軍事海上輸送司令部(ぐんじかいじょうゆそうしれいぶ、Military Sealift Command、略称:MSC)は、アメリカ海軍の組織の1つ。部隊管理系統ではアメリカ艦隊総軍(USFLTFORCOM)の、作戦系統ではアメリカ輸送軍(USTRANSCOM)の指揮をそれぞれ受ける。司令部はワシントンD.C.のネイビーヤードに所在する。