DHX16

DHX16
Ідентифікатори
Символи	DHX16, DBP2, DDX16, PRO2014, PRP8, PRPF2, Prp2, DEAH-box helicase 16, NMOAS
Зовнішні ІД	OMIM: 603405 MGI: 1916442 HomoloGene: 2658 GeneCards: DHX16
Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA helicase activity; • nucleotide binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ATP binding; • GO:0008026 helicase activity; • hydrolase activity; • nucleic acid binding; • ATPase activity; • RNA binding; • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity;
Клітинна компонента	• spliceosomal complex; • клітинне ядро; • цитоплазма; • нуклеоплазма; • U2-type precatalytic spliceosome;
Біологічний процес	• mRNA processing; • Сплайсинг РНК; • mRNA splicing, via spliceosome; • обмін речовин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	8449
	69192
ENSG00000233561; ENSG00000206486; ENSG00000233418; ENSG00000231377; ENSG00000227222;
	ENSG00000204560; ENSG00000233049; ENSG00000226171
	ENSMUSG00000024422
	O60231; Q5SQH5
	н/д
	NM_001164239; NM_003587; NM_001363515
	NM_026987
	NP_001157711; NP_003578; NP_001350444
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DHX16 (англ. DEAH-box helicase 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 041 амінокислот, а молекулярна маса — 119 264^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATPAGLERW	VQDELHSVLG	LSERHVAQFL	IGTAQRCTSA	EEFVQRLRDT
DTLDLSGPAR	DFALRLWNKV	PRKAVVEKPA	RAAEREARAL	LEKNRSYRLL
EDSEESSEET	VSRAGSSLQK	KRKKRKHLRK	KREEEEEEEA	SEKGKKKTGG
SKQQTEKPES	EDEWERTERE	RLQDLEERDA	FAERVRQRDK	DRTRNVLERS
DKKAYEEAQK	RLKMAEEDRK	AMVPELRKKS	RREYLAKRER	EKLEDLEAEL
ADEEFLFGDV	ELSRHERQEL	KYKRRVRDLA	REYRAAGEQE	KLEATNRYHM
PKETRGQPAR	AVDLVEEESG	APGEEQRRWE	EARLGAASLK	FGARDAASQE
PKYQLVLEEE	ETIEFVRATQ	LQGDEEPSAP	PTSTQAQQKE	SIQAVRRSLP
VFPFREELLA	AIANHQVLII	EGETGSGKTT	QIPQYLFEEG	YTNKGMKIAC
TQPRRVAAMS	VAARVAREMG	VKLGNEVGYS	IRFEDCTSER	TVLRYMTDGM
LLREFLSEPD	LASYSVVMVD	EAHERTLHTD	ILFGLIKDVA	RFRPELKVLV
ASATMDTARF	STFFDDAPVF	RIPGRRFPVD	IFYTKAPEAD	YLEACVVSVL
QIHVTQPPGD	ILVFLTGQEE	IEAACEMLQD	RCRRLGSKIR	ELLVLPIYAN
LPSDMQARIF	QPTPPGARKV	VVATNIAETS	LTIEGIIYVL	DPGFCKQKSY
NPRTGMESLT	VTPCSKASAN	QRAGRAGRVA	AGKCFRLYTA	WAYQHELEET
TVPEIQRTSL	GNVVLLLKSL	GIHDLMHFDF	LDPPPYETLL	LALEQLYALG
ALNHLGELTT	SGRKMAELPV	DPMLSKMILA	SEKYSCSEEI	LTVAAMLSVN
NSIFYRPKDK	VVHADNARVN	FFLPGGDHLV	LLNVYTQWAE	SGYSSQWCYE
NFVQFRSMRR	ARDVREQLEG	LLERVEVGLS	SCQGDYIRVR	KAITAGYFYH
TARLTRSGYR	TVKQQQTVFI	HPNSSLFEQQ	PRWLLYHELV	LTTKEFMRQV
LEIESSWLLE	VAPHYYKAKE	LEDPHAKKMP	KKIGKTREEL	G

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2739 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O60231 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2739 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, O60231 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

DHX16

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук