ウイルスの進化（ウイルスのしんか、英語:Viral evolution）は、進化生物学とウイルス学のサブフィールドであり、特にウイルスの進化に関心を持つ領域である。ウイルスの世代時間は短く、多くのウイルス（特にRNAウイルス）の突然変異率は相対的に高い。この高い突然変異率と自然淘汰とが組み合わさることによってウイルスは宿主の環境の変化に迅速に適応する。ほとんどのウイルスは多くの子孫を残し、変異した遺伝子は多くの子孫に渡されていく。