[go: up one dir, main page]

About: Aptamer

An Entity of Type: chemical compound, from Named Graph: http://dbpedia.org, within Data Space: dbpedia.org

Aptamers are short sequences of artificial DNA or RNA that bind a specific target molecule. Like antibodies, which are used for similar purposes in biotechnology and medicine, they can show strong binding to their target, with little or no off-target binding. To highlight how they are similar to and different from antibodies, aptamers are sometimes called chemical antibodies. Aptamers and antibodies can be used in many of the same tasks, but the nucleic acid-based structure of aptamers, which are mostly oligonucleotides, is very different from the amino acid-based structure of antibodies, which are proteins. This difference can make aptamers a better choice than antibodies for some purposes (see ).

Property Value
dbo:abstract
  • الأبتمرات (بالإنجليزية: Aptamers)‏ هي عبارة عن سلسلة حمض نووي قصيرة أو جزيئات ببتيدية والتي تشكل رابطة مع جزئ معين. يتم الحصول على هذه الأبتمرات عن طريق أخذها بشكل عشوائي من مناطق تجمع الأحماض النووية، ويمكن العثور على الأبتمرات بشكل طبيعي في جزء من الحمض النووي المراسل ويدعى بـ (رايبوس ويتش). تستخدم الأبتمرات في الأبحاث الأولية أو الأساسية وأيضا تستعمل لأأغراض مخبرية مثل صناعة الأدوية. من الممكن ربط الأبتمرات بالرايبوسومات، الأمر الذي يؤدي لانفساخ ذاتي عند وجود الجزي المطلوب. هذه المركبات الجزيئية لها - بالإضافة لما سبق - استعمالات للأغراض البحثية، الصناعية والمخبرية. وبمزيد من الدقة، يمكن تصنيف الأبتمرات حسب التالي: * أبتمرات الحمض النووي المنقوص أو الحمض النووي الرايبوزي. وتتكون من (قصيرة عادة) سلسة ألياف أحماض نووية أو جزيئات ببتيدية. * أبتمرات ببتيدية. وتتكون من نطاق واسع من الببتيدات، والتي بدورها مرتبطة من كلتا نهايتيها الاثنتين بمنصة بروتينات. (ar)
  • Els aptàmers (del llatí aptus - encaixar, i el grec meros - part) són oligonucleòtids (petits fragments d'àcids nucleics) o pèptids (petits fragments de proteïna) que s'uneixen a una molècula diana específica. Es solen obtenir mitjançant la selecció a partir de grans col·leccions de seqüències aleatòries, si bé també existeixen aptàmers naturals en els anomenats . Poden ser emprats tant en recerca bàsica com per a aplicacions clíniques com a fàrmacs macromoleculars. Els aptàmers poden ser combinats amb ribozims per autofragmentar-se en presència de la molècula diana. Aquestes molècules compostes tenen aplicacions industrials, clíniques i de recerca addicionals. Els aptàmers poden classificar-se en: * Aptàmers de DNA, RNA o XNA. Consisteixen en cadenes d'oligonucleòtids generalment curtes. * Aptàmers peptídics. Consisteixen en un domini peptídic variable curt, unit pels dos extrems a un scaffold proteic. (ca)
  • Aptamers are short sequences of artificial DNA or RNA that bind a specific target molecule. Like antibodies, which are used for similar purposes in biotechnology and medicine, they can show strong binding to their target, with little or no off-target binding. To highlight how they are similar to and different from antibodies, aptamers are sometimes called chemical antibodies. Aptamers and antibodies can be used in many of the same tasks, but the nucleic acid-based structure of aptamers, which are mostly oligonucleotides, is very different from the amino acid-based structure of antibodies, which are proteins. This difference can make aptamers a better choice than antibodies for some purposes (see ). Aptamers are used in biological lab research and medical tests. If multiple aptamers are combined into a single assay, they can measure large numbers of different proteins in a sample. They can be used to identify molecular markers of disease, or can function as drugs, drug delivery systems and controlled drug release systems. They also find use in other molecular engineering tasks. Most aptamers originate from SELEX (Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment), a family of