BTBD14B

BTBD14B
Dostupne strukture
PDB	Pretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova
	3GA1, 4U2N
Identifikatori
Aliasi	NACC1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 610672 MGI: 1914080 HomoloGene: 12042 GeneCards: NACC1
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 19 (čovjek)
Kraj	13,141,147 bp
Lokacija gena (miš)
Hrom.	Hromosom 8 (miš)
Kraj	85,414,531 bp
Obrazac RNK ekspresije
	; ;
	Više referentnih podataka o ekspresiji
Ortolozi
	112939
	66830
	ENSG00000160877
	ENSMUSG00000001910
	Q96RE7
	Q7TSZ8
	NM_052876
	NM_025788
	NP_443108
	NP_080064
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek	Pogledaj/uredi – miš

Jedarni akumbens-vezani protein 1 ili nukleusni akumbensni protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom NACC1.^[5]^[6]

Članovi BTB / POZ porodice transkripcijskih regulatora, uključujući BTBD14B, sadrže konzervirani motiv u N-terminalnom području kritičnom za interakcije protein-protein i sklop kompleksa visoke molekulske mase.

Kloniranje i ekspresija

Pregledom biblioteke cDNK cijelog mozga pacova, s transkriptom koji je pokazao povećanu ekspresiju u jedrima pacova, nakon primjene kokaina, nakon čega slijedi RT-PCR, Cha et al. (1997) klonirani pacovski Btbd14b, kojeg su nazvali nucleus accumbens-1 (Nac1). Izvedeni protein od 514 aminokiselina sadrži domen POZ u prvih 120 aminokiselina.^[7]

Korutla et al. (2002) identificirali su prerađenu varijantu pacova Btbd14b, kojoj je nedostajalo 27 aminokiselina iz srednje regije Btbd14b. I izvedene 514-aminokiselinske (lNac1) i 487-aminokiselinske (sNac1) izoforme sadrže N-terminalni POZ domen. RT-PCR analiza otkrila je iRNK obje izoforme u svim ispitivanim regijama mozga odraslih pacova, kao i u slezeni, skeletnim mišićima, srcu, bubrezima, timusu, sa mNNA lNac1 2,5 puta obilnijim od iRNK sNac1. Western blot analiza otkrila je i lNac1 i sNac1 u više regija zrelog CNS-a zrelih pacova, uključujući moždana jezgra, kaudatni putamen, mali mozak, olfaktornu kvržicu i prefrontalni korteks, s izoformom lNac1, koji je bio obilniji. Ekspresija lNac1 otkrivena je u srcu odraslom pacova, jetri, bubregu, slezeni, testisu i skeletnim mišićima, dok je sNac1 otkriven samo u jetri. Imunohistokemijska svojstva lNac1 i sNac1 pacova eksprimirana u ćelijama H293T obuhvataju obje izoforme u jezgru u tačkastoj distribuciji karakterističnoj za transkripcijske faktore BTB/POZ.

Funkcija gena

Koristeći Nac1 mutante pacova izražene u ćelijama H293T, Korutla et al. (2002) utvrdili su da i lNac1 i sNac1 potiskuju transkripciju reporter gena, pri čemu lNac1 pokazuje veću transkripcijsku represivnu aktivnost od sNac1.^[8] Korutla et al. (2005) otkrili su da je transkripcijska represija posredovana Nac1 u kulturama neuronskih ćelija i u primarnim hipokampusnim neuronima djelimično poništena inhibitorima histonskih deacetilaza. Međutim, nije primijećena promjena na glijinim ćelijama. Dvohibridna analiza sisara, in vitro koimunoprecipitacija i GST testovi padajućeg postupka pokazali su da su i Nac1 izoforme u interakciji s HDAC3 i HDAC4 u NNA i PC12 ćelijama sličnim neuronima, ali ne i u neuronskim ćelijama H293T. Koristeći Nac1 izoforme i mutantne konstrukcije, pokazali su da se vezanje Nac1 za HDAC3 (605166) i HDAC4 dogodilo i preko POZ i izvan POZ domena. Korutla et al. (2005) sugeriraju da Nac1 regrutuje histonske deacetilaze i djeluje kao transkripcijski korektor u neuronskim ćelijama.^[9]

Koristeći serijsku analizu ekspresije gena, Nakayama et al. (2006) otkrili su da je NAC1 značajno prekomjerno eksprimiran u seroznim karcinomima jajnika i nekoliko drugih tipova karcinoma. Imunohistokemijska analiza seroznih karcinoma jajnika lokalizirala je NAC1 u diskretnim jedarnim tijelima, što su autori nazvali NAC1 tijelima, a nivo ekspresije NAC1 korelirao s recidivom tumora. Intenzivna imunoreaktivnost NAC1 u primarnim tumorima predvidjela je rani recidiv u karcinomima jajnika. I imunoprecipitacija i dvostruko imunofluorescentno bojenje pokazali su da se NAC1 homodimerizuje preko BTB/POZ domena. Inducirana ekspresija domena NAC1 BTB/POZ poremetila je tijela NAC1, spriječila stvaranje tumora i promovirala apoptozu tumorskih ćelija u utvrđenim tumorima u modelu ksenotransplanta na mišu. Prekomjerna ekspresija NAC1 pune dužine povećala je tumorogenost epitelnih ćelija i fibroblasta na površini jajnika kod atipskih nu/nu miševa.

Nakayama et al. (2007) pokazali su da je NAC1 smanjio ekspresiju supresora tumora GADD45GIP1 u nekoliko ćelijskih linija ljudskog karcinoma. U tumorskim ćelijamama koje eksprimiraju NAC1, ekspresija dominantno negativnog NAC1 mutanta, koji sadrži samo BTB/POZ domen, inhibirala je rast ćelija, a taj je efekt djelimično poništen nokdaunom GADD45GIP1.^[10]

Molekulska genetika

U sedam nepovezanih pacijenata s neurorazvojnim poremećajem s epilepsijom, kataraktom, poteškoćama u hranjenju i odgođenom mijelinizacijom mozga, Schoch et al. (2017) identificirali su ponovnu de novo heterozigotnu misens mutaciju u genu NACC1 (R298W). Jedan od pacijenata imao je mozaičnu mutaciju. Mutacija je pronađena sekvenciranjem cijelog egzoma, a potvrđena Sangerovim sekvenciranjem. Funkcionalne studije varijanti i studije ćelija pacijenta nisu potvrđene.^[11]^[12]

Aminokiselinska sekvenca

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

10	20	30	40	50
MAQTLQMEIP	NFGNSILECL	NEQRLQGLYC	DVSVVVKGHA	FKAHRAVLAA
SSSYFRDLFN	NSRSAVVELP	AAVQPQSFQQ	ILSFCYTGRL	SMNVGDQFLL
MYTAGFLQIQ	EIMEKGTEFF	LKVSSPSCDS	QGLHAEEAPS	SEPQSPVAQT
SGWPACSTPL	PLVSRVKTEQ	QESDSVQCMP	VAKRLWDSGQ	KEAGGGGNGS
RKMAKFSTPD	LAANRPHQPP	PPQQAPVVAA	AQPAVAAGAG	QPAGGVAAAG
GVVSGPSTSE	RTSPGTSSAY	TSDSPGSYHN	EEDEEEDGGE	EGMDEQYRQI
CNMYTMYSMM	NVGQTAEKVE	ALPEQVAPES	RNRIRVRQDL	ASLPAELINQ
IGNRCHPKLY	DEGDPSEKLE	LVTGTNVYIT	RAQLMNCHVS	AGTRHKVLLR
RLLASFFDRN	TLANSCGTGI	RSSTNDPRRK	PLDSRVLHAV	KYYCQNFAPN
FKESEMNAIA	ADMCTNARRV	VRKSWMPKVK	VLKAEDDAYT	TFISETGKIE
PDMMGVEHGF	ETASHEGEAG	PSAEALQ

Reference

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000160877 - Ensembl, maj 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000001910 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (Dec 2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
^ "Entrez Gene: BTBD14B BTB (POZ) domain containing 14B".
^ Cha, X. Y., Pierce, R. C., Kalivas, P. W., Macker, S. A. NAC-1, a rat brain mRNA, is increased in the nucleus accumbens three weeks after chronic cocaine self-administration. J. Neurosci. 17: 6864-6871, 1997. [PubMed]: 9278521
^ Korutla, L., Wang, P. J., Lewis, D. M., Neustadter, J. H., Stromberg, M. F., Mackler, S. A. Differences in expression, actions and cocaine regulation of two isoforms for the brain transcriptional regulator NAC1. Neuroscience 110: 421-429, 2002. [PubMed]: 11906783
^ Korutla, L., Wang, P. J., Mackler, S. A. The POZ/BTB protein NAC1 interacts with two different histone deacetylases in neuronal-like cultures. J. Neurochem. 94: 786-793, 2005. [PubMed]: 16033423
^ Nakayama, K., Nakayama, N., Davidson, B., Sheu, J. J.-C., Jinawath, N., Santillan, A., Salani, R., Bristow, R. E., Morin, P. J., Kurman, R. J., Wang, T.-L., Shih, I.-M. A BTB/POZ protein, NAC-1, is related to tumor recurrence and is essential for tumor growth and survival. Proc. Nat. Acad. Sci. 103: 18739-18744, 2006. [PubMed]: 17130457
^ Nakayama, K., Nakayama, N., Davidson, B., Sheu, J. J.-C., Jinawath, N., Santillan, A., Salani, R., Bristow, R. E., Morin, P. J., Kurman, R. J., Wang, T.-L., Shih, I.-M. A BTB/POZ protein, NAC-1, is related to tumor recurrence and is essential for tumor growth and survival. Proc. Nat. Acad. Sci. 103: 18739-18744, 2006. PubMed: 17130457
^ Nakayama, K., Nakayama, N., Wang, T.-L., Shih, I.-M. NAC-1 controls cell growth and survival by repressing transcription of Gadd45GIP1, a candidate tumor suppressor. Cancer Res. 67: 8058-8064, 2007. [PubMed]: 17804717

