Paceibacteria
Paceibacteria | ||
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Taxonomía | ||
Dominio: | Bacteria | |
Filo: | Patescibacteria | |
Clase: |
Paceibacteria Rinke et al. 2013 | |
Órdenes[1] | ||
Paceibacteria o Parcubacteria es una clase de bacterias recientemente propuesta[2][3] sobre la base de análisis genómicos (Rinke 2013),[4] al que usualmente se le asigna el rango de superfilo o filo. Previamente se conocía como filo candidato OD1 (Harris, 2004).[5] Los análisis genéticos sugieren que sus especiales características metabólicas han prevenido hasta el momento su identificación y cultivo por los procedimientos tradicionales.[1][6] Se caracterizan por células extremadamente pequeñas, genomas reducidos y capacidades metabólicas muy limitadas, centradas principalmente en la fermentación, que generalmente viven como simbiontes en comunidades microbianas.
Se ha encontrado un espécimen intracelular que habita en protistas ciliados.[7] Otro espécimen con metabolismo del nitrógeno y de ácidos grasos, es la única bacteria CPR indentificada con vías inusuales y enzimas muy divergentes que le dan capacidad de respiración aeróbica.[8]
Junto a la clase Microgenomatia y a otros taxones recientemente identificados de bacterias forma parte de Patescibacteria o grupo CPR, que se estima que constituye al menos un 15% de la diversidad bacteriana.[9]
Referencias
[editar]- ↑ a b Brown, Christopher T., et al. Unusual biology across a group comprising more than 15% of domain Bacteria. Nature 523.7559 (2015): 208-211.
- ↑ Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, David W. Waite, Christian Rinke, Adam Skarshewski, Pierre-Alain Chaumeil, Philip Hugenholtz (2018). A proposal for a standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny. Biorxiv.
- ↑ Genome database. Patescibacteria.
- ↑ Rinke, C., Schwientek, P., Sczyrba, A., Ivanova, N. N., Anderson, I. J., Cheng, J. F., ... & Dodsworth, J. A. (2013). Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter. Nature, 499(7459), 431-437.)
- ↑ Harris, J. K., Kelley, S. T., & Pace, N. R. (2004). New perspective on uncultured bacterial phylogenetic division OP11. Applied and Environmental Microbiology, 70(2), 845-849).
- ↑ Solden, Lindsey, Karen Lloyd, and Kelly Wrighton The bright side of microbial dark matter: lessons learned from the uncultivated majority. Current opinion in microbiology 31 (2016): 217-226.
- ↑ Jun Gong, Yao Qing, Xiaohong Guo & Alan Warren, 2014, “Candidatus Sonnebornia yantaiensis”, a member of candidate division OD1, as intracellular bacteria of the ciliated protist Paramecium bursaria (Ciliophora, Oligohymenophorea). Systematic and Applied Microbiology V. 37, Issue 1, p. 35-41
- ↑ Castelle, C., Brown, C., Thomas, B. et al. Unusual respiratory capacity and nitrogen metabolism in a Parcubacterium (OD1) of the Candidate Phyla Radiation. Sci Rep 7, 40101 (2017) doi:10.1038/srep40101
- ↑ Hug, Laura A., et al., A new view of the tree of life. Nature Microbiology 1 (2016): 16048.