TMEM205
TMEM205 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
Aliasi | TMEM205 | ||||||||||||||||||||||||
Vanjski ID-jevi | OMIM: 613771 MGI: 3045495 HomoloGene: 43895 GeneCards: TMEM205 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
Entrez | |||||||||||||||||||||||||
Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
UniProt | |||||||||||||||||||||||||
RefSeq (mRNK) |
| ||||||||||||||||||||||||
RefSeq (bjelančevina) |
| ||||||||||||||||||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr 19: 11.34 – 11.35 Mb | Chr 9: 21.83 – 21.84 Mb | |||||||||||||||||||||||
PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
|
Transmembranski protein 205 (TMEM205) je protein koji je kod ljudi kodiran genom TMEM205.
Gen
[uredi | uredi izvor]TMEM205 nalazi se na minus lancu hromosoma 19 od baznog para 11,453.452 do 11,456.981. U neposrednoj blizini TMEM205, malo uzvodno, nalazi se CCDC159, a RAB3D je malo niže od genomske sekvence.
Protein
[uredi | uredi izvor]Ljudski homolog TMEM205 dug je 189 aminokiselina i ima molekulsku težinu od 21,2 kDa. Sadrži četiri hidrofobna spiralna domena za koje se predviđa da su transmembranski domeni.
- Aminokiselinska sekvenca
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEEGGNLGGL | IKMVHLLVLS | GAWGMQMWVT | FVSGFLLFRS | LPRHTFGLVQ | ||||
SKLFPFYFHI | SMGCAFINLC | ILASQHAWAQ | LTFWEASQLY | LLFLSLTLAT | ||||
VNARWLEPRT | TAAMWALQTV | EKERGLGGEV | PGSHQGPDPY | RQLREKDPKY | ||||
SALRQNFFRY | HGLSSLCNLG | CVLSNGLCLA | GLALEIRSL |
Ekspresija
[uredi | uredi izvor]Pokazalo se da se TMEM205 eksprimira u većim količinama u tkivima koja imaju sekretornu funkciju. Ta tkiva uključuju tkiva štitnjače, nadbubrežnih žlijezda, gušterače i mliječnih tkiva.[5] Također se pokazalo da protein ispoljava pojačanu ekspresiju u tkivu tumora, koje je postalo otporno na hemoterapijske lijekove na bazi platine.
Funkcija
[uredi | uredi izvor]Smatra se da je TMEM205 višeprolazni transmembranski protein. Pokazalo se da se u ljudskim tkivima nalazi na plazemamembrani i translocira se u jedarnu ovojnicu kad ćelije postanu otporne na cisplatin.[[5] Sadrži četiri domena za koje je TMHMM analizom predviđeno da će biti transmembranski domeni.
Homologija
[uredi | uredi izvor]TMEM205 nema poznate paraloge u ljudskom genomu. Korištenje UCSC pretraživača genoma BLA[6] prema sekvenci ljudskog proteina, utvrđeno je da je rod primata Galago najbliži čovjeku a koji sadrži paralog gena TMEM205 u svom genomu. TMEM205, međutim, ima širok raspon ortolognih sekvenci
Rod – Vrsta | Uobičajeno ime | Divergencija sa ljudima (milioni godina)[7] | Pristup proteinu u bazi NCBI | Sličnost sekvenci[8] | Dužina proteina |
---|---|---|---|---|---|
Homo sapiens[9] | Ljudi | 0 | AAH91472.1 | 100% | 189 |
Pan troglodytes[10] | Obični čimpanza | 6,4 | XP_003316117.1 | 100% | 189 |
Pongo abelii[11] | Orangutan | 15,8 | NP 001124814.1 | 99% | 189 |
Gorilla gorilla[12] | Gorila | 8,8 | XP_004060075.1 | 99% | 189 |
Callithrix jacchus[13] | Obični marmozet | 43,9 | XP_002761800.1 | 96% | 189 |
Mus musculus[14] | Miš | 94,1 | BAA92792764.1 | 88% | 189 |
Sarcophilus harrisii[15] | Tasmanijski đavo | 162,6 | XP_003760487.1 | 77% | 193 |
Crotalus adamanteus[16] | Zmija zvečarka | 296 | AFJ51753.1 | 85% | 188 |
Xenopus[17] | Kandžasta žaba | 371 | NP_001037942.1 | 68% | 189 |
Klinički značaj
[uredi | uredi izvor]Pokazalo se da je TMEM205 uključen u rezistenciju na cisplatin. Cisplatin je hemoterapijski lijek, koji se obično koristi za liječenje solidnih malignih bolesti, kao što su karcinom, sarkom i limfom. Osim što je uključen u rezistenciju na cisplatin, sve je više dokaza da je protein također uključen u bolesti tiroiditis i prostatitis
Reference
[uredi | uredi izvor]- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000105518 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040883 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ a b Shen DW, Ma J, Okabe M, Zhang G, Xia D, Gottesman MM (novembar 2010). "Elevated expression of TMEM205, a hypothetical membrane protein, is associated with cisplatin resistance". Journal of Cellular Physiology. 225 (3): 822–8. doi:10.1002/jcp.22287. PMC 2971691. PMID 20589834.
- ^ Kent WJ (april 2002). "BLAT--the BLAST-like alignment tool". Genome Research. 12 (4): 656–64. doi:10.1101/gr.229202. PMC 187518. PMID 11932250.
- ^ "Time Tree".
- ^ "NCBI BLAST".
- ^ "NCBI Protein: AAH91472.1".
- ^ "NCBI Protein: XP_003316117.1".
- ^ "NCBI Protein: NP_001124814.1".
- ^ "NCBI Protein: XP_004060075.1".
- ^ "NCBI Protein: XP_002761800.1".
- ^ "NCBI Protein: BAA92792764.1".
- ^ "NCBI Nucleotide: XP_003760487.1".
- ^ "NCBI Nucleotide: AFJ51753.1".
- ^ "NCBI Nucleotide: NP_001037942.1".