test-tube experiments for finding useful aptamers in a massive pool of different DNA sequences. This process is much like natural selection, directed evolution or artificial selection. In SELEX, the researcher repeatedly selects for the best aptamers from a starting DNA library made of about a quadrillion different randomly generated pieces of DNA or RNA. After SELEX, the researcher might mutate or change the chemistry of the aptamers and do another selection, or might use rational design processes to engineer improvements. Non-SELEX methods for discovering aptamers also exist. FRELEX is one such alternative method. FRELEX was developed in 2016 by NeoVentures Biotechnology Inc to allow the selection of aptamers without immobilizing the target or the oligonucleotide library. Immobilization is a necessary component of SELEX; however, it has the potential to inhibit key epitopes, and thus weaken the likelihood of successful binding, particularly when working with small molecules. FRELEX follows a similar overall methodology to SELEX; however, instead of immobilizing the target, the researcher introduces a series of random and blocker oligonucleotides to an immobilization field before introduction to the target. This allows the researcher to better target small molecules that may be lost during partitioning. It also can be used in some circumstances to select an aptamer library without knowing the target. Researchers optimize aptamers to achieve a variety of beneficial features. The most important feature is specific and sensitive binding to the chosen target. When aptamers are exposed to bodily fluids, as in serum tests or aptamer therapeutics, it is often important for them to resist digestion by DNA- and RNA-destroying proteins. Therapeutic aptamers often must be modified to clear slowly from the body. Aptamers that change their shape dramatically when they bind their target are useful as molecular switches to turn a sensor on and off. Some aptamers are engineered to fit into a biosensor or in a test of a biological sample. It can be useful in some cases for the aptamer to accomplish a pre-defined level or speed of binding. As the yield of the synthesis used to produce known aptamers shrinks quickly for longer sequences, researchers often truncate aptamers to the minimal binding sequence to reduce the production cost. (en)
  • Aptamere (von lateinisch aptus ‚passen‘ und griechisch meros ‚Teil‘) sind kurze einzelsträngige DNA- oder RNA-Oligonukleotide (25–70 Basen) beziehungsweise Peptide, die ein spezifisches Molekül über ihre 3D-Struktur binden können. Ist das Aptamer ein Peptid, so spricht man von einem Peptid-Aptamer. (de)
  • Los aptámeros son ácidos nucleicos de cadena sencilla (ssDNA y RNA), aislados de genotecas de oligonucleótidos por selección in vitro, mediante enriquecimiento exponencial en presencia del ligando (método SELEX), denominados anticuerpos químicos (del inglés chemical antibodies). (es)
  • Un aptamère est un oligonucléotide synthétique, le plus souvent un ARN qui est capable de fixer un ligand spécifique et parfois de catalyser une réaction chimique sur ce ligand. Les aptamères sont en général des composés synthétiques, isolés in vitro à partir de banques combinatoires d'un grand nombre de composés de séquence aléatoire par une méthode de sélection itérative appelée SELEX. (fr)
  • アプタマー(Aptamer)とは、特定の分子と特異的に結合する核酸分子やペプチドである。通常ランダム配列の巨大ライブラリ中から選び出してくるが、自然界にも存在しておりリボスイッチとして知られている。基礎から薬剤探索などの応用まで幅広く研究されている。リボザイムと複合化したアプタマーも存在しており、ターゲット分子存在下で自己開裂するものが知られている。大きく分けると核酸(DNA・RNA)アプタマー、ペプチドアプタマーの2種に分類される。 (ja)
