[go: up one dir, main page]

Idi na sadržaj

GHITM

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
GHITM
Identifikatori
AliasiGHITM
Vanjski ID-jeviMGI: 1913342 HomoloGene: 8667 GeneCards: GHITM
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 10 (čovjek)
Hrom.Hromosom 10 (čovjek)[1]
Hromosom 10 (čovjek)
Genomska lokacija za GHITM
Genomska lokacija za GHITM
Bend10q23.1Početak84,139,482 bp[1]
Kraj84,154,841 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 14 (miš)
Hrom.Hromosom 14 (miš)[2]
Hromosom 14 (miš)
Genomska lokacija za GHITM
Genomska lokacija za GHITM
Bend14 B|14 21.29 cMPočetak36,842,049 bp[2]
Kraj36,857,229 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
molekularna funkcija
Ćelijska komponenta Egzosom
membrana
integral component of membrane
mitochondrial inner membrane
mitohondrija
Biološki proces GO:0097285 apoptoza
GO:0022610 biološki proces
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_014394

NM_001199122
NM_078478
NM_001359902

RefSeq (bjelančevina)

NP_055209

NP_001186051
NP_510963
NP_001346831

Lokacija (UCSC)Chr 10: 84.14 – 84.15 MbChr 14: 36.84 – 36.86 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Transmembranski protein inducibilan hormonom rasta (GHITM), poznat i kao transmembranski motiv inhibitora BAX koji sadrži protein 5 (TMBIM5), je protein koji je kod ljudi kodiran genom GHITM na hromosomu 10.[5][6][7] Član je motiva BAX inhibitor koji sadrži (TMBIM) porodicu i lokaliziran na unutrašnjoj mitohondrijskoj membrani (IMM), kao i endoplazmatskom retikulumu (ER), gdje ima ulogu u apoptozama, posredstvom mitohondrija i morfologije i oslobađanja citohroma C.[8][9] Putem apoptozne funkcije, GHITM može biti uključen u tumorske metastaze i urođene antivirusne reakcije.[10][11]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 345 aminokiselina, а molekulska težina 37.205 Da.[12]

1020304050
MLAARLVCLRTLPSRVFHPAFTKASPVVKNSITKNQWLLTPSREYATKTR
IGIRRGRTGQELKEAALEPSMEKIFKIDQMGRWFVAGGAAVGLGALCYYG
LGLSNEIGAIEKAVIWPQYVKDRIHSTYMYLAGSIGLTALSAIAISRTPV
LMNFMMRGSWVTIGVTFAAMVGAGMLVRSIPYDQSPGPKHLAWLLHSGVM
GAVVAPLTILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGV
GLGLVFVSSLGSMFLPPTTVAGATLYSVAMYGGLVLFSMFLLYDTQKVIK
RAEVSPMYGVQKYDPINSMLSIYMDTLNIFMRVATMLATGGNRKK

Struktura

[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen kodira protein od 37 kDa koji navodno sadrži šest do osam transmembranskih domena. Kao član porodice TMBIM, GHITM dijeli transmembranski BAX inhibicijski motiv, poluhidrofobni transmembranski domen i sličnu tercijarnu strukturu s ostalih pet članova. Međutim, za razliku od drugih članova, GHITM ima jedinstveni kiseli (D) umjesto bazni) (H ili R) u blizini svog drugog transmembranskog domena, kao i dodatni transmembranski domen, koji nakon cijepanje iza ostatka 57 (SREY| A) signalizira lokalizaciju na IMM.[8][9][10] Bez obzira na to, moguće je da je rascjep na različitim mjestima (motiv sličan XXRR (LAAR) u N-terminalu i motiv sličan KKXX (GNRK) u C-terminalu) ili alternativna prerada mogu objasniti uočenu lokalizaciju proteina u ER.[9][10]

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

GHITM je mitohondrijski protein i član je porodice TMBIM i potporodice inhibitora BAX-1 (BI1).[8][9] Sveprisutno je eksprimiran, ali ga posebno ima u velikom broju u tkivu organa kao što su mozak, srce, jetra, bubreg i skeletni mišići i rijetki u crijevima i timusu.[9] Ovaj protein se posebno lokalizira u IMM-u, gdje regulira apoptozu, putem dva odvojena procesa:

