UNKL

UNKL
Identifikatori
Aliasi	UNKL
Vanjski ID-jevi	OMIM: 617463 MGI: 1921404 HomoloGene: 62673 GeneCards: UNKL
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 16 (čovjek)[1] Bend 16p13.3 Početak 1,363,205 bp[1] Kraj 1,414,751 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 17 (miš)[2] Bend 17|17 A3.3 Početak 25,188,397 bp[2] Kraj 25,234,443 bp[2]
Ontologija gena Molekularna funkcija • vezivanje iona metala • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • GO:0050372 aktivnost sa transferazom ubikvitina • aktivnost sa transferazom • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Ćelijska komponenta • jedro • citoplazma • citosol Biološki proces • protein ubiquitination • protein polyubiquitination • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	64718	74154
Ensembl	ENSG00000059145	ENSMUSG00000015127
UniProt	Q9H9P5	Q5FWH2
RefSeq (mRNK)	NM_001037125 NM_001193388 NM_001193389 NM_001276414 NM_001367622 NM_001370526 NM_001372107 NM_024023	NM_001197024 NM_001290736 NM_028789 NM_001357876 NM_001357877
RefSeq (bjelančevina)	NP_001032202 NP_001180317 NP_001180318 NP_001263343 NP_001354551 NP_001357455 NP_001359036	NP_001183953 NP_001277665 NP_083065 NP_001344805 NP_001344806
Lokacija (UCSC)	Chr 16: 1.36 – 1.41 Mb	Chr 17: 25.19 – 25.23 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Neuređeni RING protein cinkovog prsta je protein koji je kod ljudi kodiran genom UNKL.^[5]

Patricia Hartz (2017) mapirala je gen UNKL u hromosomskoj regiji 16p13.3, na osnovu poravnanja UNKL sekvence (GenBank AK022685) sa genomskom sekvencom (GRCh38).

Korištenje aktiviranog mutanta RAC1 kao sonde u 2-hibridnom skriningu Jurkat biblioteke cDNK ljudskih T-ćelija, nakon čega je uslijedilo nekoliko rundi 5-baznog RACE-a s leukocitima ljudske periferne krvi, Lores et al. (2010) klonirali UNKL, koji su nazvali UNKL. Izvedeni protein s 680 aminokiselina ima ćetiri cinkova prsta u N-terminalnom području i domenu prstenastih prstiju blizu C-kraja. UNKL ima 87%, odnosno 40% identiteta sa ortolozima miša i roda Drosophila. Northern blot analiza otkrila je sveprisutnu ekspresiju transkripta od 4,4 kb u tkivima miša. Epitop označen UNKL bio je pretežno lociran u citosolu transficiranih HeLa ćelija, ali inhibicija eksporta jedarne energije rezultirala je jedarnom akumulacijom UNKL.^[6]

Primjenom GST padajućeg test, Lores et al. (2010) potvrdili su interakciju između aktiviranog RAC-a i izoliranog C-terminala ljudskog UNKL-a, uključujući RING domen cinkovog prsta. Krajnji dio UNKL C nije stupio u interakciju sa RAC1 pune dužine, koji je pretežno bio u obliku vezanom za BDP, niti sa bilo kojom drugom testiranom malom GTPazom. C-terminalna regija UNKL-a bila je ubikvitinirana u nekoliko ljudskih ćelijskih linija, a ubikvitinacija je pojačana aktiviranim RAC1. Delecija RING domena mišjeg cinkocog prsta Unkl poboljšala je njegovu sveprisutnost. C-terminalno područje UNKL-a stupilo je u interakciju sa SWI/SNF-om podjedinicom kompleksa za preoblikovanje hromatina BAF60B, u 2-hibridnoj analizi biblioteke cDNK posteljice. UNKL nije komunicirao s drugim ispitivanim podjedinicama BAF-a. Ekspresije regijw C-terminala UNKL poboljšale je ubikvitinaciju BAF60B, a kratko razlaganje UNKL-a posredovano ukosnicama smanjilo je ubikvitinaciju BAF60B.

Dužina polipeptidnog lanca je 680 aminokiselina, a molekulska težina 73.828 Da.^[7].

Simboli