANDNAPQFLWDFYQGS
IFEDAPPSTSILQVSATDRDSGPNGRLLYTFQGGDDGDGDFYIEPTSGVI
RTQRRLDRENVAVYNLWALAVDRGSPTPLSASVEIQVTILDINDNAPMFE
KDELELFVEENNPVGSVVAKIRANDPDEGPNAQIMYQIVEGDMRHFFQLD
LLNGDLRAMVELDFEVRREYVLVVQATSAPLVSRATVHILLVDQNDNPPV
LPDFQILFNNYVTNKSNSFPTGVIGCIPAHDPDVSDSLNYTFVQGNELRL
LLLDPATGELQLSRDLDNNRPLEALMEVSVSDGIHSVTAFCTLRVTIITD
DMLTNSITVRLENMSQEKFLSPLLALFVEGVAAVLSTTKDDVFVFNVQND
TDVSSNILNVTFSALLPGGVRGQFFPSEDLQEQIYLNRTLLTTISTQRVL
PFDDNICLREPCENYMKCVSVLRFDSSAPFLSSTTVLFRPIHPINGLRCR
CPPGFTGDYCETEIDLCYSDPCGANGRCRSREGGYTCECFEDFTGEHCEV
DARSGRCANGVCKNGGTCVNLLIGGFHCVCPPGEYERPYCEVTTRSFPPQ
SFVTFRGLRQRFHFTISLTFATQERNGLLLYNGRFNEKHDFIALEIVDEQ
VQLTFSAGETTTTVAPKVPSGVSDGRWHSVQVQYYNKPNIGHLGLPHGPS
GEKMAVVTVDDCDTTMAVRFGKDIGNYSCAAQGTQTGSKKSLDLTGPLLL
GGVPNLPEDFPVHNRQFVGCMRNLSVDGKNVDMAGFIANNGTREGCAARR
NFCDGRRCQNGGTCVNRWNMYLCECPLRFGGKNCEQAMPHPQLFSGESVV
SWSDLNIIISVPWYLGLMFRTRKEDSVLMEATSGGPTSFRLQILNNYLQF
EVSHGPSDVESVMLSGLRVTDGEWHHLLIELKNVKEDSEMKHLVTMTLDY
GMDQNKADIGGMLPGLTVRSVVVGGASEDKVSVRRGFRGCMQGVRMGGTP
TNVATLNMNNALKVRVKDGCDVDDPCTSSPCPPNSRCHDAWEDYSCVCDK
GYLGINCVDACHLNPCENMGACVRSPGSPQGYVCECGPSHYGPYCENKLD
LPCPRGWWGNPVCGPCHCAVSKGFDPDCNKTNGQCQCKENYYKLLAQDTC
LPCDCFPHGSHSRTCDMATGQCACKPGVIGRQCNRCDNPFAEVTTLGCEV
IYNGCPKAFEAGIWWPQTKFGQPAAVPCPKGSVGNAVRHCSGEKGWLPPE
LFNCTTISFVDLRAMNEKLSRNETQVDGARALQLVRALRSATQHTGTLFG
NDVRTAYQLLGHVLQHESWQQGFDLAATQDADFHEDVIHSGSALLAPATR
AAWEQIQRSEGGTAQLLRRLEGYFSNVARNVRRTYLRPFVIVTANMILAV
DIFDKFNFTGARVPRFDTIHEEFPRELESSVSFPADFFRPPEEKEGPLLR
PAGRRTTPQTTRPGPGTEREAPISRRRRHPDDAGQFAVALVIIYRTLGQL
LPERYDPDRRSLRLPHRPIINTPMVSTLVYSEGAPLPRPLERPVLVEFAL
LEVEERTKPVCVFWNHSLAVGGTGGWSARGCELLSRNRTHVACQCSHTAS
FAVLMDISRRENGEVLPLKIVTYAAVSLSLAALLVAFVLLSLVRMLRSNL
HSIHKHLAVALFLSQLVFVIGINQTENPFLCTVVAILLHYIYMSTFAWTL
VESLHVYRMLTEVRNIDTGPMRFYYVVGWGIPAIVTGLAVGLDPQGYGNP
DFCWLSLQDTLIWSFAGPIGAVIIINTVTSVLSAKVSCQRKHHYYGKKGI
VSLLRTAFLLLLLISATWLLGLLAVNRDALSFHYLFAIFSGLQGPFVLLF
HCVLNQEVRKHLKGVLGGRKLHLEDSATTRATLLTRSLNCNTTFGDGPDM
LRTDLGESTASLDSIVRDEGIQKLGVSSGLVRGSHGEPDASLMPRSCKDP
PGHDSDSDSELSLDEQSSSYASSHSSDSEDDGVGAEEKWDPARGAVHSTP
KGDAVANHVPAGWPDQSLAESDSEDPSGKPRLKVETKVSVELHREEQGSH
RGEYPPDQESGGAARLASSQPPEQRKGILKNKVTYPPPLTLTEQTLKGRL
REKLADCEQSPTSSRTSSLGSGGPDCAITVKSPGREPGRDHLNGVAMNVR
TGSAQADGSDSEKP

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

[ред. | ред. код]
  • Wu Q., Maniatis T. (2000). Large exons encoding multiple ectodomains are a characteristic feature of protocadherin genes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 3124—3129. PMID 10716726 DOI:10.1073/pnas.97.7.3124
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1850 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-17 у Wayback Machine.]
  4. UniProt, Q9NYQ6 (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]