ATG4D
Ljudski gen ATG4D kodira protein cistein peptidaza s autofagijom 4D.[5]
Aminokiselinska sekvenca kodiranog proteina
[uredi | uredi izvor]- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNSVSPAAAQ | YRSSSPEDAR | RRPEARRPRG | PRGPDPNGLG | PSGASGPALG | ||||
SPGAGPSEPD | EVDKFKAKFL | TAWNNVKYGW | VVKSRTSFSK | ISSIHLCGRR | ||||
YRFEGEGDIQ | RFQRDFVSRL | WLTYRRDFPP | LPGGCLTSDC | GWGCMLRSGQ | ||||
MMLAQGLLLH | FLPRDWTWAE | GMGLGPPELS | GSASPSRYHG | PARWMPPRWA | ||||
QGAPELEQER | RHRQIVSWFA | DHPRAPFGLH | RLVELGQSSG | KKAGDWYGPS | ||||
LVAHILRKAV | ESCSDVTRLV | VYVSQDCTVY | KADVARLVAR | PDPTAEWKSV | ||||
VILVPVRLGG | ETLNPVYVPC | VKELLRCELC | LGIMGGKPRH | SLYFIGYQDD | ||||
FLLYLDPHYC | QPTVDVSQAD | FPLESFHCTS | PRKMAFAKMD | PSCTVGFYAG | ||||
DRKEFETLCS | ELTRVLSSSS | ATERYPMFTL | AEGHAQDHSL | DDLCSQLAQP | ||||
TLRLPRTGRL | LRAKRPSSED | FVFL |
Funkcija
[uredi | uredi izvor]Autofagija je proces kojim se endogeni proteini i oštećene organele uništavaju unutarćelijski. Pretpostavlja se da je autofagija bitna za ćelijsku homeostazu ljudi i preuređivanje ćelija tokom diferencijacije, metamorfoze, neapoptotske ćelijske smrti i starenja. Smanjeni nivoi autofagije opisani su kod nekih malignih tumora, a predložena je uloga autofagije i u kontroli nereguliranog rasta ćelija povezanog sa kancerom.
Ovaj gen pripada porodici proteina 4 (Atg4) koja je povezana sa autofagnih C54 endopeptidaza. Članovi ove porodice kodiraju proteine koji imaju ulogu u biogenezi autofagosoma, koji odvajaju citosol i organele za razgradnju pomoću lizosoma. Prerada rezultira višestrukim varijantama transkripata. [prema RefSeq, juli 2013.].
Reference
[uredi | uredi izvor]- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000130734 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000002820 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: Autophagy related 4D, cysteine peptidase".
Dopunska literatura
[uredi | uredi izvor]- Betin VM, MacVicar TD, Parsons SF, Anstee DJ, Lane JD (april 2012). "A cryptic mitochondrial targeting motif in Atg4D links caspase cleavage with mitochondrial import and oxidative stress". Autophagy. 8 (4): 664–76. doi:10.4161/auto.19227. PMC 3405841. PMID 22441018.
- Betin VM, Lane JD (juli 2009). "Caspase cleavage of Atg4D stimulates GABARAP-L1 processing and triggers mitochondrial targeting and apoptosis". Journal of Cell Science. 122 (Pt 14): 2554–66. doi:10.1242/jcs.046250. PMC 2704886. PMID 19549685.
- Mariño G, Uría JA, Puente XS, Quesada V, Bordallo J, López-Otín C (februar 2003). "Human autophagins, a family of cysteine proteinases potentially implicated in cell degradation by autophagy". The Journal of Biological Chemistry. 278 (6): 3671–8. doi:10.1074/jbc.M208247200. PMID 12446702.