ファイル:3G6O.pdb.jpg

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概要

解説

Phytochrome

日付

4/12/2011

原典

Jmol

作者

Jmol Development Team

許可
(ファイルの再利用)

このスクリーンショットは、著作権保護の対象となる部分を含んでいないか、著作権のあるソフトウェアの映像を含んでいないか、または作者が（この通知の下に示されるべき）フリーなライセンスの下でそれをリリースしています。そして、それはウィキメディア・コモンズのスクリーンショットについてのライセンスガイドラインに従っています。あなたはその特定のライセンスにしたがって自由にこの作品を使用することができます。 フリーソフトウェアライセンス：

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ライセンス

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	Attribution

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	日付と時刻	サムネイル	寸法	利用者	コメント
現在の版	2011年4月12日 (火) 22:00		1,276 × 661 (167キロバイト)	Crickets20	{{Information \|Description= Phytochrome \|Source= Jmol \|Date= 4/12/2011 \|Author= Jmol Development Team \|Permission={{free screenshot\|license={{GPL}}}} \|other_versions= }}

ファイルの使用状況

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発芽

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- صبغة نباتية
bs.wikipedia.org での使用状況
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- Phytochrome
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- Fitocromo
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- Fytochroom
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- Фитохром
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- 光敏素
- Talk:光敏素

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JPEGファイルのコメント

/****** Jmol Embedded Script ****

Jmol state version 12.0.40 2011-02-04 14:47;

function _setWindowState() {

height 661;
width 1276;

 stateVersion = 1200040;
 background [xffffff];
 axis1Color = "[xff0000]";
 axis2Color = "[x008000]";
 axis3Color = "[x0000ff]";
 set ambientPercent 45;
 set diffusePercent 84;
 set specular true;
 set specularPercent 22;
 set specularPower 40;
 set specularExponent 6;
 set zShadePower 1;
 statusReporting  = true;

}

function _setFileState() {

 set allowEmbeddedScripts false;
 set appendNew true;
 set appletProxy "";
 set applySymmetryToBonds false;
 set autoBond true;
 set bondRadiusMilliAngstroms 150;
 set bondTolerance 0.45;
 set defaultLattice {0.0 0.0 0.0};
 set defaultLoadFilter "";
 set defaultLoadScript "";
 set defaultVDW Auto;
 set forceAutoBond false;
 #set defaultDirectory "C:/Program Files/Mozilla Firefox";
 #set loadFormat "http://www.rcsb.org/pdb/files/%FILE.pdb.gz%22;
 #set smilesUrlFormat "http://cactus.nci.nih.gov/chemical/structure/%FILE/file?format=sdf&get3d=True%22;
 #set edsUrlFormat "http://eds.bmc.uu.se/eds/dfs/%LC13/%LCFILE/%LCFILE.omap%22;
 #set edsUrlCutoff "load('http://eds.bmc.uu.se/eds/dfs/%LC13/%LCFILE/%LCFILE.sfdat').lines.find('MAP_SIGMA').split(' ')[2]";
 set legacyAutoBonding false;
 set minBondDistance 0.4;
 set minimizationCriterion  0.0010;
 set minimizationSteps  100;
 set pdbGetHeader false;
 set pdbSequential false;
 set percentVdwAtom 23;
 set smallMoleculeMaxAtoms 40000;
 set smartAromatic true;
 load auto /*file*/"./3G6O.pdb.gz";

