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NR5A1

De Wikipedia, la enciclopedia libre
Factor Esteroidogénico 1
Protein NR5A1 PDB 1ymt
Estructuras disponibles
PDB

Buscar ortólogos: PDBe, RCSB

 Lista de códigos PDB
1ZDT
Identificadores
Nomenclatura
Símbolos NR5A1 (HGNC: 7983) FTZ1, AD4BP
Identificadores
externos
Locus Cr. 9 q33.3
Taxón Homo Sapiens
Estructura/Función proteica
Tamaño 461 (aminoácidos)
Peso molecular 51 639 (Da)
Tipo de proteína
Funciones Desarrollo y determinación gonadal
Datos biotecnológicos/médicos
Enfermedades Síndrome de Swyer, Insuficiencia adrenal, Reversión Sexual (46,XY) 3, Reversión Sexual (46,XX) 4, Falla prematura ovárica 7, Falla espermatogénica 8, Azoospermia, Oligozoospermia
Información adicional
Tipo de célula Células adrenocorticales, testiculares de Leydig y de Sertoli
Interacciones moleculares NCOA2 (Receptor Nuclear Coactivador 2)
Ortólogos
Especies
Humano Ratón
Entrez
2516 26423
Ensembl
Véase HS Véase MM
UniProt
Q13285 P33242
RefSeq
(ARNm)
NM_004959 NM_139051
RefSeq
(proteína) NCBI
NP_004950.2 NP_620639
Ubicación (UCSC)
Cr. 9:
124.48 – 124.51 Mb
Cr. 2:
38.69 – 38.71 Mb
PubMed (Búsqueda)
[1]


[2]

El gen NR5A1 o (nuclear receptor subfamily 5 group A member 1) humano, (también conocido como ELP, SF1, FTZ1, POF7, AD4BP, SPGF8, SRXX4, SRXY3, hSF-1)[1]​ contiene las instrucciones para producir un factor de transcripción llamado factor esteroidogénico 1,[2]​ que es la proteína que controla la activación de múltiples otros genes relacionados con el desarrollo de las gónadas, glándulas suprarrenales y hormonas sexuales.

Está ubicado en el brazo largo del cromosoma 9 en posición 33.3 (9q33.3)[1]

Mutaciones en NR5A1 pueden causar el llamado síndrome de Swyer,[3]​ producir infertilidad por falla ovárica prematura o espermatogénesis fallida, insuficiencia adrenal.[4][5][6]

Los tejidos en los que se encuentra mayormente expresado es en la corteza de las glándulas supra renales, en los ovarios, testículos y el bazo.[7]

Ortólogos

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Genes Ortólogos[8][9][10]
Identificador Ensembl Organismo Longitud de su proteína
MGP_SPRETEiJ_G0024447 Mus spretus 462 aminoácidos
ENSMMUG00000014111 Macaca mulatta 461 aminoácidos
ENSSSCG00000005588 Sus scrofa 461 aminoácidos
ENSAMEG00000011166 Ailuropoda melanoleuca 465 aminoácidos
ENSBTAG00000009017 Bos taurus 461 aminoácidos
ENSMUSG00000026751 Mus musculus 462 aminoácidos
ENSECAG00000013752 Equus caballus 358 aminoácidos
ENSMAUG00000011097 Mesocricetus auratus 252 aminoácidos
ENSCAFG00000023086 (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última). Canis lupus familiaris 382 aminoácidos
ENSPFOG00000023617 Poecilia formosa 486 aminoácidos

STF1

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Factor transcripcional que se une al promotor transcripcional de los genes esteroidogénicos P450 (CYP11A1, CYP11B1, CYP11B2) también se le es conocida como SF1, hSF1, Adrenal 4-binding protein, Fushi tarazu factor homolog 1, Nuclear receptor subfamily 5 group A member 1, Steroid hormone receptor Ad4BP.

