PTPRR

PTPRR
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2A8B
Ідентифікатори
Символи	PTPRR, EC-PTP, PCPTP1, PTP-SL, PTPBR7, PTPRQ, protein tyrosine phosphatase, receptor type R, protein tyrosine phosphatase receptor type R
Зовнішні ІД	OMIM: 602853 MGI: 109559 HomoloGene: 2135 GeneCards: PTPRR
Пов'язані генетичні захворювання
	аметропія
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoprotein phosphatase activity; • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein tyrosine phosphatase activity; • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; • protein kinase binding; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • міжклітинні контакти; • perinuclear region of cytoplasm; • міжклітинний простір; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• GO:0016576 protein dephosphorylation; • in utero embryonic development; • ERBB2 signaling pathway; • regulation of homophilic cell adhesion; • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • negative regulation of epithelial cell migration; • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5801
	19279
	ENSG00000153233
	ENSMUSG00000020151
	Q15256
	Q62132
	NM_001207015; NM_001207016; NM_002849; NM_130846
NM_001161837; NM_001161838; NM_001161839; NM_001161840; NM_011217;
	NM_001358484
	NP_001193944; NP_001193945; NP_002840; NP_570897
NP_001155309; NP_001155310; NP_001155311; NP_001155312; NP_035347;
	NP_001345413
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPRR (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type R) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 657 амінокислот, а молекулярна маса — 73 834^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRRAVCFPAL	CLLLNLHAAG	CFSGNNDHFL	AINQKKSGKP	VFIYKHSQDI
EKSLDIAPQK	IYRHSYHSSS	EAQVSKRHQI	VNSAFPRPAY	DPSLNLLAMD
GQDLEVENLP	IPAANVIVVT	LQMDVNKLNI	TLLRIFRQGV	AAALGLLPQQ
VHINRLIGKK	NSIELFVSPI	NRKTGISDAL	PSEEVLRSLN	INVLHQSLSQ
FGITEVSPEK	NVLQGQHEAD	KIWSKEGFYA	VVIFLSIFVI	IVTCLMILYR
LKERFQLSLR	QDKEKNQEIH	LSPITLQPAL	SEAKTVHSMV	QPEQAPKVLN
VVVDPQGRGA	PEIKATTATS	VCPSPFKMKP	IGLQERRGSN	VSLTLDMSSL
GNIEPFVSIP	TPREKVAMEY	LQSASRILTR	SQLRDVVASS	HLLQSEFMEI
PMNFVDPKEI	DIPRHGTKNR	YKTILPNPLS	RVCLRPKNVT	DSLSTYINAN
YIRGYSGKEK	AFIATQGPMI	NTVDDFWQMV	WQEDSPVIVM	ITKLKEKNEK
CVLYWPEKRG	IYGKVEVLVI	SVNECDNYTI	RNLVLKQGSH	TQHVKHYWYT
SWPDHKTPDS	AQPLLQLMLD	VEEDRLASQG	RGPVVVHCSA	GIGRTGCFIA
TSIGCQQLKE	EGVVDALSIV	CQLRMDRGGM	VQTSEQYEFV	HHALCLYESR
LSAETVQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

Shiozuka K., Watanabe Y., Ikeda T., Hashimoto S., Kawashima H. (1995). Cloning and expression of PCPTP1 encoding protein tyrosine phosphatase. Gene. 162: 279—284. PMID 7557444 DOI:10.1016/0378-1119(95)00306-Q
Bektas A., Hughes J.N., Warram J.H., Krolewski A.S., Doria A. (2001). Type 2 diabetes locus on 12q15: further mapping and mutation screening of two candidate genes. Diabetes. 50: 204—208. PMID 11147789 DOI:10.2337/diabetes.50.1.204

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PTPRR переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9680 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q15256 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PTPRR переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9680 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q15256 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

PTPRR

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук