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- L'exométabolomique, également appelée « empreinte métabolique » (metabolic footprinting en anglais), est une discipline qui étudie les métabolites extracellulaires, et constitue un sous-domaine de la métabolomique. Alors que les mêmes approches analytiques utilisées pour identifier des profils de métabolites s'appliquent à l'exométabolomique, telles que la chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse (LC-MS en anglais), la résonance magnétique nucléaire (RMN) ou la chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse (GC-MS en anglais), l'analyse des exométabolites soulève des défis particuliers et se focalise le plus généralement sur l'étude des transformations de groupes de métabolites exogènes par des systèmes biologiques. Typiquement, ces expériences sont effectuées en comparant des métabolites à deux ou plusieurs points temporels, par exemple entre un milieu de culture ayant subi une certaine évolution et un autre n'ayant pas été inoculé, ou de contrôle ; cette approche peut permettre de distinguer différents états physiologiques d'une souche sauvage de levure et entre des levures mutantes. Puisque, dans beaucoup de cas, le groupe d'exométabolites (extracellulaire) est moins dynamique que les groupes d'endométabolites (intracellulaires, qui sont souvent perturbés lors de l'échantillonnage), et que des milieux définis chimiquement (milieux de culture in vitro adaptés aux cellules humaines ou animales dans lesquels tous les composés chimiques sont connus) peuvent être utilisés, alors cela réduit le nombre de défis de la métabolomique. L'exométabolomique est également utilisée comme outil complémentaire aux données issues de la génomique, la transcriptomique et la protéomique, afin d'avoir un meilleur aperçu des fonctions des gènes et des voies métaboliques. De plus, l'exométabolomique peut être utilisée pour quantifier les molécules polaires étant consommées ou sécrétées par un organisme, ainsi que pour mesurer la production de métabolites secondaires. (fr)
- L'exométabolomique, également appelée « empreinte métabolique » (metabolic footprinting en anglais), est une discipline qui étudie les métabolites extracellulaires, et constitue un sous-domaine de la métabolomique. Alors que les mêmes approches analytiques utilisées pour identifier des profils de métabolites s'appliquent à l'exométabolomique, telles que la chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse (LC-MS en anglais), la résonance magnétique nucléaire (RMN) ou la chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse (GC-MS en anglais), l'analyse des exométabolites soulève des défis particuliers et se focalise le plus généralement sur l'étude des transformations de groupes de métabolites exogènes par des systèmes biologiques. Typiquement, ces expériences sont effectuées en comparant des métabolites à deux ou plusieurs points temporels, par exemple entre un milieu de culture ayant subi une certaine évolution et un autre n'ayant pas été inoculé, ou de contrôle ; cette approche peut permettre de distinguer différents états physiologiques d'une souche sauvage de levure et entre des levures mutantes. Puisque, dans beaucoup de cas, le groupe d'exométabolites (extracellulaire) est moins dynamique que les groupes d'endométabolites (intracellulaires, qui sont souvent perturbés lors de l'échantillonnage), et que des milieux définis chimiquement (milieux de culture in vitro adaptés aux cellules humaines ou animales dans lesquels tous les composés chimiques sont connus) peuvent être utilisés, alors cela réduit le nombre de défis de la métabolomique. L'exométabolomique est également utilisée comme outil complémentaire aux données issues de la génomique, la transcriptomique et la protéomique, afin d'avoir un meilleur aperçu des fonctions des gènes et des voies métaboliques. De plus, l'exométabolomique peut être utilisée pour quantifier les molécules polaires étant consommées ou sécrétées par un organisme, ainsi que pour mesurer la production de métabolites secondaires. (fr)
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- L'exométabolomique, également appelée « empreinte métabolique » (metabolic footprinting en anglais), est une discipline qui étudie les métabolites extracellulaires, et constitue un sous-domaine de la métabolomique. (fr)
- L'exométabolomique, également appelée « empreinte métabolique » (metabolic footprinting en anglais), est une discipline qui étudie les métabolites extracellulaires, et constitue un sous-domaine de la métabolomique. (fr)
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