Vanjski linkovi

Lokacija ljudskog genoma NACC1 i stranica sa detaljima o genu NACC1 u UCSC Genome Browseru.
PDBe-KB provides an overview of all the structure information available in the PDB for Human Nucleus accumbens-associated protein 1 (BTBD14B)

Dopunska literatura

Nakayama K, Nakayama N, Wang TL, Shih IeM (2007). "NAC-1 controls cell growth and survival by repressing transcription of Gadd45GIP1, a candidate tumor suppressor". Cancer Res. 67 (17): 8058–64. doi:10.1158/0008-5472.CAN-07-1357. PMID 17804717.
Davidson B, Berner A, Trope' CG, et al. (2007). "Expression and clinical role of the bric-a-brac tramtrack broad complex/poxvirus and zinc protein NAC-1 in ovarian carcinoma effusions". Hum. Pathol. 38 (7): 1030–6. doi:10.1016/j.humpath.2006.12.009. PMID 17391728.
Nakayama K, Nakayama N, Davidson B, et al. (2007). "A BTB/POZ protein, NAC-1, is related to tumor recurrence and is essential for tumor growth and survival". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (49): 18739–44. doi:10.1073/pnas.0604083103. PMC 1693732. PMID 17130457.
Korutla L, Wang PJ, Mackler SA (2005). "The POZ/BTB protein NAC1 interacts with two different histone deacetylases in neuronal-like cultures". J. Neurochem. 94 (3): 786–93. doi:10.1111/j.1471-4159.2005.03206.x. PMID 16033423. S2CID 42787411.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073/pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
Korutla L, Wang PJ, Lewis DM, et al. (2002). "Differences in expression, actions and cocaine regulation of two isoforms for the brain transcriptional regulator NAC1". Neuroscience. 110 (3): 421–9. doi:10.1016/S0306-4522(01)00518-8. PMID 11906783. S2CID 13388723.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000160877 - Ensembl, maj 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000001910 - Ensembl, maj 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid12477932-5] Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (Dec 2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.

[entrez-6] "Entrez Gene: BTBD14B BTB (POZ) domain containing 14B".

[7] Cha, X. Y., Pierce, R. C., Kalivas, P. W., Macker, S. A. NAC-1, a rat brain mRNA, is increased in the nucleus accumbens three weeks after chronic cocaine self-administration. J. Neurosci. 17: 6864-6871, 1997. [PubMed]: 9278521

[8] Korutla, L., Wang, P. J., Lewis, D. M., Neustadter, J. H., Stromberg, M. F., Mackler, S. A. Differences in expression, actions and cocaine regulation of two isoforms for the brain transcriptional regulator NAC1. Neuroscience 110: 421-429, 2002. [PubMed]: 11906783

[9] Korutla, L., Wang, P. J., Mackler, S. A. The POZ/BTB protein NAC1 interacts with two different histone deacetylases in neuronal-like cultures. J. Neurochem. 94: 786-793, 2005. [PubMed]: 16033423

[10] Nakayama, K., Nakayama, N., Davidson, B., Sheu, J. J.-C., Jinawath, N., Santillan, A., Salani, R., Bristow, R. E., Morin, P. J., Kurman, R. J., Wang, T.-L., Shih, I.-M. A BTB/POZ protein, NAC-1, is related to tumor recurrence and is essential for tumor growth and survival. Proc. Nat. Acad. Sci. 103: 18739-18744, 2006. [PubMed]: 17130457

[11] Nakayama, K., Nakayama, N., Davidson, B., Sheu, J. J.-C., Jinawath, N., Santillan, A., Salani, R., Bristow, R. E., Morin, P. J., Kurman, R. J., Wang, T.-L., Shih, I.-M. A BTB/POZ protein, NAC-1, is related to tumor recurrence and is essential for tumor growth and survival. Proc. Nat. Acad. Sci. 103: 18739-18744, 2006. PubMed: 17130457

[12] Nakayama, K., Nakayama, N., Wang, T.-L., Shih, I.-M. NAC-1 controls cell growth and survival by repressing transcription of Gadd45GIP1, a candidate tumor suppressor. Cancer Res. 67: 8058-8064, 2007. [PubMed]: 17804717

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]