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Rizobiáceas

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As Rizobiáceas (Rhizobiaceae) son unha familia de proteobacterias, nas que se inclúen moitas (pero non todas) especies de rizobios, xunto con parasitos de plantas como Agrobacterium. As Rhizobiaceae son gramnegativas, aerobias e xeralmente con forma de bacilo.[3] Moitas especies de Rhizobiaceae son diazótrofas, xa que poden fixar o nitróxeno e son simbióticas das raíces de plantas, onde forman nódulos radiculares.

Filoxenia

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A taxonomía actualmente aceptada está baseada na LPSN (List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature) [2] e no NCBI (National Center for Biotechnology Information)[4] e a filoxenia foi elaborada con datos de ARNr 16S da LTP 106 do The All-Species Living Tree Project.[5]

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Rhizobium lusitanum Valverde et al. 2006

 
 

Rhizobium rhizogenes (Riker et al. 1930) Young et al. 2001[9]

 
 

Agrobacterium rubi Hildebrand 1940

 
 
 
 

Rhizobium multihospitium Han et al. 2008

 
 

Rhizobium tropici Martínez-Romero et al. 1991

 
 
 

Rhizobium miluonense Gu et al. 2008

 
 
 
 

Rhizobium leguminosarum (Frank 1879) Frank 1889 (Approved Lists 1980) emend. Ramírez-Bahena et al. 2008[6]

 
 
 
 
 

Rhizobium endophyticum López-López et al. 2011

 
 

Rhizobium tibeticum Hou et al. 2009

 
 
 

Rhizobium etli Segovia et al. 1993

 
 
 
 

Rhizobium pisi Ramírez-Bahena et al. 2008

 
 
 

Rhizobium phaseoli Dangeard 1926 (Approved Lists 1980) emend. Ramírez-Bahena et al. 2008

 
 

Rhizobium fabae Tian et al. 2008

 
 
 

Rhizobium hainanense Chen et al. 1997

 
 
 
 

Arthrobacter viscosus Gasdorf et al. 1965[14]

 
 

Rhizobium alamii Berge et al. 2009

 
 

Rhizobium mesosinicum Lin et al. 2009

 
 
 
 

Rhizobium sullae Squartini et al. 2002

 
 
 

Rhizobium indigoferae Wei et al. 2002

 
 
 

Rhizobium gallicum Amarger et al. 1997

 
 

Rhizobium yanglingense Tan et al. 2001

 
 
 

Rhizobium mongolense Van Berkum et al. 1998

 
 

Rhizobium oryzae Peng et al. 2008

 
 
 

Rhizobium loessense Wei et al. 2003

 
 
 

Rhizobium tubonense Zhang et al. 2011

 
 
 
 
 
 

Rhizobium cellulosilyticum García-Fraile et al. 2007

 
 

Rhizobium soli Yoon et al. 2010

 
 
 
 

Neorhizobium galegae Lindström 1989

 
 

Neorhizobium vignae Ren et al. 2011

 
 
 
 

Neorhizobium huautlense Wang et al. 1998

 
 

Neorhizobium alkalisoli Lu et al. 2009

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Aureimonas altamirensis (Jurado et al. 2006) Rathsack et al. 2011[6][7][8]

 
 

Aureimonas frigidaquae (Kim et al. 2008) Rathsack et al. 2011[7][8]

 
 
 

Aureimonas ureilytica (Weon et al. 2007) Rathsack et al. 2011[7][8]

 
 
 

Aurantimonas coralicida Denner et al. 2003 emend. Rathsack et al. 2011.[6][7]

 
 
 

Fulvimarina pelagi Cho e Giovannoni 2003 emend. Rathsack et al. 2011[6][7]

 
 
 

Martelella mediterranea Rivas et al. 2005[6][7]

 
 
 

Allorhizobium undicola (de Lajudie et al. 1998) Young et al. 2001[9]

 
 
 

Allorhizobium vitis (Ophel e Kerr 1990) Young et al. 2001[9]

 
 
 
 

Allorhizobium borbori Zhang et al. 2011

 
 
 
 
 
 

Beijerinckia fluminensis Döbereiner e Ruschel 1958[10]