}

function _setVariableState() {

  set defaultanglelabel "%VALUE %UNITS";
  set defaultcolorscheme "Jmol";
  set defaultdistancelabel "%VALUE %UNITS";
  set defaultdrawarrowscale 0.5;
  set defaultlattice "{0 0 0}";
  set defaultloadfilter "";
  set defaultloadscript "";
  set defaulttorsionlabel "%VALUE %UNITS";
  set defaulttranslucent 0.5;
  set defaultvdw "Auto";
 set allowembeddedscripts true;
 set allowrotateselected false;
 set appletproxy "";
 set applysymmetrytobonds false;
 set atompicking true;
 set atomtypes "";
 set autobond true;
 set autofps false;
 set axes window;
 set axesmode 0;
 set axesscale 2.0;
 set bondmodeor false;
 set bondradiusmilliangstroms 150;
 set bondtolerance 0.45;
 set cartoonbaseedges false;
 set cartoonrockets false;
 set chaincasesensitive false;
 set dataseparator "~~~";
 set defaultstructuredssp true;
 set delaymaximumms 0;
 set dipolescale 1.0;
 set disablepopupmenu false;
 set displaycellparameters true;
 set dotdensity 3;
 set dotscale 1;
 set dotsselectedonly false;
 set dotsurface true;
 set dragselected false;
 set drawhover false;
 set drawpicking false;
 set dsspcalculatehydrogenalways true;
 set dynamicmeasurements false;
 set ellipsoidarcs false;
 set ellipsoidaxes false;
 set ellipsoidaxisdiameter 0.02;
 set ellipsoidball true;
 set ellipsoiddotcount 200;
 set ellipsoiddots false;
 set ellipsoidfill false;
 set forceautobond false;
 set fractionalrelative false;
 set gestureswipefactor 1.0;
 set greyscalerendering false;
 set hbondsangleminimum 90.0;
 set hbondsbackbone false;
 set hbondsdistancemaximum 3.25;
 set hbondsrasmol true;
 set hbondssolid false;
 set helixstep 1;
 set helppath "http://chemapps.stolaf.edu/jmol/docs/index.htm%22;
 set hermitelevel 0;
 set hidenameinpopup false;
 set hidenavigationpoint false;
 set highresolution false;
 set historylevel 0;
 set hoverdelay 0.5;
 set imagestate true;
 set iskiosk false;
 set isosurfacepropertysmoothing true;
 set justifymeasurements false;
 set loadatomdatatolerance 0.01;
 set measureallmodels false;
 set measurementlabels true;
 set messagestylechime false;
 set minbonddistance 0.4;
 set minimizationcriterion 0.0010;
 set minimizationrefresh true;
 set minimizationsilent false;
 set minimizationsteps 100;
 set monitorenergy false;
 set multiplebondradiusfactor 0.0;
 set multiplebondspacing -1.0;
 set navigatesurface false;
 set navigationperiodic false;
 set navigationspeed 5.0;
 set pdbgetheader false;
 set pdbsequential false;
 set percentvdwatom 23;
 set pickingspinrate 10;
 set picklabel "";
 set pointgroupdistancetolerance 0.2;
 set pointgrouplineartolerance 8.0;
 set propertyatomnumbercolumncount 0;
 set propertyatomnumberfield 0;
 set propertycolorscheme "roygb";
 set propertydatacolumncount 0;
 set propertydatafield 0;
 set quaternionframe "p";
 set rangeselected false;
 set ribbonaspectratio 16;
 set ribbonborder false;
 set rocketbarrels false;
 set saveproteinstructurestate true;
 set selectallmodels true;
 set selecthetero true;
 set selecthydrogen true;
 set sheetsmoothing 1.0;
 set showhiddenselectionhalos false;
 set showhydrogens true;
 set showkeystrokes true;
 set showmeasurements true;
 set showmultiplebonds true;
 set shownavigationpointalways false;
 set slabbyatom false;
 set slabbymolecule false;
 set smallmoleculemaxatoms 40000;
 set smartaromatic true;
 set solventprobe false;
 set solventproberadius 1.2;
 set ssbondsbackbone false;
 set stereodegrees -5;
 set strandcountformeshribbon 7;
 set strandcountforstrands 5;
 set strutdefaultradius 0.3;
 set strutlengthmaximum 7.0;
 set strutsmultiple false;
 set strutspacing 6;
 set testflag1 false;
 set testflag2 false;
 set testflag3 false;
 set testflag4 false;
 set tracealpha true;
 set usearcball false;
 set useminimizationthread true;
 set usenumberlocalization true;
 set vectorscale 1.0;
 set vibrationscale 0.5;
 set wireframerotation false;
 set zoomlarge true;

label defaults;

 select none;
 color label none;
 background label none;
 set labelOffset 4 4;
 set labelAlignment left;
 set labelPointer off;
 font label 13.0 SansSerif Plain;

}

function _setModelState() {

 select ({0:7511});
 color atoms opaque [x0000ff];
 Spacefill 0.0;
 select BONDS ({0:7698});
 wireframe 0.0;

 measures delete;
 select *; set measures nanometers;
 font measures 15.0 SansSerif Plain;

