RefSeq
| RefSeq | ||||
|---|---|---|---|---|
| ||||
| Type | databank | |||
| Taal | Engels | |||
| Eigenaar | National Center for Biotechnology Information (NCBI) | |||
| Status | actief | |||
| Link | Officiële website | |||
| ||||
RefSeq is een vrij toegankelijke databank waarin geannoteerde nucleotidesequenties (van DNA, RNA) en bijbehorende eiwitproducten zijn geïndexeerd.[1] De database wordt beheerd door National Center for Biotechnology Information. In tegenstelling tot GenBank is elk macromolecuul slechts één keer in de datase opgenomen: RefSeq is dus niet-redundant, waardoor het een relatief kleine zoekruimte heeft.
RefSeq probeert voor elk modelorganisme een afzonderlijke opname te maken van het genomisch DNA, de RNA-transcripten en de eiwitten die uit die transcripten voortkomen. RefSeq beperkt zich tot belangrijke organismen waarvoor voldoende gegevens beschikbaar zijn. In 2019 waren dit er ongeveer 97 duizend.[2] Bij GenBank worden van elk ingediend organisme de sequenties opgenomen: ongeveer 250 duizend verschillende organismen.
Zie ook
[bewerken | brontekst bewerken]Externe link
[bewerken | brontekst bewerken]Bronnen
- ↑ (en) Pruitt KD, Tatusova T, Maglott DR (2005). NCBI Reference Sequence (RefSeq): a curated non-redundant sequence database of genomes, transcripts and proteins.. Nucleic Acids Res 33 (Database issue): D501-4. PMID 15608248. PMC 539979. DOI: 10.1093/nar/gki025.
- ↑ RefSeq Release 80 Statistics. National Library of Medicine (2017). Geraadpleegd op 23 december 2019.