  • Gli aptameri sono acidi nucleici aventi la proprietà di legarsi ad una molecola o ad una proteina.I primi aptameri sono stati isolati all'inizio degli anni '90, nei laboratori di Jack W. Szostak e . La tecnica utilizzata è stata soprannominata SELEX. Si tratta di una tecnica che permette di selezionare, all'interno di una grande quantità di acidi nucleici aventi diverse sequenze, gli acidi nucleici che si legano alla molecola desiderata. Una volta selezionati, le sequenze "vincitrici" vengono amplificate, di solito a livello di DNA, mediante PCR. Attraverso diversi cicli di selezione e amplificazione, gli aptameri dalle proprietà desiderate vengono isolati. Fino al 2011, tutti gli aptameri conosciuti erano formati da RNA o DNA, dato che solamente sequenze di DNA o RNA potevano essere amplificate con tecniche note di biologia molecolare. Nel 2011, lo sviluppo di enzimi che permettono di copiare sequenze di acidi nucleici artificiali hanno permesso lo sviluppo di aptameri costituiti da acido treonucleico (TNA) e HNA (hexose nucleic acid). (it)
  • Een aptameer (afgeleid van het Latijnse woord apto: 'passen') is een RNA- of DNA-molecuul dat zeer specifiek aan een bepaald ligand kan binden. Het ligand verschilt per aptameer en is in veel gevallen een eiwit of een oligopeptide, maar kan ook een ion of een suikermolecuul of iets heel anders zijn. Als het aptameer zijn ligand bindt, ondergaat het een conformatieverandering. Aptameren komen in de natuur voor maar kunnen ook chemisch geproduceerd worden. Ze worden gebruikt in fundamenteel onderzoek en voor medische en industriële doeleinden. (nl)
  • Aptamery − oligonukleotydy (krótkie fragmenty DNA lub RNA) lub peptydy, które wiążą się specyficznie z określoną cząsteczką. Aptamery występują w ryboprzełącznikach. Można je też uzyskiwać sztucznie selekcjonując z puli o losowych sekwencjach takie, które wiążą docelową cząsteczkę najmocniej lub najbardziej specyficznie. (pl)
  • Аптамеры — олигонуклеотидные или пептидные молекулы, специфически связывающиеся с определёнными молекулами-мишенями. Обычно аптамеры получают выбором из больших произвольных библиотек методом SELEX, но также существуют природные аптамеры в рибопереключателях. Они могут использоваться как для фундаментальных исследований, так и в медицинских приложениях (макромолекулярные лекарственные препараты, антивирусные препараты и т.д.). Аптамеры могут быть использованы в следующих исследовательских, диагностических и терапевтических задачах: 1. * Для детекции различных молекул-мишеней, как в научных, так и в диагностических задачах. Они могут заменить антитела в Вестерн-блоттинге, во флуоресцентной гибридизации in situ и в методе ELISA. 2. * Перспективным для диагностики форматом является создание чипов со множеством аптамеров и возможностью одновременной детекции многих белков. 3. * Для аффинной очистки молекул-мишеней. 4. * Для эффективного и специфичного ингибирования белков-мишеней. Такое ингибирование может быть использовано как в исследовательских целях, так и для создания новых лекарств. Некоторые такие лекарства уже находятся на стадии клинических испытаний. 5. * Перспективным направлением использования аптамеров является направленный транспорт лекарств. Аптамеры в этом случае определяют адресность доставки (targeting ligands). (ru)
  • Aptâmeros (do Latin aptus, apto, e Grego meros, parte) são oligonucleotídeos ou peptídeos que se ligam à moléculas-alvo específicas. Aptâmeros são normalmente criados através de seleção a partir de um conjunto de sequências aleatórias, apesar de ocorrerem também naturalmente como parte de riboswitches. Aptâmeros podem ser utilizados tanto para pesquisa básica quanto para propósitos clínicos, pois podem agir como drogas macromoleculares. Aptâmeros podem ser combinados com ribozimas para se auto-clivar na presença da molécula-alvo. (pt)
  • 適體 (源自拉丁文「aptus」表示”適合”的意思,和希臘文「meros」表示”部位”的意思)是指與特定的目標分子結合的寡聚核酸或是 肽鏈。適體常常從大量的隨機序列被挑選出來,但自然的適體依舊存在如核糖开关中。適體可以用在學術研究亦可以當作大分子藥物應用在臨床診斷上。在適體的目標分子存在的情況下,適體能與核酶結合並進行自我剪切的動作,這些複合物能應用在研究、工業與臨床診斷上。 有高度專一性的適體能如下分類: * DNA or RNA or 構成的適體(適體核酸);由寡核酸構成。 * 肽鏈構成的適體(適體肽鏈);由可變的多肽區域與蛋白質的兩端結合而成。 (zh)