 
 

Agrobacterium larrymoorei Bouzar e Jones 2001

 
 
 

Agrobacterium radiobacter Beijerinck e van Delden 1902[11]

 
 
 
 

Rhizobium selenitireducens corrig. Hunter et al. 2008

 
 

Rhizobium rosettiformans Kaur et al. 2011

 
 
 
 
 

Rhizobium daejeonense Quan et al. 2005

 
 
 
 
 

Rhizobium aggregatum (Hirsch e Müller 1986) Kaur et al. 2011

 
 

Pararhizobium capsulatum Hirsch e Müller 1986[12]

 
 
 

Pararhizobium giardinii Amarger et al. 1997

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Ensifer mexicanus Lloret et al. 2011

 
 

Ensifer terangae (De Lajudie et al. 1994) Young 2003[13]

 
 
 

Ensifer saheli (De Lajudie et al. 1994) Young 2003[13]

 
 
 

Ensifer kostiensis (Nick et al. 1999) Young 2003[13]

 
 
 

Ensifer kummerowiae (Wei et al. 2002) Young 2003[13]

 
 
 

Ensifer fredii (Scholla e Elkan 1984) Young 2003[13]

 
 

Sinorhizobium americanum corrig. Toledo et al. 2004

 
 
 
 

Ensifer arboris (Nick et al. 1999) Young 2003[13]

 
 

Ensifer garamanticus Merabet et al. 2010

 
 
 

Ensifer meliloti (Dangeard 1926) Young 2003[13]

 
 

Ensifer numidicus Merabet et al. 2010

 
 
 
 

Ensifer adhaerens Casida 1982[6]

 
 
 

Notas

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  1. ↑ International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (2002), 52, 2337 DOI: 10.1099/ijs.0.02524-0. International Committee on Systematics of Prokaryotes Subcommittee on the taxonomy of Agrobacterium and Rhizobium. Minutes of the meeting, 4 de xullo de 2001, Hamilton, Canadá [1]
  2. ↑ 2,0 2,1 J.P. Euzéby. "Proteobacteria (scroll down for Rhizobiaceae)". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Arquivado dende o orixinal o 27 de xaneiro de 2013. Consultado o 2012-05-02. 
  3. ↑ Garrity, George M.; Brenner, Don J.; Krieg, Noel R.; Staley, James T. (eds.) (2005). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Volume segundo: The Proteobacteria, Part C: The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria. New York, New York: Springer. ISBN 978-0-387-24145-6.
  4. ↑ Sayers; et al. "Rhizobiaceae". National Center for Biotechnology Information (NCBI) dabe de datos taxonómica. Consultado o 2012-05-02. 
  5. ↑ All-Species Living Tree Project."16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)" (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Arquivado dende o orixinal (PDF) o 07 de maio de 2012. Consultado o 2012-05-02. 
  6. ↑ 6,0 6,1 6,2 6,3 6,4 6,5 Esta é a especie tipo do xénero.
  7. ↑ 7,0 7,1 7,2 7,3 7,4 7,5 As especies que se encontran nos xéneros Aurantimonas, Aureimonas, Fulvimarina e Martelella están clasificadas actulmente nas Aurantimonadaceae.
  8. ↑ 8,0 8,1 8,2 As especies noxénero Aureimonas foron inicialmente clasificadas no xénero Aurantimonas.
  9. ↑ 9,0 9,1 9,2 Estas especies estaban anteriormente clasificadas no xénero Agrobacterium.
  10. ↑ Beijerinckia fluminensis está clasificada actualmente nas Beijerinckiaceae.
  11. ↑ Esta inclúe Agrobacterium tumefaciens (Smith e Townsend 1907) Conn 1942.
  12. ↑ Blastobacter capsulatus está clasificada actualmente nas Bradyrhizobiaceae.
  13. ↑ 13,0 13,1 13,2 13,3 13,4 13,5 13,6 Estas especies estaban nteriormente clasificadas o xénero Sinorhizobium.
  14. ↑ Arthrobacter viscosus está clasificada actualmente nas Micrococcaceae. Ver Arthrobacter.
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