János Zsigmond Zápolya henüz bir bebek iken Macar asıllı babası János Zápolya'nın yerine Macar tahtına, Osmanlı Padişahı I. Süleyman tarafından geçirilmiştir. O büyüyene kadar ülkeyi, naibe sıfatıyla Leh asıllı annesi Izabela Jagiellonka yönetmiştir.[2] Saltanatının ilk yıllarından bu zamana Izabela ve babasının baş danışmanı George Martinuzzi, Macar-Türk ortak çıkarları doğrultusunda yönetimde söz sahibi olmuşlardır. Aynı zamanda bir din adamı olan Martinuzzi 1551 yılında Avusturyalılar tarafından haince öldürülmüştür. Osmanlı Padişahı Süleyman, János Zápolya'nın oğlu için Avrupa'ya sefere bile çıkmıştır.[3] Zsigmond, Avrupa (1568) modern tarihinde, din özgürlüğünün ilk geniş kararnamesini ilan eden kişi olarak tarihe geçmiştir.[4] Ayrıca Transilvanya Üniteryen Kilisesi'nin kurulmasını da desteklemiştir. János, tüm dinler arası diyaloğu teşvik etmiştir. Yine, Katolikler, Lutherciler, Kalvinistler ve Unitaryanlar arasındaki diyaloğu da desteklemiş, bununla birlikte Yahudiler, Ortodokslar ve Müslümanlar dâhil olmak üzere diğer tüm dinî gruplara hoşgörü açısından yasal teminat vermiştir.[5] 1570 yılında Habsburglar lehine Krallıktan çekilmiş, kendisine Transilvanya (1570-1571) Prensliği verilmiştir. 1571 yılında ölmüştür.[6]
