Coincide geograficamente con il bacino del Nilo Bianco, dalle Montagne di Nuba a quelle ugandesi e dallo spartiacque Nilo-Congo ai contrafforti etiopici.

Il 26 maggio 1871 Samuel White Baker proclamò a Gondokoro l'annessione all'Egitto delle terre a sud del 12º parallelo, battezzandole con il nome di Equatoria.

Gondokoro, nei pressi dell'attuale Juba, fu fondata nel 1851 da religiosi austriaci, che vi insediarono una missione. Fu il primo avamposto conosciuto sul Nilo a monte delle paludi del Sudd.

Durante la rivolta del Mahdi (1881-1889) tale regione si trovò distaccata dal resto del Sudan in rivolta.

• Roberto Pattarin e Roberto Salgo, Equatoria 12º parallelo. Sud Sudan tra passato e presente, Silvana Editoriale, Cinisello Balsamo (MI), 2008

• Giuba — Capitale del paese.
• Nimule — Immediatamente a nord del confine con l'Uganda.
• Torit — Capitale dello stato dell'Equatoria Orientale.
• Yambio — Capitale del governatorato dell'Equatoria occidentale, situata vicino al confine con il Repubblica Democratica del Congo.
• Magwi — Situata nei pressi del confine con l'Uganda.
• Parjok — Situata a 39 km a sud di Magwi, nei pressi del confine con l'Uganda.
• Narus — Situata nei pressi del confine col Kenya.
• Ikotos —
• Chukudum —

• Parco nazionale di Bandingilo — Territorio in prevalenza paludoso.