FOXP1

FOXP1
Structures disponibles
PDB	Recherche UniProt humaine: PDBe RCSB
Identifiants PDB
	2KIU
Identifiants
Aliases	FOXP1
IDs externes	OMIM: 605515 HomoloGene: 136512 GeneCards: FOXP1
Position du gène (Homme)
Chr.	Chromosome 3 humain
Fin	71,583,978 bp
Expression génétique
	Fortement exprimé dans
	pancreatic ductal cell; ; cardia; ; Veine saphène; ; pylore; ; mucosa of ileum; ; péricarde; ; urètre; ; buccal mucosa cell; ; epithelium of lactiferous gland; ; canal galactophore;
	n/a
	Plus de données d'expression de référence
	n/a
Gene Ontology
Fonction moléculaire	liaison ion métal; sequence-specific DNA binding; protein self-association; androgen receptor binding; DNA-binding transcription factor activity; liaison ADN; liaison protéique; identical protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; liaison de chromatine; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; transcription factor binding; protein homodimerization activity; protein heterodimerization activity;
Composant cellulaire	noyau; nucléoplasme; cytoplasme;
Processus biologique	regulation of monocyte differentiation; negative regulation of androgen receptor signaling pathway; negative regulation of B cell apoptotic process; positive regulation of endothelial cell migration; transcription, DNA-templated; response to lipopolysaccharide; regulation of defense response to bacterium; endothelial cell activation; regulation of endothelial tube morphogenesis; macrophage activation; osteoclast development; positive regulation of smooth muscle cell proliferation; T follicular helper cell differentiation; regulation of macrophage colony-stimulating factor production; regulation of tumor necrosis factor production; regulation of inflammatory response; osteoclast differentiation; monocyte activation; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II; somatic stem cell population maintenance; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; in utero embryonic development; positive regulation of mesenchymal cell proliferation; pre-B cell differentiation; positive regulation of immunoglobulin production; développement du cœur; skeletal muscle tissue development; motor neuron axon guidance; ventral spinal cord development; striatum development; développement des poumons; forebrain development; immunoglobulin V(D)J recombination; response to testosterone; sarcomere organization; régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; smooth muscle tissue development; positive regulation of epithelial cell proliferation; cardiac muscle cell differentiation; regulation of cardiac muscle cell proliferation; negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development; lung secretory cell differentiation; cellular response to tumor necrosis factor; innate vocalization behavior; regulation of action potential; regulation of lung goblet cell differentiation; negative regulation of lung goblet cell differentiation; cellular response to ionomycin; positive regulation of hydrogen peroxide-induced cell death; positive regulation of cardiac muscle cell differentiation; cellular response to DNA damage stimulus; negative regulation of gene expression; positive regulation of B cell receptor signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
	27086
	n/a
	ENSG00000114861
	n/a
	Q9H334
	n/a
NM_001012505; NM_001244808; NM_001244810; NM_001244812; NM_001244813;
	NM_001244814; NM_001244815; NM_001244816; NM_032682; NM_001349338; NM_001349340; NM_001349341; NM_001349342; NM_001349343; NM_001349344; NM_001349337; NM_001370548
	n/a
NP_001012523; NP_001231737; NP_001231739; NP_001231741; NP_001231742;
	NP_001231743; NP_001231744; NP_001231745; NP_116071; NP_001336267; NP_001336269; NP_001336270; NP_001336271; NP_001336272; NP_001336273; NP_001336266
	n/a
	Wikidata
Voir/Editer Humain

Forkhead box protein P1 est une protéine qui chez l'humain est codée par le gène FOXP1. FOXP1 est nécessaire au bon développement du cerveau, du cœur et des poumons chez les mammifères ^[3]^,^[4]^,^[5]. C'est un facteur de transcription de la famille Forkead Box (FOX).

Gène FOXP1

Le gène est localisé sur le chromosome 3 en position p13 (3p13) chez l’humain (localisation précise 3:70,954,713-71,583,988). FOXP1 est un grand gène (629,297 paires de bases) contenant 21 exons. L’épissage alternatif de l’ARN pré-messager résulte en plusieurs isoformes (c’est-à-dire variants) possibles de la protéine.