Estructura

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Es una proteína constituida por 461 aminoácidos y tiene un peso molecular de 51636 Da,[11]​ su estructura secundaria está constituida mayormente por alfa hélices y pocas láminas beta.[7]

Consta de tres sitios de unión:

  1. Sitio de unión al ADN en la posición 341
  2. Dedo de zinc en la posición 436
  3. Dedo de zinc en la posición 440[7]

Isoformas

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Isoformas de STF1[7]
Identificador Número de aminoácidos Organismo en la que se identificó
Q13285 461 Homo sapiens
F1DAM0 421 Homo sapiens
Q5T6F7 245 Homo sapiens
Q5T6F6 177 Homo sapiens

Es posible acetilar a STF1 in vivo y también in vitro, como resultado aumenta su actividad transcripcional.[12]

Ubicación en la célula

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STF1 al ser un factor de transcripción se encuentra casi en su totalidad en el núcleo y pobremente en la mitocondria para poder cumplir su función de unirse al ADN.[7]

Función

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El gen NR5A1 contiene las instrucciones para producir un factor transcripcional. Un factor transcripcional es una proteína que se une a ciertas secciones específicas del ADN regulando así su transcripción a RNA mensajero. Este factor en específico se une al promotor de varios genes estereofónicos como por ejemplo CYP11A1, CYP11B1, CYP11B2 y StAR. También puede formar un complejo con la proteína Y de determinación sexual para regular la expresión del gen Sox9 y juntos regular al gen AMH.

StAR

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StAR codifica para una proteína que favorece la formación hormonas esteroides transportando el colesterol desde la membrana mitocondrial externa hasta la membrana mitocondrial interna.[13]

CYP11A1

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CYP11A1 codifican para una enzima involucrada en el metabolismo y síntesis de colesterol y otros lípidos. Esta enzima se localiza en la membrana interna mitocondrial y favorece la transformación de colesterol en pregnenolona (hormona esteroide).[14]

CYP11B1

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Codifican para una enzima involucrada en el metabolismo de medicamentos y síntesis de colesterol y otros lípidos. Esta enzima se localiza en la membrana interna mitocondrial y favorece la transformación de progesterona en cortisol (ambas hormonas esteroides) en las glándulas suprarrenales.[15]

Sox9

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Codifica para una proteína que se une al ADN y junto con STF1 regulan la expresión del gen AMH cuando se están diferenciando los condrocitos (células del cartílago), la falta de STF1 produce una mala regulación de AMH y por lo tanto una mala formación esquelética.[16]

Interacciones con otros genes[9][17]

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Relevancia Clínica

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Reversión sexual 46,XX 4

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Es un trastorno de desarrollo sexual que se caracteriza por la presencia de tejido testicular y ovárico, histológicamente confirmado, en un individuo con un cariotipo 46,XX (región de determinación sexual SRY negativa). Se presenta en aproximadamente 1/20.000 nacimientos. Su diagnóstico se suele realizar durante el periodo neonatal debido a la presencia de genitales atípicos. Existe la posibilidad de que la enfermedad se manifieste durante la pubertad. Los signos son: dolor en el abdomen inferior, ginecomastia, hernias inguinales, tumor inguinoescrotal, criptorquidia o amenorrea/hematuria periódica según la asignación de sexo. Los individuos más afectados tienen genitales femeninos internos (útero, hemiútero o útero rudimentario). El desarrollo de los genitales externos va de genitales aparentes femeninos, a masculinos con rafe peneano corto e hipospadias. En casos raros, los pacientes tienen un pene masculino normal o casi normal y ovotestes bilaterales descendidos (gónadas que contienen elementos ováricos y testiculares). Las configuraciones gonadales varían. La infertilidad es habitual en hombres, mientras que las mujeres tienen cierto potencial de fertilidad.[18][19]

Relación a NRA51

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En 5 pacientes de 4 familias no relacionadas con 46, XX inversión sexual (SRXX4),se identificó una transición en el gen NR5A1 que resultó en una sustitución arg-a-trp en el codón 92 (R92W). En 1 de estas familias, una hermana tuvo una reversión sexual de 46, XY (SRXY3; 612965) debido a la misma variante. En 2 familias, la variante fue heredada por la madre, en 1 se produjo como un evento de novo, y en 1 familia la mutación no estaba presente en el padre, pero la madre había fallecido y no había ADN disponible.[20]​ En 3 probandos (personas iniciales en el estudio genético de una familia) no relacionados con 46, XX (ovo) trastorno testicular del desarrollo sexual (DSD), Baetens et al. (2017) encontraron una transición en el exón 4 del gen NR5A1 que dio como resultado una sustitución de R92W en la proteína. Varias familiares de primer grado no afectadas de los probandos de cada una de las familias también portaban esta mutación, lo que sugiere que esta variante es débilmente penetrante.[21]

