SSBP1

SSBP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1S3O, 2DUD, 3ULL
Ідентифікатори
Символи	SSBP1, Mt-SSB, SOSS-B1, SSBP, mtSSB, single stranded DNA binding protein 1, OPA13
Зовнішні ІД	OMIM: 600439 MGI: 1920040 HomoloGene: 74462 GeneCards: SSBP1
Пов'язані генетичні захворювання
	optic atrophy with negative Electroretinograms
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • single-stranded DNA binding; • chromatin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• мітохондріальний матрикс; • mitochondrial nucleoid; • екзосома; • мітохондрія; • клітинне ядро; • нуклеоїд;
Біологічний процес	• реплікація ДНК; • mitochondrion organization; • mitochondrion morphogenesis; • positive regulation of helicase activity; • mitochondrial DNA replication;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6742
	381760
	ENSG00000262771; ENSG00000106028
	ENSMUSG00000029911
	Q04837
	Q9CYR0
	NM_001256510; NM_001256511; NM_001256512; NM_001256513; NM_003143
	NM_001286663; NM_028358; NM_212468; NM_001364578
	NP_001243439; NP_001243440; NP_001243441; NP_001243442; NP_003134
	NP_001273592; NP_082634; NP_997633; NP_001351507
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SSBP1 (англ. Single stranded DNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 148 амінокислот, а молекулярна маса — 17 260^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFRRPVLQVL	RQFVRHESET	TTSLVLERSL	NRVHLLGRVG	QDPVLRQVEG
KNPVTIFSLA	TNEMWRSGDS	EVYQLGDVSQ	KTTWHRISVF	RPGLRDVAYQ
YVKKGSRIYL	EGKIDYGEYM	DKNNVRRQAT	TIIADNIIFL	SDQTKEKE

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як реплікація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у мітохондрії, мітохондріальному нуклеоїді.

Література

Tiranti V., Rocchi M., Didonato S., Zeviani M. (1993). Cloning of human and rat cDNAs encoding the mitochondrial single-stranded DNA-binding protein (SSB). Gene. 126: 219—225. PMID 8482537 DOI:10.1016/0378-1119(93)90370-I
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Xu G., Shin S.B., Jaffrey S.R. (2009). Global profiling of protease cleavage sites by chemoselective labeling of protein N-termini. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106: 19310—19315. PMID 19892738 DOI:10.1073/pnas.0908958106
Bogenhagen D.F., Rousseau D., Burke S. (2008). The layered structure of human mitochondrial DNA nucleoids. J. Biol. Chem. 283: 3665—3675. PMID 18063578 DOI:10.1074/jbc.M708444200
van Loon B., Samson L.D. (2013). Alkyladenine DNA glycosylase (AAG) localizes to mitochondria and interacts with mitochondrial single-stranded binding protein (mtSSB). DNA Repair. 12: 177—187. PMID 23290262 DOI:10.1016/j.dnarep.2012.11.009
Yang C., Curth U., Urbanke C., Kang C. (1997). Crystal structure of human mitochondrial single-stranded DNA binding protein at 2.4-A resolution. Nat. Struct. Biol. 4: 153—157. PMID 9033597 DOI:10.1038/nsb0297-153

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SSBP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11317 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q04837 (англ.) . Архів оригіналу за 4 грудня 2016. Процитовано 28 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з SSBP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11317 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q04837 (англ.) . Архів оригіналу за 4 грудня 2016. Процитовано 28 лютого 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

SSBP1

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук