司令官（しれいかん、Commander）とは、主に陸軍なら「軍」以上、海軍なら「艦隊」以上等、ある程度の大きな規模を有する単位の部隊（部隊#部隊の単位や近代陸軍の編制#部隊の単位等参照）を指揮する指揮官（部隊長、長）に充てられる役職。 軍隊制度を採るキリスト教会の救世軍は、各軍国（管区）の最高責任者を「司令官」と称している。