Síndrome de Swyer

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El síndrome de Swyer es una condición que afecta el desarrollo y diferenciación sexual, aproximadamente este síndrome lo padecen 1/80000 personas. Cada célula del cuerpo humano suele contener 46 cromosomas, el fenotipo sexual de un individuo está dado por la información genética que se encuentra en los cromosomas sexuales, el denominado par 23 de cromosomas en el cariotipo del individuo. Personas afectados por el síndrome de Swyer suelen presentar genitales femeninos o genitales no del todo definidos entre masculinos y femeninos. Normalmente, en estos casos tanto el útero como las trompas de falopio se encuentran en buenas condiciones pero las gónadas no son funcionales y ese tejido puede llegar a desarrollar cáncer por lo que es removido temprano en la vida del afectado. Aunque sea imposible producir óvulos, si se padece del síndrome, es posible tener una fecundación in vitro.[22]

Genes relacionados con el síndrome de Swyer

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Historia

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Parker K.L. et al - 1991. "Un promotor común para 3 enzimas esteroidogénicas"

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Al analizar tres enzimas citocromo P450 (cholesterol side-chain cleavage enzyme (SCC), steroid 21-hydroxylase (21-OHase), and steroid 11 beta-hydroxylase (11 beta-OHase)), requeridas en la biosíntesis de corticosteroides se detectaron 6 elementos que contenían variaciones del motivo AGGTC conocido por regular la expresión de las células adrenocorticales Y1. Con base en los siguientes experimentos se demostró que dichos elementos interactuaban con los misma o parecida proteína(s) de unión al DNA.

  • Sobre estos elementos se formaron complejos de similar tamaño analizado por electroforesis.
  • Al hacer experimentos con inhibidores competitivos encontraron especificidades parecidas o idénticas entre los complejos proteicos formados.

Estos resultaron y la presencia del motivo AGGTCA, elemento afín para un gran número de receptores nucleares de hormona, concluyeron la existencia de una proteína putativa de la receptora nuclear de hormona que también regulaba expresión de enzimas adrenales esteroidogénicas.[26]

Morohashi K. et al - 1992. "Un factor de transcripción común para genes esteroidogénicos"

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Previos estudios de CYP11B1 revelaron 6 elementos implicados en su regulación (Ad1, Ad2, Ad3, Ad4, Ad5, y Ad6). De ellos Ad4 era un elemento equivalente a elementos en las secuencias promotoras de proteínas esteroidogénicas P450, consecuentemente elemento positivo de transcripción que podía ser estimulado por la adición de cAMP. Su proteína de unión al DNA fue purificada de la corteza suprarrenal ("adrenales") bovina y nombrada Ad4BP (Ad4Binding-Proteín). Con una masa molecular estimada de 53kDa, que se obtuvo con una electroforesis de poliacrilamida en gel, se descubrió que cada gen esteroidogénico P450 examinado tenía un elemento (secuencia) de unión a Ad4BP. La expresión de Ad4BP se examinó con células de la corteza suprarrenal y varias otras células esteroidogénicas y no esteroidogénicas. Solo las células esteroidogénicas, las células de la granulosa del ovario bovino y las células I-10 derivadas de las células de Leydig de ratón expresaron la actividad de unión al sitio Ad4. Esto sugirió que Ad4BP es un factor de transcripción indispensable en la expresión de genes esteroidogénicos.[27]

Parker K.L. et al - 1994. "Un receptor nuclear es esencial para el desarrollo suprarrenal y gonadal"

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Un gran avance en la comprensión de los procesos in vivo implicados por este gen se lograron con la deleción de la secuencia codificante para Ad4BP, para este entonces conocida ya como Steroidigenic Factor 1 (SF1). Este estudio fue realizado en ratones, y se encontró que aquellos sin SF1 se desarrollaban normalmente en el útero, pero moran al día 8 post-natal; carecían de glándulas suprarrenales y gónadas, con una gran deficiencia de corticosterona, lo que reafirmaba su posible causa de muerte: insuficiencia adrenal.[28]