Protéine Foxp1

Structure et fonction

Foxp1 est un facteur de transcription de la famille FOX (Forkhead box). Les facteurs de transcription FOX jouent un rôle important dans la régulation (principalement répressive) de l’expression d’autres gènes durant le développement et à l’age adulte. Le niveau de cette régulation varie d’un tissu et d’un type de cellules à l’autre. FOXP1 contient un site de liaison à l’ADN et la capacité de se lier à d’autres protéines, notamment FOXP2 et FOXP3^[6]. C’est sous forme de dimère que ces protéines se lient à leurs cibles ADN. La protéine FOXP1 reconnait la séquence TATTT(G/A)T ^[7].

Cibles de Foxp1

Plusieurs gènes de pluripotence sont sous le contrôle d’une isoforme particulière de Foxp1 : l’expression de gènes de pluripotence (tels qu’OCT4, NANOG, NR5A2, et GDF3) sont stimulées, alors que l’expression de gènes promouvant la différenciation cellulaire sont réprimés.

Foxp1 contrôle l'expression de CNTNAP2, un gène codant une protéine neuronale impliquée dans l'interaction entre les neurones et cellules gliales, et le regroupement de canaux potassiques dans les axones myélinisés.

Rôle chez l'humain et pathologies associées

FOXP1 participe au développement de plusieurs organes : les poumons, le cœur, le thymus et le cerveau.

Développement musculaire

Dans le cœur, FOXP1 régule la maturation et la prolifération des cardiomyocites (ref), promeut la séparation de l’artère et l’aorte pulmonaire (ref), et régule l’expression de Sox4 dans le myocarde et l’endocardial cushions qui sépare ventricule gauche et droit (ref). Des embryons de souris foxp1-/- (délétion homozygote) présentent de sévères problèmes de développement cardiaque (ref).

FOXP1 participe au développement des muscles et de l’épithélium de l’œsophage (ref).

Développement pulmonaire

Développement du système nerveux

FOXP1 est impliqué dans le développement du système nerveux^[8]. L'étude d'une cohorte de 1523 patients atteints de déficiences intellectuelles a révélé 3 cas de délétion hétérozygote (d'une seule des deux copies) du gène ^[9]. L'étude de dix patients porteurs d'une délétion hétérozygote révèle un déficit dans l'acquisition du langage et de la marche, ainsi qu'une prédisposition aux troubles du spectre de l'autisme ^[10]

Cancer

L'inactivation du gène FOXP1 à l'état homozygote prédispose au cancer du sein ^[11]. Au contraire, il est suspecté qu'une sur-expression de FOXP1 favorise les leucémies ^[12]^,^[13].

