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Thermoanaerobacteriales

De Wikipedia, la enciclopedia libre
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Thermoanaerobacterales
Taxonomía
Dominio: Bacteria
Filo: Bacillota
Clase: Clostridia
Orden: Thermoanaerobacterales
Wiegel 2010
Familias y géneros[1]
  • Thermoanaerobacteriaceae
    • Caldanaerobacter
    • Caldanaerobius
    • Caloribacterium
    • Carboxydothermus
    • Desulfovirgula
    • Fervidicola
    • Gelria
    • grupo Moorella
      • Ammonifex
      • Calderihabitans
      • Moorella
    • Tepidanaerobacter
    • Thermacetogenium
    • Thermanaeromonas
    • Thermoanaerobacter
  • Thermodesulfobiaceae
    • Thermodesulfobium
  • familia III
    • Caldanaerovirga
    • Caldicellulosiruptor
    • Syntrophaceticus
    • Thermoanaerobacterium
    • Thermosediminibacter
    • Thermovenabulum
    • Thermovorax
  • familia IV
    • Mahella

Thermoanaerobacterales (Thermoanaerobacteriales) es un orden de bacterias termófilas anaerobias estrictas que habitan principalmente en aguas termales terrestres. Según la tinción son bacilos Gram positivos a veces negativos, pero su estructura es Gram positiva. La mayoría de especies forman esporas, suelen ser móviles mediante flagelos, son mayormente quimioorganótrofos, usando azúcares u otras sustancias orgánicas como sustratos y es común la reducción de tiosulfatos.

Taxonómicamente es un orden perteneciente a la clase Clostridia y filo Bacillota, pero filogenéticamente Thermoanaerobacterales y su principal familia Thermoanaerobacteriaceae resultan altamente polifiléticos.

Son terrestres: la gran mayoría de especies fueron encontradas en aguas termales y unas pocas en depósitos de gas (Caloribacterium) o petróleo (Mahella). Una excepción en el hábitat marino es Thermosediminibacter, cuyas especies se encontraron en el sedimento del litoral de Perú a cientos de metros de profundidad y una temperatura de 9 a 12 °C; pero a pesar de este frío hábitat no han perdido su condición termófila, pues su temperatura óptima de crecimiento está entre 64 y 68 °C.[2]

Caldicellulosiruptor tiene la particularidad de utilizar celulosa, por lo que tiene importancia en la biodegradación de la masa vegetal.[3]

Filogenia

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La polifilia de este grupo está determinada por el análisis filogenético proteico y del ARNr. Así pues, el grupo Thermoanaerobacteriaceae-1 donde está el género Moorella, se ve distanciado de Thermoanaerobacteriaceae-2 donde está Thermoanaerobacter.[4]

El análisis extenso del ARNr 16S revela que Thermoanaerobacteriales está conformado por al menos 4 grupos filogenéticos más o menos distanciados:[5]

  • Thermodesulfobiaceae: Grupo muy antiguo y el más divergente de todas las bacterias solamente después del filo Thermotogae, por lo que podríamos considerarlo un grupo basal bacteriano independiente de cualquier Firmicutes. Actualmente, este grupo divergente es objeto de reclasificación, y en el 2018, una parte importante del grupo ha sido transferida, creando la nueva familia Coprothermobacteraceae en un nuevo filo que ha sido denominado Coprothermobacterota, completamente separado del filo Firmicutes.[6]
  • Thermoanaerobacteriaceae-1: Termófilo con temperaturas promedio de 58-71 °C, grupo relacionado con los demás Firmicutes y conformado por las Thermoanaerobacteriaceae Moorella, Thermacetogenium y el género Carboxydothermus, inusual por su metabolismo quimiosintético, además de Syntrophaceticus que está en la familia III.
  • Thermoanaerobacteriaceae-2: Grupo termófilo-hipertermófilo con temperaturas promedio entre los 60 y 78 °C, parafilético con relación al filo Dictyoglomi, conformado por varias Thermoanaerobacteriaceae como Ammonifex, Caldanaerobacter, Fervidicola, Tepidanaerobacter, Thermanaeromonas y Thermoanaerobacter, además géneros de la familia III como Caldanaerovirga, Caldicellulosiruptor, Thermosediminibacter, Thermovenabulum y Thermovorax.
  • Otras Thermoanaerobacteriales forman un cuarto grupo que es moderadamente termófilo, con temperaturas de crecimiento óptimo de 50-63 °C, relacionado con el grupo Clostridiaceae-1 (donde está Clostridium) y conformado por los géneros Caldanaerobius, Caloribacterium (Thermoanaerobacteriaceae), Thermoanaerobacterium (familia III) y Mahella (familia IV).

Referencias

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  1. Thermoanaerobacterales NCBI Taxonomy Browser. Rev. marzo 2014
  2. Lee YJ et al 2005. Thermosediminibacter oceani gen. nov., sp. nov. and Thermosediminibacter litoriperuensis sp. nov., new anaerobic thermophilic bacteria isolated from Peru Margin. Extremophiles. 2005 Oct;9(5):375-83. Epub 2005 Jun 18.
  3. Blumer-Schuette SE et al 2012. Caldicellulosiruptor core and pangenomes reveal determinants for noncellulosomal thermophilic deconstruction of plant biomass. J Bacteriol. 2012 Aug;194(15):4015-28. doi: 10.1128/JB.00266-12. Epub 2012 May 25.
  4. Battistuzzi & Hedges 2009. The Timetree of Life. Eubacteria. p.109
  5. 'The All-Species Living Tree' Project."16S rRNA-based LTP release 111 (full tree)" Archivado el 23 de septiembre de 2015 en Wayback Machine.. Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database [3]. Revisado 19-02-2014
  6. Pavan, María Elisa; Pavan, Esteban E.; Glaeser, Stefanie P.; Etchebehere, Claudia; Kämpfer, Peter; Pettinari, María Julia; López, Nancy I. (2018). «Proposal for a new classification of a deep branching bacterial phylogenetic lineage: transfer of Coprothermobacter proteolyticus and Coprothermobacter platensis to Coprothermobacteraceae fam. nov., within Coprothermobacterales ord. nov., Coprothermobacteria classis nov. and Coprothermobacterota phyl. nov. and emended description of the family Thermodesulfobiaceae». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 68 (5): 1627-1632. doi:10.1099/ijsem.0.002720. Consultado el 5 de noviembre de 2018.