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ChEBI

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ChEBI(영어: Chemical Entities of Biological Interest)[1][2]유럽 생물정보학 연구소(EBI)의 개방형 생물학 및 생물의학 온톨로지 파운드리 노력의 일부인 '작은' 화합물에 초점을 맞춘 분자 개체화학 데이터베이스온톨로지이다. "분자 개체"라는 용어는 "개별적으로 구별할 수 있는 실체로서 식별이 가능한, 구성적으로나 동위원소적으로 구별되는 원자, 분자, 이온, 이온쌍, 라디칼, 라디칼 이온, 배위 화합물, 입체구조 등"을 지칭한다.[3] 분자 개체는 잠재적인 생물 활성이 있는 천연 산물 또는 합성 산물이다. 단백질 분해 절단에 의해 단백질로부터 파생된 핵산, 단백질, 및 펩타이드와 같이 게놈에 의해 직접적으로 인코딩된 분자들은 일반적으로 ChEBI에 포함되지 않는다.

같이 보기

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각주

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  1. de Matos P, Alcántara R, Dekker A, Ennis M, Hastings J, Haug K, Spiteri I, Turner S, Steinbeck C (2010). “Chemical Entities of Biological Interest: an update”. 《Nucleic Acids Research》 38 (Database issue): D249–54. doi:10.1093/nar/gkp886. PMC 2808869. PMID 19854951. 
  2. Degtyarenko K, de Matos P, Ennis M, Hastings J, Zbinden M, McNaught A, Alcántara R, Darsow M, Guedj M, Ashburner M (2008). “ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest”. 《Nucleic Acids Research》 36 (Database issue): D344–50. doi:10.1093/nar/gkm791. PMC 2238832. PMID 17932057. 
  3. IUPAC, Compendium of Chemical Terminology, 2nd ed. (the "Gold Book") (1997). 온라인 수정 버전: (2006–) "molecular entity". doi 10.1351/goldbook.M03986