HTH
| پروتئین تنظیم‌کننده HTH در باکتری، خانوادهٔ lysR | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| شناسه‌ها | |||||||||
| نماد | HTH_1 | ||||||||
| پی‌فم | PF00126 | ||||||||
| پی‌فم clan | CL0123 | ||||||||
| اینترپرو | IPR000847 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00043 | ||||||||
| SCOPe | 1al3 / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
HTH یا مارپیچ-پیچ-مارپیچ (انگلیسی: Helix-turn-helix) یک موتیف ساختاری مهم در پروتئین‌هاست که قادر است به دی‌ان‌ای اتصال یابد.
این موتیف از دو مارپیچ آلفا تشکیل شده که توسط رشتهٔ کوتاهی از اسیدهای آمینه به هم متصل شده‌اند و در بسیاری از پروتئین‌هایی که در تنظیم بیان ژن دخالت دارند، دیده می‌شود. این موتیف را نباید با موتیف دیگری به نام HLH اشتباه گرفت.[۱]
این موتیف‌ها بر اساس ساختار و نحوهٔ قرارگیری فضاییِ مارپیچِ حلزونی‌شکل‌شان به چند زیرگروه تقسیم می‌شوند:[۲][۳][۴]
- دو حلقه‌ای
- سه حلقه‌ای
- چهار حلقه‌ای
- بالدار
- متفرقه
جستارهای وابسته
[ویرایش]منابع
[ویرایش]- ↑ Brennan RG, Matthews BW (1989). "The helix-turn-helix DNA binding motif". J Biol Chem. 264 (4): 1903–6. PMID 2644244.
- ↑ Wintjens R, Rooman M (1996). "Structural classification of HTH DNA-binding domains and protein-DNA interaction modes". J Mol Biol. 262 (2): 294–313. doi:10.1006/jmbi.1996.0514. PMID 8831795.
- ↑ Suzuki M, Brenner SE (1995). "Classification of multi-helical DNA-binding domains and application to predict the DBD structures of sigma factor, LysR, OmpR/PhoB, CENP-B, Rapl, and Xy1S/Ada/AraC". FEBS Lett. 372 (2–3): 215–21. doi:10.1016/0014-5793(95)00988-L. PMID 7556672.
- ↑ Aravind L, Anantharaman V, Balaji S, Babu MM, Iyer LM (2005). "The many faces of the helix-turn-helix domain: transcription regulation and beyond". FEMS Microbiol Rev. 29 (2): 231–62. doi:10.1016/j.femsre.2004.12.008. PMID 15808743.
- مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا. «Helix-turn-helix». در دانشنامهٔ ویکی‌پدیای انگلیسی، بازبینی‌شده در ۲۰ دسامبر ۲۰۱۷.
بیشتر بخوانید
[ویرایش]- Struhl K (1989). "Helix-turn-helix, zinc-finger, and leucine-zipper motifs for eukaryotic transcriptional regulatory proteins". Trends Biochem Sci. 14 (4): 137–40. doi:10.1016/0968-0004(89)90145-X. PMID 2499084.
- Gajiwala KS, Burley SK (2000). "Winged helix proteins". Curr Opin Struct Biol. 10 (1): 110–6. PMID 10679470.
- Santos CL, Tavares F, Thioulouse J, Normand P (2009). "A phylogenomic analysis of bacterial helix-turn-helix transcription factors". FEMS Microbiol Rev. 33 (2): 411–29. doi:10.1111/j.1574-6976.2008.00154.x. PMID 19076237.
- Hoskisson PA, Rigali S (2009). "Chapter 1: Variation in form and function the helix-turn-helix regulators of the GntR superfamily". Adv Appl Microbiol. 69: 1–22. doi:10.1016/S0065-2164(09)69001-8. PMID 19729089.
- Brennan RG (1993). "The winged-helix DNA-binding motif: another helix-turn-helix takeoff". Cell. 74 (5): 773–6. doi:10.1016/0092-8674(93)90456-Z. PMID 8374950.
- Huffman JL, Brennan RG (2002). "Prokaryotic transcription regulators: more than just the helix-turn-helix motif". Curr Opin Struct Biol. 12 (1): 98–106. doi:10.1016/s0959-440x(02)00295-6. PMID 11839496.
 | این یک مقالهٔ خرد زیست‌شناسی مولکولی است. می‌توانید با گسترش آن به ویکی‌پدیا کمک کنید. |