Paleovirologi

Paleovirologi adalah studi tentang virus yang ada di masa lalu tetapi sekarang sudah punah. Secara umum, virus tidak dapat meninggalkan fosil fisik, oleh karena itu bukti tidak langsung digunakan untuk merekonstruksi masa lalu. Sebagai contoh, virus dapat menyebabkan evolusi inang mereka, dan tanda tangan evolusi itu dapat ditemukan dan ditafsirkan di masa sekarang. Juga, beberapa fragmen genetik virus yang diintegrasikan ke dalam sel germline dari organisme purba telah diturunkan ke zaman kita sebagai fosil virus, atau elemen virus endogen (EVE). EVE yang berasal dari integrasi retrovirus dikenal sebagai retrovirus endogen, dan sebagian besar fosil virus adalah ERV. Mereka dapat melestarikan kode genetik dari jutaan tahun yang lalu, karenanya terminologi "fosil", meskipun tidak ada yang mendeteksi virus dalam fosil mineral. Fosil virus yang paling mengejutkan berasal dari virus DNA dan RNA non-retroviral.^[1]

Meskipun tidak ada sistem klasifikasi formal untuk EVE, mereka dikategorikan menurut taksonomi asal virus mereka. Memang, semua tipe genom virus yang dikenal dan strategi replikasi, seperti yang didefinisikan oleh klasifikasi Baltimore, telah ditemukan dalam catatan fosil genom. Akronim telah dirancang untuk menggambarkan berbagai jenis fosil virus.^[2]

• Unsur virus endogen
• Retrovirus endogen
• Retnovirus Endogen Manusia
• Fosil virus yang berasal dari virus RNA non-retroviral telah disebut Non-retroviral Integrated RNA Virus atau NIRVs. Tidak seperti jenis lain dari fosil virus, pembentukan NIRV memerlukan pinjaman mesin integrasi yang dikodekan oleh genom inang atau oleh retrovirus yang menularkan bersama.^[3]

Fosil virus lain berasal dari virus DNA seperti hepadnavirus (kelompok yang memasukkan hepatitis B).^[4]

Upaya yang berhasil untuk "menghidupkan kembali" virus yang punah dari fosil DNA telah dilaporkan.^[5]

• DNA purba
• Proyek Genom Manusia
• Mikropaleontologi