Referencias

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  1. a b c «NR5A1 nuclear receptor subfamily 5 group A member 1 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov (en inglés). Consultado el 17 de septiembre de 2018. 
  2. ncbi. «1YOW: human Steroidogenic Factor 1 LBD with bound Co-factor Peptide». 
  3. Reference, Genetics Home. «NR5A1 gene». Genetics Home Reference (en inglés). Consultado el 17 de septiembre de 2018. 
  4. Allali S, Muller J-B, Brauner R, Lourenço D, Boudjenah R, Karageorgou V, et al. (2011). «Mutation Analysis of NR5A1 Encoding Steroidogenic Factor 1 in 77 Patients with 46, XY Disorders of Sex Development (DSD) Including Hypospadias.». PLoS ONE 6 (10): e24117. doi:10.1371/journal.pone.0024117. 
  5. Baetens D, (2016). NR5A1 is a novel disease gene for 46,XX testicular and ovotesticular disorders of sex development. 
  6. Kremen (2017). «Recent Findings on the Genetics of Disorders of Sex Development». Current opinion in urology 27 (1): 1-6. 
  7. a b c d e «NR5A1 - Steroidogenic factor 1 - Homo sapiens (Human) - NR5A1 gene & protein». www.uniprot.org (en inglés). Consultado el 18 de septiembre de 2018. 
  8. «Gene: NR5A1 (ENSG00000136931) - Orthologues - Homo sapiens - Ensembl genome browser 93». www.ensembl.org (en inglés británico). Consultado el 20 de septiembre de 2018. 
  9. a b Database, GeneCards Human Gene. «NR5A1 Gene - GeneCards | STF1 Protein | STF1 Antibody». www.genecards.org. Consultado el 20 de septiembre de 2018. 
  10. «BLAST: Basic Local Alignment Search Tool». blast.ncbi.nlm.nih.gov (en inglés). Consultado el 20 de septiembre de 2018. 
  11. Database, GeneCards Human Gene. «NR5A1 Gene - GeneCards | STF1 Protein | STF1 Antibody». www.genecards.org. Consultado el 18 de septiembre de 2018. 
  12. Jacob, Anne L.; Lund, Johan; Martinez, Pedro; Hedin, Lars (5 de octubre de 2001). «Acetylation of Steroidogenic Factor 1 Protein Regulates Its Transcriptional Activity and Recruits the Coactivator GCN5». Journal of Biological Chemistry (en inglés) 276 (40): 37659-37664. ISSN 0021-9258. PMID 11479297. doi:10.1074/jbc.M104427200. Consultado el 18 de septiembre de 2018. 
  13. «STAR steroidogenic acute regulatory protein [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov (en inglés). Consultado el 18 de septiembre de 2018. 
  14. «CYP11A1 cytochrome P450 family 11 subfamily A member 1 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov (en inglés). Consultado el 18 de septiembre de 2018. 
  15. «CYP11B1 cytochrome P450 family 11 subfamily B member 1 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov (en inglés). Consultado el 18 de septiembre de 2018. 
  16. «SOX9 SRY-box 9 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov (en inglés). Consultado el 18 de septiembre de 2018. 
  17. «Home - Gene - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov (en inglés). Consultado el 20 de septiembre de 2018. 
  18. Moshiri, Miriam; et al. «Free Access Evaluation and Management of Disorders of Sex Development: Multidisciplinary Approach to a Complex Diagnosis». RSNA (en inglés). Consultado el 19 de septiembre de 2018. 
  19. «46,XX SEX REVERSAL 4; SRXX4». OMIM (en inglés). Consultado el 19 de septiembre de 2018. 
  20. Bashamboo; et al. «A recurrent p.Arg92Trp variant in steroidogenic factor-1 (NR5A1) can act as a molecular switch in human sex development.». PubMed (en inglés). Consultado el 19 de septiembre de 2018. 
  21. Baetens; et al. «NR5A1 is a novel disease gene for 46,XX testicular and ovotesticular disorders of sex development.». PubMed (en inglés). Consultado el 19 de septiembre de 2018. 
  22. a b c d e Reference, Genetics Home. «Swyer syndrome». Genetics Home Reference (en inglés). Consultado el 17 de septiembre de 2018. 
  23. «SRY sex determining region Y [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov (en inglés). Consultado el 17 de septiembre de 2018. 
  24. «MAP3K1 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov (en inglés). Consultado el 17 de septiembre de 2018. 
  25. «DHH desert hedgehog [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov (en inglés). Consultado el 17 de septiembre de 2018. 
  26. Parker L., Keith; et al. «A shared promoter element regulates the expression of three steroidogenic enzymes.». PubMed (en inglés). Consultado el 18 de septiembre de 2018. 
  27. Morohashi, Kenichirou; et al. «A common trans-acting factor, Ad4-binding protein, to the promoters of steroidogenic P-450s.». PubMed (en inglés). Consultado el 18 de septiembre de 2018. 
  28. Parker L., Keith; et al. «A cell-specific nuclear receptor is essential for adrenal and gonadal development and sexual differentiation.». PubMed (en inglés). Consultado el 19 de septiembre de 2018.