Notes et références

↑ ^{a b et c} GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000114861 - Ensembl, May 2017
↑ « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
↑ Bin Wang, Joel Weidenfeld, Min Min Lu et Shanna Maika, « Foxp1 regulates cardiac outflow tract, endocardial cushion morphogenesis and myocyte proliferation and maturation », Development (Cambridge, England), vol. 131,‎ 1^er septembre 2004, p. 4477–4487 (ISSN 0950-1991, PMID 15342473, DOI 10.1242/dev.01287, lire en ligne, consulté le 15 avril 2016)
↑ Jeremy S. Dasen, Alessandro De Camilli, Bin Wang et Philip W. Tucker, « Hox repertoires for motor neuron diversity and connectivity gated by a single accessory factor, FoxP1 », Cell, vol. 134,‎ 25 juillet 2008, p. 304–316 (ISSN 1097-4172, PMID 18662545, DOI 10.1016/j.cell.2008.06.019, lire en ligne, consulté le 15 avril 2016)
↑ Hui Hu, Bin Wang, Madhuri Borde et Julie Nardone, « Foxp1 is an essential transcriptional regulator of B cell development », Nature Immunology, vol. 7,‎ 1^er août 2006, p. 819–826 (ISSN 1529-2908, PMID 16819554, DOI 10.1038/ni1358, lire en ligne, consulté le 15 avril 2016)
↑ (en) Shanru Li, Joel Weidenfeld et Edward E. Morrisey, « Transcriptional and DNA Binding Activity of the Foxp1/2/4 Family Is Modulated by Heterotypic and Homotypic Protein Interactions », Molecular and Cellular Biology, vol. 24,‎ 15 janvier 2004, p. 809–822 (ISSN 0270-7306 et 1098-5549, PMID 14701752, PMCID 343786, DOI 10.1128/MCB.24.2.809-822.2004, lire en ligne, consulté le 26 avril 2016)
↑ Bin Wang, Danjuan Lin, Chuan Li et Philip Tucker, « Multiple domains define the expression and regulatory properties of Foxp1 forkhead transcriptional repressors », The Journal of Biological Chemistry, vol. 278,‎ 4 juillet 2003, p. 24259–24268 (ISSN 0021-9258, PMID 12692134, DOI 10.1074/jbc.M207174200, lire en ligne, consulté le 26 avril 2016)
↑ (en) Claire Bacon et Gudrun A. Rappold, « The distinct and overlapping phenotypic spectra of FOXP1 and FOXP2 in cognitive disorders », Human Genetics, vol. 131,‎ 27 juin 2012, p. 1687–1698 (ISSN 0340-6717 et 1432-1203, PMID 22736078, PMCID 3470686, DOI 10.1007/s00439-012-1193-z, lire en ligne, consulté le 26 avril 2016)
↑ Denise Horn, Johannes Kapeller, Núria Rivera-Brugués et Ute Moog, « Identification of FOXP1 deletions in three unrelated patients with mental retardation and significant speech and language deficits », Human Mutation, vol. 31,‎ 1^er novembre 2010, E1851–1860 (ISSN 1098-1004, PMID 20848658, PMCID 3049153, DOI 10.1002/humu.21362, lire en ligne, consulté le 26 avril 2016)
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↑ Serena Nik-Zainal, Helen Davies, Johan Staaf et Manasa Ramakrishna, « Landscape of somatic mutations in 560 breast cancer whole-genome sequences », Nature, vol. 534, n^o 7605,‎ 2 juin 2016, p. 47–54 (ISSN 1476-4687, PMID 27135926, PMCID 4910866, DOI 10.1038/nature17676, lire en ligne, consulté le 6 janvier 2017)
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↑ Duncan M. Gascoyne et Alison H. Banham, « The significance of FOXP1 in diffuse large B-cell lymphoma », Leukemia & Lymphoma,‎ 27 septembre 2016, p. 1–15 (ISSN 1029-2403, PMID 27678023, DOI 10.1080/10428194.2016.1228932, lire en ligne, consulté le 7 janvier 2017)

Liens externes

Structure du domaine de liaison à l'ADN sur PDB

Clinique

Retard mental associé à FOXP1 sur OMIM (anglais).

Voir aussi

FOXP2

FOXP3

Portail de la biologie cellulaire et moléculaire

[refGRCh38Ensembl-1] {a b et c} GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000114861 - Ensembl, May 2017

[2] « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine

[3] Bin Wang, Joel Weidenfeld, Min Min Lu et Shanna Maika, « Foxp1 regulates cardiac outflow tract, endocardial cushion morphogenesis and myocyte proliferation and maturation », Development (Cambridge, England), vol. 131,‎ 1^er septembre 2004, p. 4477–4487 (ISSN 0950-1991, PMID 15342473, DOI 10.1242/dev.01287, lire en ligne, consulté le 15 avril 2016)

[4] Jeremy S. Dasen, Alessandro De Camilli, Bin Wang et Philip W. Tucker, « Hox repertoires for motor neuron diversity and connectivity gated by a single accessory factor, FoxP1 », Cell, vol. 134,‎ 25 juillet 2008, p. 304–316 (ISSN 1097-4172, PMID 18662545, DOI 10.1016/j.cell.2008.06.019, lire en ligne, consulté le 15 avril 2016)

