Тромбін

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
(Перенаправлено з F2)
Перейти до навігації Перейти до пошуку
Тромбін
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи F2, PT, RPRGL2, THPH1, coagulation factor II, thrombin
Зовнішні ІД OMIM: 176930 MGI: 88380 HomoloGene: 426 GeneCards: F2
Пов'язані генетичні захворювання
hypoprothrombinemia, thrombophilia[1]
Реагує на сполуку
Дабігатран, ximelagatran, dabigatran etexilate, argatroban[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_000506
NM_001311257
NM_010168
RefSeq (білок)
NP_000497
NP_034298
Локус (UCSC) Хр. 11: 46.72 – 46.74 Mb Хр. 2: 91.46 – 91.47 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Тромбін в комплексі з інгібітором

Тромбін (активований фактор зсідання крові II, fibrinogenase, thrombase, thrombofort, topical, thrombin-C, tropostasin, activated blood-coagulation factor II, blood-coagulation factor IIa, factor IIa, E thrombin, beta-thrombin, gamma-thrombin) — білок, який кодується геном F2, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[5][6] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 622 амінокислот, а молекулярна маса — 70 037[7]. Тромбін - важливий компонент системи згортання крові людини і тварин. Тромбін (КФ 3.4.21.5[8]) відноситься до ферментів класу гідролаз, групи серинових протеаз, та каталізує гідроліз пептидних зв'язків, утворених залишками аргініну і лізину (має обмежену субстратну специфічність).

Послідовність амінокислот
1020304050
MAHVRGLQLPGCLALAALCSLVHSQHVFLAPQQARSLLQRVRRANTFLEE
VRKGNLERECVEETCSYEEAFEALESSTATDVFWAKYTACETARTPRDKL
AACLEGNCAEGLGTNYRGHVNITRSGIECQLWRSRYPHKPEINSTTHPGA
DLQENFCRNPDSSTTGPWCYTTDPTVRRQECSIPVCGQDQVTVAMTPRSE
GSSVNLSPPLEQCVPDRGQQYQGRLAVTTHGLPCLAWASAQAKALSKHQD
FNSAVQLVENFCRNPDGDEEGVWCYVAGKPGDFGYCDLNYCEEAVEEETG
DGLDEDSDRAIEGRTATSEYQTFFNPRTFGSGEADCGLRPLFEKKSLEDK
TERELLESYIDGRIVEGSDAEIGMSPWQVMLFRKSPQELLCGASLISDRW
VLTAAHCLLYPPWDKNFTENDLLVRIGKHSRTRYERNIEKISMLEKIYIH
PRYNWRENLDRDIALMKLKKPVAFSDYIHPVCLPDRETAASLLQAGYKGR
VTGWGNLKETWTANVGKGQPSVLQVVNLPIVERPVCKDSTRIRITDNMFC
AGYKPDEGKRGDACEGDSGGPFVMKSPFNNRWYQMGIVSWGEGCDRDGKY
GFYTHVFRLKKWIQKVIDQFGE

Цей білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як зсідання крові, гемостаз, гостра фаза запалення. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Секретований назовні.

Див. також

[ред. | ред. код]

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з Тромбін переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з тромбін переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3535 (англ.) . Процитовано 5 жовтня 2018.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  6. Royle NJ, Irwin DM, Koschinsky ML, MacGillivray RT, Hamerton JL (May 1987). Human genes encoding prothrombin and ceruloplasmin map to 11p11-q12 and 3q21-24, respectively. Somat. Cell Mol. Genet. 13 (3): 285—92. doi:10.1007/BF01535211. PMID 3474786.
  7. UniProt, P00734 (англ.) . Процитовано 5 жовтня 2018.
  8. 3.4.21.5(англ.)

Література

[ред. | ред. код]
  • Degen S.J.F., Davie E.W. (1987). Nucleotide sequence of the gene for human prothrombin. Biochemistry. 26: 6165—6177. PMID 2825773 DOI:10.1021/bi00393a033
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Degen S.J.F., McGillivray R.T.A., Davie E.W. (1983). Characterization of the complementary deoxyribonucleic acid and gene coding for human prothrombin. Biochemistry. 22: 2087—2097. PMID 6305407 DOI:10.1021/bi00278a008
  • Walz D.A., Hewett-Emmett D., Seegers W.H. (1977). Amino acid sequence of human prothrombin fragments 1 and 2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 74: 1969—1972. PMID 266717 DOI:10.1073/pnas.74.5.1969
  • Casas J.P., Hingorani A.D., Bautista L.E., Sharma P. (2004). Meta-analysis of genetic studies in ischemic stroke: thirty-two genes involving approximately 18,000 cases and 58,000 controls. Arch. Neurol. 61: 1652—1661. PMID 15534175 DOI:10.1001/archneur.61.11.1652
  • Bunkenborg J., Pilch B.J., Podtelejnikov A.V., Wisniewski J.R. (2004). Screening for N-glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry. Proteomics. 4: 454—465. PMID 14760718 DOI:10.1002/pmic.200300556