  • Аптаме́р (рос. аптамер, англ. aptamer) — у комбінаторній хімії — олігонуклеотид, який може специфічно зв'язуватись з протеїном або іншою ціллю, часто відібраний шляхом повторення циклів збагачень. Приєднаний аптамер дезактивує протеїн, приводячи таким чином до активації чи дезактивації гена. У біохімії використовується при встановленні функцій окремих ділянок протеїнів. (uk)
dbo:thumbnail
dbo:wikiPageExternalLink
dbo:wikiPageID
  • 1970691 (xsd:integer)
dbo:wikiPageLength
  • 59738 (xsd:nonNegativeInteger)
dbo:wikiPageRevisionID
  • 1123549595 (xsd:integer)
dbo:wikiPageWikiLink
dbp:wikiPageUsesTemplate
dcterms:subject
gold:hypernym
rdf:type
rdfs:comment
  • Aptamere (von lateinisch aptus ‚passen‘ und griechisch meros ‚Teil‘) sind kurze einzelsträngige DNA- oder RNA-Oligonukleotide (25–70 Basen) beziehungsweise Peptide, die ein spezifisches Molekül über ihre 3D-Struktur binden können. Ist das Aptamer ein Peptid, so spricht man von einem Peptid-Aptamer. (de)
  • Los aptámeros son ácidos nucleicos de cadena sencilla (ssDNA y RNA), aislados de genotecas de oligonucleótidos por selección in vitro, mediante enriquecimiento exponencial en presencia del ligando (método SELEX), denominados anticuerpos químicos (del inglés chemical antibodies). (es)
  • Un aptamère est un oligonucléotide synthétique, le plus souvent un ARN qui est capable de fixer un ligand spécifique et parfois de catalyser une réaction chimique sur ce ligand. Les aptamères sont en général des composés synthétiques, isolés in vitro à partir de banques combinatoires d'un grand nombre de composés de séquence aléatoire par une méthode de sélection itérative appelée SELEX. (fr)
  • アプタマー(Aptamer)とは、特定の分子と特異的に結合する核酸分子やペプチドである。通常ランダム配列の巨大ライブラリ中から選び出してくるが、自然界にも存在しておりリボスイッチとして知られている。基礎から薬剤探索などの応用まで幅広く研究されている。リボザイムと複合化したアプタマーも存在しており、ターゲット分子存在下で自己開裂するものが知られている。大きく分けると核酸(DNA・RNA)アプタマー、ペプチドアプタマーの2種に分類される。 (ja)
  • Een aptameer (afgeleid van het Latijnse woord apto: 'passen') is een RNA- of DNA-molecuul dat zeer specifiek aan een bepaald ligand kan binden. Het ligand verschilt per aptameer en is in veel gevallen een eiwit of een oligopeptide, maar kan ook een ion of een suikermolecuul of iets heel anders zijn. Als het aptameer zijn ligand bindt, ondergaat het een conformatieverandering. Aptameren komen in de natuur voor maar kunnen ook chemisch geproduceerd worden. Ze worden gebruikt in fundamenteel onderzoek en voor medische en industriële doeleinden. (nl)
  • Aptamery − oligonukleotydy (krótkie fragmenty DNA lub RNA) lub peptydy, które wiążą się specyficznie z określoną cząsteczką. Aptamery występują w ryboprzełącznikach. Można je też uzyskiwać sztucznie selekcjonując z puli o losowych sekwencjach takie, które wiążą docelową cząsteczkę najmocniej lub najbardziej specyficznie. (pl)
  • Aptâmeros (do Latin aptus, apto, e Grego meros, parte) são oligonucleotídeos ou peptídeos que se ligam à moléculas-alvo específicas. Aptâmeros são normalmente criados através de seleção a partir de um conjunto de sequências aleatórias, apesar de ocorrerem também naturalmente como parte de riboswitches. Aptâmeros podem ser utilizados tanto para pesquisa básica quanto para propósitos clínicos, pois podem agir como drogas macromoleculares. Aptâmeros podem ser combinados com ribozimas para se auto-clivar na presença da molécula-alvo. (pt)
  • 適體 (源自拉丁文「aptus」表示”適合”的意思,和希臘文「meros」表示”部位”的意思)是指與特定的目標分子結合的寡聚核酸或是 肽鏈。適體常常從大量的隨機序列被挑選出來,但自然的適體依舊存在如核糖开关中。適體可以用在學術研究亦可以當作大分子藥物應用在臨床診斷上。在適體的目標分子存在的情況下,適體能與核酶結合並進行自我剪切的動作,這些複合物能應用在研究、工業與臨床診斷上。 有高度專一性的適體能如下分類: * DNA or RNA or 構成的適體(適體核酸);由寡核酸構成。 * 肽鏈構成的適體(適體肽鏈);由可變的多肽區域與蛋白質的兩端結合而成。 (zh)
  • Аптаме́р (рос. аптамер, англ. aptamer) — у комбінаторній хімії — олігонуклеотид, який може специфічно зв'язуватись з протеїном або іншою ціллю, часто відібраний шляхом повторення циклів збагачень. Приєднаний аптамер дезактивує протеїн, приводячи таким чином до активації чи дезактивації гена. У біохімії використовується при встановленні функцій окремих ділянок протеїнів. (uk)
  • الأبتمرات (بالإنجليزية: Aptamers)‏ هي عبارة عن سلسلة حمض نووي قصيرة أو جزيئات ببتيدية والتي تشكل رابطة مع جزئ معين. يتم الحصول على هذه الأبتمرات عن طريق أخذها بشكل عشوائي من مناطق تجمع الأحماض النووية، ويمكن العثور على الأبتمرات بشكل طبيعي في جزء من الحمض النووي المراسل ويدعى بـ (رايبوس ويتش). تستخدم الأبتمرات في الأبحاث الأولية أو الأساسية وأيضا تستعمل لأأغراض مخبرية مثل صناعة الأدوية. من الممكن ربط الأبتمرات بالرايبوسومات، الأمر الذي يؤدي لانفساخ ذاتي عند وجود الجزي المطلوب. هذه المركبات الجزيئية لها - بالإضافة لما سبق - استعمالات للأغراض البحثية، الصناعية والمخبرية. (ar)
  • Els aptàmers (del llatí aptus - encaixar, i el grec meros - part) són oligonucleòtids (petits fragments d'àcids nucleics) o pèptids (petits fragments de proteïna) que s'uneixen a una molècula diana específica. Es solen obtenir mitjançant la selecció a partir de grans col·leccions de seqüències aleatòries, si bé també existeixen aptàmers naturals en els anomenats . Poden ser emprats tant en recerca bàsica com per a aplicacions clíniques com a fàrmacs macromoleculars. Els aptàmers poden ser combinats amb ribozims per autofragmentar-se en presència de la molècula diana. Aquestes molècules compostes tenen aplicacions industrials, clíniques i de recerca addicionals. (ca)
  • Aptamers are short sequences of artificial DNA or RNA that bind a specific target molecule. Like antibodies, which are used for similar purposes in biotechnology and medicine, they can show strong binding to their target, with little or no off-target binding. To highlight how they are similar to and different from antibodies, aptamers are sometimes called chemical antibodies. Aptamers and antibodies can be used in many of the same tasks, but the nucleic acid-based structure of aptamers, which are mostly oligonucleotides, is very different from the amino acid-based structure of antibodies, which are proteins. This difference can make aptamers a better choice than antibodies for some purposes (see ). (en)
  • Gli aptameri sono acidi nucleici aventi la proprietà di legarsi ad una molecola o ad una proteina.I primi aptameri sono stati isolati all'inizio degli anni '90, nei laboratori di Jack W. Szostak e . La tecnica utilizzata è stata soprannominata SELEX. Si tratta di una tecnica che permette di selezionare, all'interno di una grande quantità di acidi nucleici aventi diverse sequenze, gli acidi nucleici che si legano alla molecola desiderata. Una volta selezionati, le sequenze "vincitrici" vengono amplificate, di solito a livello di DNA, mediante PCR. Attraverso diversi cicli di selezione e amplificazione, gli aptameri dalle proprietà desiderate vengono isolati. (it)
  • Аптамеры — олигонуклеотидные или пептидные молекулы, специфически связывающиеся с определёнными молекулами-мишенями. Обычно аптамеры получают выбором из больших произвольных библиотек методом SELEX, но также существуют природные аптамеры в рибопереключателях. Они могут использоваться как для фундаментальных исследований, так и в медицинских приложениях (макромолекулярные лекарственные препараты, антивирусные препараты и т.д.). Аптамеры могут быть использованы в следующих исследовательских, диагностических и терапевтических задачах: (ru)
rdfs:label
  • أبتمر (ar)
  • Aptàmer (ca)
  • Aptamer (de)
  • Aptamer (en)
  • Aptámero (es)
  • Aptamère (fr)
  • Aptamero (it)
  • アプタマー (ja)
  • Aptameer (nl)
  • Aptamer (pl)
  • Aptâmero (pt)
  • Аптамер (ru)
  • 適體 (zh)
  • Аптамер (uk)
owl:sameAs
prov:wasDerivedFrom
foaf:depiction
foaf:isPrimaryTopicOf
is dbo:product of
is dbo:wikiPageRedirects of
is dbo:wikiPageWikiLink of
is foaf:primaryTopic of
Powered by OpenLink Virtuoso    This material is Open Knowledge     W3C Semantic Web Technology     This material is Open Knowledge    Valid XHTML + RDFa
This content was extracted from Wikipedia and is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License