 select ({0:7337});
 Cartoon on;
 select ({2737:2823 6409:6495});
 color Cartoon opaque [xfff000];
 select ({385:487 4051:4153});
 color Cartoon opaque [x0080ff];
 select ({2214:2323 5886:5995});
 color Cartoon opaque [xa0ff00];
 select ({2643:2736 6315:6408});
 color Cartoon opaque [xffff00];
 select ({0:111 3666:3777});
 color Cartoon opaque [x0000ff];
 select ({3359:3465 7031:7137});
 color Cartoon opaque [xff4000];
 select ({2921:3034 6593:6706});
 color Cartoon opaque [xffc000];
 select ({2110:2213 5782:5885});
 color Cartoon opaque [x80ff00];
 select ({1695:1801 5361:5467});
 color Cartoon opaque [x00ff00];
 select ({1568:1694 5234:5360});
 color Cartoon opaque [x00ff20];
 select ({1104:1236 4770:4902});
 color Cartoon opaque [x00ffa0];
 select ({112:200 3778:3866});
 color Cartoon opaque [x0020ff];
 select ({488:583 4154:4249});
 color Cartoon opaque [x00a0ff];
 select ({2324:2424 5996:6096});
 color Cartoon opaque [xc0ff00];
 select ({1454:1567 5120:5233});
 color Cartoon opaque [x00ff40];
 select ({1008:1103 4674:4769});
 color Cartoon opaque [x00ffc0];
 select ({3263:3358 6935:7030});
 color Cartoon opaque [xff6000];
 select ({2824:2920 6496:6592});
 color Cartoon opaque [xffe000];
 select ({805:905 4471:4571});
 color Cartoon opaque [x00ffff];
 select ({1343:1453 5009:5119});
 color Cartoon opaque [x00ff60];
 select ({906:1007 4572:4673});
 color Cartoon opaque [x00ffe0];
 select ({1802:1908 5468:5574});
 color Cartoon opaque [x20ff00];
 select ({201:292 3867:3958});
 color Cartoon opaque [x0040ff];
 select ({584:688 4250:4354});
 color Cartoon opaque [x00c0ff];
 select ({1237:1342 4903:5008});
 color Cartoon opaque [x00ff80];
 select ({3137:3262 6809:6934});
 color Cartoon opaque [xff8000];
 select ({2536:2642 6208:6314});
 color Cartoon opaque [xf0f000];
 select ({3566:3665 7238:7337});
 color Cartoon opaque [xff0000];
 select ({2425:2535 6097:6207});
 color Cartoon opaque [xe0ff00];
 select ({293:384 3959:4050});
 color Cartoon opaque [x0060ff];
 select ({689:804 4355:4470});
 color Cartoon opaque [x00e0ff];
 select ({2023:2109 5689:5781});
 color Cartoon opaque [x60ff00];
 select ({1909:2022 5575:5688});
 color Cartoon opaque [x40ff00];
 select ({3466:3565 7138:7237});
 color Cartoon opaque [xff2000];
 select ({3035:3136 6707:6808});
 color Cartoon opaque [xffa000];

 boundBox off;
 font boundBox 14.0 SansSerif Plain;
 boundBox off;

 unitcell off;
 font unitcell 14.0 SansSerif Plain;
 unitcell off;

 hover "%U";

 frank on;
 font frank 16.0 SansSerif Bold;
 select *;

}

function _setPerspectiveState() {

 set perspectiveModel 11;
 set scaleAngstromsPerInch 0.0;
 set perspectiveDepth true;
 set visualRange 5.0;
 set cameraDepth 3.0;
 boundbox corners {-17.746002 -4.0719986 -11.239999} {88.31801 97.27599 42.965004} # volume = 582669.8;
 center {35.286003 46.601997 15.862502};
 moveto -1.0 {0 0 1 0} 100.0 0.0 0.09 {35.286003 46.601997 15.862502} 59.717693 {0.0 0.0 0.0} 0.0 0.0 0.0;
 save orientation "default";
 moveto 0.0 { 424 749 -509 145.1} 90.0 0.0 0.0 {35.286003 46.601997 15.862502} 59.717693 {0.0 0.0 0.0} -20.237387 7.6194544 0.0;;
 slab 100;depth 0;
 set spinX 0; set spinY 30; set spinZ 0; set spinFps 30;  set navX 0; set navY 0; set navZ 0; set navFps 10;

}

function _setSelectionState() {

 select ({0:7511});
 set hideNotSelected false;

}

function _setState() {

 initialize;
 set refreshing false;
 _setWindowState;
 _setFileState;
 _setVariableState;
 _setModelState;
 _setPerspectiveState;
 _setSelectionState;
 set refreshing true;
 set antialiasDisplay false;
 set antialiasTranslucent true;
 set antialiasImages true;

}

_setState;

- /

ファイル:3G6O.pdb.jpg

概要

ライセンス

キャプション

このファイルに描写されている項目

題材

著作権の状況

著作権で保護

利用許諾

GPL 2.0かそれ以降

attribution only license ^英語

メディアタイプ

image/jpeg

チェックサム

fe124e04989d61f5b640d3401a5ffd31ac5214a2

データサイズ

170,951 バイト

全高

661 ピクセル

全幅

1,276 ピクセル

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ファイルの使用状況

グローバルなファイル使用状況

メタデータ

概要

ライセンス

キャプション

このファイルに描写されている項目

attribution only license 英語

image/jpeg

fe124e04989d61f5b640d3401a5ffd31ac5214a2

170,951 バイト

661 ピクセル

1,276 ピクセル

ファイルの履歴

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メタデータ

attribution only license ^英語