TFIIH-Helikase XPB
Die TFIIH-Helikase XPB ist das Enzym im Zellkern von Eukaryoten, das als Teil des Transkriptionsfaktors IIH (TFIIH) die Öffnung des DNA-Doppelstrangs katalysiert, nachdem der Präinitiationskomplex zusammengebaut wurde. Dieser Reaktionsschritt ist Teil der Initiation der Transkription aller eukaryotischen Gene. Außerdem spielt XPB eine ganz ähnliche Rolle bei der DNA-Reparatur. Mutationen im menschlichen ERCC3-Gen, das für XPB codiert, können zur seltenen Erbkrankheit Xeroderma pigmentosum Typ B führen, bei der das Risiko für Hautkrebs 2000fach erhöht ist, oder zum Tay-Syndrom, einer seltenen Ichthyose.[2]
| TFIIH-Helikase XPB | ||
|---|---|---|
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Vorhandene Strukturdaten: 4ERN | ||
| Eigenschaften des menschlichen Proteins | ||
| Masse/Länge Primärstruktur | 782 Aminosäuren | |
| Bezeichner | ||
| Gen-Namen | ERCC3 BTF2; GTF2H; RAD25; TFIIH; TTD2; XPB | |
| Externe IDs | ||
| Enzymklassifikation | ||
| EC, Kategorie | 3.6.4.12, Helikase | |
| Reaktionsart | Isomerisierung | |
| Substrat | ATP + ds-DNA | |
| Produkte | ADP + Phosphat + ds-DNA mit 'Blase' | |
| Vorkommen | ||
| Homologie-Familie | Hovergen | |
| Übergeordnetes Taxon | Eukaryoten[1], Archaeen | |
| Orthologe | ||
| Mensch | Hausmaus | |
| Entrez | 2071 | 13872 |
| Ensembl | ENSG00000163161 | ENSMUSG00000024382 |
| UniProt | P19447 | P49135 |
| Refseq (mRNA) | NM_000122 | NM_133658 |
| Refseq (Protein) | NP_000113 | NP_598419 |
| Genlocus | Chr 2: 127.26 – 127.29 Mb | Chr 18: 32.24 – 32.27 Mb |
| PubMed-Suche | 2071 | 13872
|
Die Öffnung des Doppelstrangs verbraucht ein Molekül ATP und umspannt die Basen von −10 bis +2 bezüglich des Genanfangs. Unterstützt wird sie durch Entdrillung der DNA (sogenanntes negatives Supercoiling) mithilfe von TFIIE. An der DNA-Reparatur nimmt außerdem die XPD-Helikase teil. Die geöffnete DNA wird in beiden Fällen als DNA-Blase bezeichnet.[3]
Ein zu XPB orthologes Protein wurde in Archaeen gefunden. Das gefundene XPB weist wie das eukaryotische in vitro keine Helikase-Aktivität auf. Für das Protein wird eine Funktion bei der DNA-Reparatur vermutet.[4]
XPB und XPD bilden einen Teil der Verteidigung der Zelle gegen retrovirale Infektionen, einer Laborstudie nach. Eine chinesische Studie fand, dass eine Kombination bestimmter XPB- und XPD-Varianten das Lungenkrebsrisiko erhöhte.[5][6]
Weiterführende Literatur
Bearbeiten- Beck BD, Hah DS, Lee SH: XPB and XPD between transcription and DNA repair. In: Adv. Exp. Med. Biol. 637. Jahrgang, 2008, S. 39–46, PMID 19181109.
- Coin F, Oksenych V, Egly JM: Distinct roles for the XPB/p52 and XPD/p44 subcomplexes of TFIIH in damaged DNA opening during nucleotide excision repair. In: Mol. Cell. 26. Jahrgang, Nr. 2, April 2007, S. 245–56, doi:10.1016/j.molcel.2007.03.009, PMID 17466626.
- Hu GM, Liu LM, Zhang JX, et al.: The role of XPB in cell apoptosis and viability and its relationship with p53, p21(waf1/cip1) and c-myc in hepatoma cells. In: Dig Liver Dis. 38. Jahrgang, Nr. 10, Oktober 2006, S. 755–61, doi:10.1016/j.dld.2006.06.009, PMID 16914395.
Einzelnachweise
Bearbeiten- ↑ Homologe bei OMA
- ↑ UniProt P19447
- ↑ Reinberg/reactome: RNA Polymerase II Promoter Opening: First Transition
- ↑ Richards JD, Cubeddu L, Roberts J, Liu H, White MF: The archaeal XPB protein is a ssDNA-dependent ATPase with a novel partner. In: J. Mol. Biol. 376. Jahrgang, Nr. 3, Februar 2008, S. 634–44, doi:10.1016/j.jmb.2007.12.019, PMID 18177890.
- ↑ Yoder K, Sarasin A, Kraemer K, McIlhatton M, Bushman F, Fishel R: The DNA repair genes XPB and XPD defend cells from retroviral infection. In: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103. Jahrgang, Nr. 12, März 2006, S. 4622–7, doi:10.1073/pnas.0509828103, PMID 16537383, PMC 1450221 (freier Volltext).
- ↑ Hu Z, Xu L, Shao M, et al.: Polymorphisms in the two helicases ERCC2/XPD and ERCC3/XPB of the transcription factor IIH complex and risk of lung cancer: a case-control analysis in a Chinese population. In: Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev. 15. Jahrgang, Nr. 7, Juli 2006, S. 1336–40, doi:10.1158/1055-9965.EPI-06-0194, PMID 16835333.