  • (1) BAX-neovisno upravljanje mitohondrijskom morfologijom i
  • (2) oslobađanje citohroma C.
    U prvom procesu, GHITM održava organizaciju krista, a njegova podregulacija dovodi do mitohondrijske fragmentacije, vjerovatno induciranjem spajanja struktura krista, što dovodi do oslobađanja proapoptoznih proteina, kao što je citokrom c, Smac i Htra2. U drugom procesu, GHITM je odgovoran za umrežavanje citohroma c s IMM-om, a povećana regulacija GHITM-a povezana je s odgođenim oslobađanjem citohroma c, bez obzira na vanjsku mitohondrijsku membranu permeabilizaciju. Dakle, GHITM kontrolira oslobađanje citohroma C iz mitohondrija i potencijalno može ometati apoptotski proces radi podsticanja preživljavanja ćelija.[8][9] Štaviše, GHITM može dalje imati ulogu u apoptozi, održavanjem homeostaze kalcijskog iona u ER. Međutim, dok prekomjerna ekspresija drugih proteina TMBIM -a pokazuje antiapoptozne učinke, smanjujući koncentracije iona kalcija, čime se sprječava preopterećenje mitohondrijskim ionima kalcija, depolarizacija, gubitak ATP, reaktivne vrste kisika , oslobađanje citohroma c, i na kraju, ćelijska smrt, prekomjerna ekspresija GHITM-a proizvodi suprotan učinak.[9]

Klinički značaj

[uredi | uredi izvor]

GHITM može biti uključen u metastaze tumora interakcijom s proteinima porodice Bcl-2 za regulaciju apoptoze.[10][11] Njegova uloga apoptotskog regulatora također ga može povezati s urođenim antivirusnim odgovorima.[11] Također je primijećeno da prekomjerna ekspresija GHITM -a ubrza proces starenja u HIV-inficiranih pacijenata.[13]

Interakcije

[uredi | uredi izvor]

Pokazano je da GHITM ima interakcije sa citohromom C.[8]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000165678 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000041028 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (Apr 1996). "A "double adaptor" method for improved shotgun library construction". Analytical Biochemistry. 236 (1): 107–13. doi:10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
  6. ^ Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (Apr 1997). "Large-scale concatenation cDNA sequencing". Genome Research. 7 (4): 353–8. doi:10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
  7. ^ "Entrez Gene: GHITM growth hormone inducible transmembrane protein".
  8. ^ a b c d e Oka T, Sayano T, Tamai S, Yokota S, Kato H, Fujii G, Mihara K (Jun 2008). "Identification of a novel protein MICS1 that is involved in maintenance of mitochondrial morphology and apoptotic release of cytochrome c". Molecular Biology of the Cell. 19 (6): 2597–608. doi:10.1091/mbc.E07-12-1205. PMC 2397309. PMID 18417609.
  9. ^ a b c d e f g Lisak DA, Schacht T, Enders V, Habicht J, Kiviluoto S, Schneider J, Henke N, Bultynck G, Methner A (Sep 2015). "The transmembrane Bax inhibitor motif (TMBIM) containing protein family: Tissue expression, intracellular localization and effects on the ER CA(2+)-filling state". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research. 1853 (9): 2104–14. doi:10.1016/j.bbamcr.2015.03.002. PMID 25764978.
  10. ^ a b c d Zhou J, Zhu T, Hu C, Li H, Chen G, Xu G, Wang S, Zhou J, Ma D (Jun 2008). "Comparative genomics and function analysis on BI1 family". Computational Biology and Chemistry. 32 (3): 159–62. doi:10.1016/j.compbiolchem.2008.01.002. PMID 18440869.
  11. ^ a b c Li S, Wang L, Berman M, Kong YY, Dorf ME (Sep 2011). "Mapping a dynamic innate immunity protein interaction network regulating type I interferon production". Immunity. 35 (3): 426–40. doi:10.1016/j.immuni.2011.06.014. PMC 3253658. PMID 21903422.
  12. ^ "UniProt, Q9H3K2". Pristupljeno 2. 9. 2021.
  13. ^ Moni MA, Liò P (24. 10. 2014). "Network-based analysis of comorbidities risk during an infection: SARS and HIV case studies". BMC Bioinformatics. 15: 333. doi:10.1186/1471-2105-15-333. PMC 4363349. PMID 25344230.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]