軍事海上輸送司令部（ぐんじかいじょうゆそうしれいぶ、Military Sealift Command、略称：MSC）は、アメリカ海軍の組織の１つ。部隊管理系統ではアメリカ艦隊総軍（USFLTFORCOM）の、作戦系統ではアメリカ輸送軍（USTRANSCOM）の指揮をそれぞれ受ける。司令部はワシントンD.C.のネイビーヤードに所在する。