SNORD24

SNORD24
Identifikatori
Aliasi	SNORD24
Vanjski ID-jevi	GeneCards: SNORD24
Lokacija gena (čovjek)
Hrom.	Hromosom 9 (čovjek)
Kraj	133,349,470 bp
Ortolozi
	26820
	n/a
	ENSG00000206611; ENSG00000280889
	n/a
	n; a
	n/a
	n/a
	n/a
	n/a
	n/a
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Mala C/D kutijska nukleolusna RNK 24 je protein koji je kod ljudi kodiran genom SNORD24, na hromosomu 9.^[3]

Prema računarskim pretraživanjima banaka sekvenci, u jednoj studiji pozitivno su identificirali novu intronsku snoRNK, U24, kodiranu u genu ribosomnog proteina L7a kod ljudi i kokošo. Kao i ranije prijavljene intronske snoRNK, U24 je lišen 5'-trimetil-kapice. U24 je imunoprecipitiran antifibrilarinskim antitijelom i pokazuje isključivo jedolarnu lokalizaciju u fluorescentnom mikroskopijom nakon in situ hibridizacije s antisensnim oligonukleotidima. U kičmenjaka, U24 je 76 nt duga konzervirana RNK koja je metabolički stabilna, prisutna u približno 14 000 molekula po ljudskoj HeLa ćeliji.

U24 ima 5'-3 'terminalnu C-kutiju D-strukture sa matičnim kutijama, tipsku za nekoliko snoRNK i sadrži dvije 12 nt duge konzervirane sekvence komplementarne 28S rRNK. Stoga je izrazito povezana sa U14, U20 i U21 snoRNK koje također posjeduju duge sekvence komplementarne sa konzerviranim sekvencama zrelih 18S ili 28S rRNK. U 28S rRNK dva trakta koja su komplementarna U24 susjedna su, uključujući nekoliko metiliranih nukleotida i iznenađujuće su blizu, unutar sekundarne strukture rRNK, komplementarnosti snoRNK U18 i U21. Identifikacija gena U24 kvasca Saccharomyces cerevisiae izravno potvrđuje izvanrednu konzerviranost komplementarnosti s 28S rRNK tokom evolucije, ukazujući na ključnu ulogu uparivanja U24 s pre-rRNK u procesu biogeneze ribosoma, što je moguće u kontroli savijanja pre-rRNK. U24 S.cerevisiae je također kodiran intronom, ali nije u istom genu domaćinu kao kod ljudi ili kokoši.^[4]

Reference

^ ^a ^b ^c ENSG00000280889 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000206611, ENSG00000280889 - Ensembl, maj 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: Small nucleolar RNA, C/D box 24".
^ L H Qu, Y Henry, M Nicoloso, B Michot, M C Azum, M H Renalier, M Caizergues-Ferrer, J P Bachellerie (1995): U24, a novel intron-encoded small nucleolar RNA with two 12 nt long, phylogenetically conserved complementarities to 28S rRNA. Nucleic Acids Res. 23(14):2669-76; pmid: 7651828: pmcid: pmc307091; doi: 10.1093/nar/23.14.2669

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000280889 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000206611, ENSG00000280889 - Ensembl, maj 2017

[2] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-3] "Entrez Gene: Small nucleolar RNA, C/D box 24".

[4] L H Qu, Y Henry, M Nicoloso, B Michot, M C Azum, M H Renalier, M Caizergues-Ferrer, J P Bachellerie (1995): U24, a novel intron-encoded small nucleolar RNA with two 12 nt long, phylogenetically conserved complementarities to 28S rRNA. Nucleic Acids Res. 23(14):2669-76; pmid: 7651828: pmcid: pmc307091; doi: 10.1093/nar/23.14.2669

[1]

[2]

[3]

[4]