[5] Hui Hu, Bin Wang, Madhuri Borde et Julie Nardone, « Foxp1 is an essential transcriptional regulator of B cell development », Nature Immunology, vol. 7,‎ 1^er août 2006, p. 819–826 (ISSN 1529-2908, PMID 16819554, DOI 10.1038/ni1358, lire en ligne, consulté le 15 avril 2016)

[6] (en) Shanru Li, Joel Weidenfeld et Edward E. Morrisey, « Transcriptional and DNA Binding Activity of the Foxp1/2/4 Family Is Modulated by Heterotypic and Homotypic Protein Interactions », Molecular and Cellular Biology, vol. 24,‎ 15 janvier 2004, p. 809–822 (ISSN 0270-7306 et 1098-5549, PMID 14701752, PMCID 343786, DOI 10.1128/MCB.24.2.809-822.2004, lire en ligne, consulté le 26 avril 2016)

[7] Bin Wang, Danjuan Lin, Chuan Li et Philip Tucker, « Multiple domains define the expression and regulatory properties of Foxp1 forkhead transcriptional repressors », The Journal of Biological Chemistry, vol. 278,‎ 4 juillet 2003, p. 24259–24268 (ISSN 0021-9258, PMID 12692134, DOI 10.1074/jbc.M207174200, lire en ligne, consulté le 26 avril 2016)

[8] (en) Claire Bacon et Gudrun A. Rappold, « The distinct and overlapping phenotypic spectra of FOXP1 and FOXP2 in cognitive disorders », Human Genetics, vol. 131,‎ 27 juin 2012, p. 1687–1698 (ISSN 0340-6717 et 1432-1203, PMID 22736078, PMCID 3470686, DOI 10.1007/s00439-012-1193-z, lire en ligne, consulté le 26 avril 2016)

[9] Denise Horn, Johannes Kapeller, Núria Rivera-Brugués et Ute Moog, « Identification of FOXP1 deletions in three unrelated patients with mental retardation and significant speech and language deficits », Human Mutation, vol. 31,‎ 1^er novembre 2010, E1851–1860 (ISSN 1098-1004, PMID 20848658, PMCID 3049153, DOI 10.1002/humu.21362, lire en ligne, consulté le 26 avril 2016)

[10] (en) Anna K. Le Fevre, Sharelle Taylor, Neva H. Malek et Denise Horn, « FOXP1 mutations cause intellectual disability and a recognizable phenotype », American Journal of Medical Genetics Part A, vol. 161,‎ 1^er décembre 2013, p. 3166–3175 (ISSN 1552-4833, DOI 10.1002/ajmg.a.36174, lire en ligne, consulté le 26 avril 2016)

[11] Serena Nik-Zainal, Helen Davies, Johan Staaf et Manasa Ramakrishna, « Landscape of somatic mutations in 560 breast cancer whole-genome sequences », Nature, vol. 534, n^o 7605,‎ 2 juin 2016, p. 47–54 (ISSN 1476-4687, PMID 27135926, PMCID 4910866, DOI 10.1038/nature17676, lire en ligne, consulté le 6 janvier 2017)

[12] Marek Mraz, Liguang Chen, Laura Z. Rassenti et Emanuela M. Ghia, « miR-150 influences B-cell receptor signaling in chronic lymphocytic leukemia by regulating expression of GAB1 and FOXP1 », Blood, vol. 124, n^o 1,‎ 3 juillet 2014, p. 84–95 (ISSN 1528-0020, PMID 24787006, PMCID 4125356, DOI 10.1182/blood-2013-09-527234, lire en ligne, consulté le 7 janvier 2017)

[13] Duncan M. Gascoyne et Alison H. Banham, « The significance of FOXP1 in diffuse large B-cell lymphoma », Leukemia & Lymphoma,‎ 27 septembre 2016, p. 1–15 (ISSN 1029-2403, PMID 27678023, DOI 10.1080/10428194.2016.1228932, lire en ligne, consulté le 7 janvier 2017)

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