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Aquificota

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Aquificota

Imagen de microscopio electrónico de barrido de Venenivibrio encontrado en Champagne Pool (Nueva Zelanda)
Taxonomía
Dominio: Bacteria
Filo: Aquificota
Reysenbach 2021
Clase: Aquificae
Orden: Aquificales
Familias y géneros

Aquificota o Aquificae es un filo que agrupa a una colección diversa de bacterias que viven en ambientes calientes.[1]​ Se han encontrado en manantiales termales, pozos sulfurosos y fuentes hidrotermales oceánicas. Los miembros del género Aquifex, por ejemplo, proliferan a temperaturas de 85-95 °C. Son los organismos más abundantes en los manantiales terrestres calientes desde neutros a alcalinos y a temperaturas superiores a los 60° y también se encuentran en fuentes hidrotermales marinas ácidas. Son quimiosintéticos, o más precisamente quimiolitoautótrofos fijadores primarios del carbono en estos hábitats. Son bacterias verdaderas (dominio Bacteria) en contraposición a los otros habitantes de ambientes extremos, Archaea.

Clasificación

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Taxonomía

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No hay actualmente consenso con respecto a la taxonomía de géneros dentro de Aquificae. Un texto estándar [1] Archivado el 14 de abril de 2012 en Wayback Machine. clama que solamente los géneros Aquifex, Calderobacterium, Hydrogenobacter y Thermocrinis pertenecen al orden Aquificales. Otras fuentes consideran, que además de los géneros incluidos en las familias Aquificaceae y Hydrogenothermaceae, deberían incluirse en Aquificae los géneros de la familia Desulfurobacteriaceae: Balnearium, Desulfurobacterium y Thermovibrio y el incertae sedis (sin clasificar) grupo EX-H1.

Filogenia

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Según el análisis de ARNr, las familias acuificas se relacionan del siguiente modo:[2]

Aquificae 

Thermosulfidibacter

Desulfurobacteriaceae

Hydrogenothermaceae

Aquificaceae

Relaciones

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Es posible que Aquificae sea el grupo más antiguo y divergente entre todas las bacterias, tal como se ve en el análisis filogenético de ARNr 16S y 23S,[3]​ con un metabolismo quimiosintético que hace recordar a las arqueas. Sin embargo, otros análisis genómicos y proteicos muestran que Aquificae podría tener relación con otros grupos termófilos como Thermotoga[4]​ o Thermodesulfobacteria,[5]​ o bien aproximarse a Epsilonproteobacteria.[6]

De acuerdo con el 21% de los árboles filogenéticos, las acuificales estarían estrechamente relacionadas con las ε-proteobacterias, como por ejemplo se observa en el análisis filogenético de secuencias de proteínas individuales como el factor de alargamiento de la transcripción. Sin embargo, esto no es compatible con el análisis del ARNr, análisis proteico e información sobre el genoma completo, en los cuales se observó cercanía de Aquificae con Thermotogae, a nivel de la filogenia bacteriana profunda.[7]

Enlaces externos y referencias

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  1. Genome database. Aquificota.
  2. All-Species Living Tree Project."16S rRNA-based LTP release 111 (full tree)". Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database [3]. Retrieved 2013-03-20
  3. Cheryl P. Andam & J. Peter Gogarten 2011. Biased gene transfer in microbial evolution. Figure 1 --| Phylogenetic analysis of bacterial tyrosyl-tRNA synthetase amino acid sequences and the corresponding concatenated 16S–23S ribosomal RNA phylogeny. Nature Reviews Microbiology 9, 543-555 doi:10.1038/nrmicro2593
  4. Henz, Stefan R. et al 2004. Whole-genome prokaryotic phylogeny. Oxford Journals Life Sciences & Mathematics & Physical Sciences Bioinformatics Volume 21, Issue 10Pp. 2329-2335.
  5. Christian Rinke et al 2013. Figure 2: Maximum-likelihood phylogenetic inference of Archaea and Bacteria. Nature 499, 431–437 (25 July 2013) doi:10.1038/nature12352
  6. Griffiths, E. and Gupta, R. S. (2004) Signature sequences in diverse proteins provide evidence for the late divergence of the order Aquificales. International Microbiol 7: 41-52.
  7. Oshima K, Chiba Y, Igarashi Y, Arai H, Ishii M. (2002) Phylogenetic position of aquificales based on the whole genome sequences of six aquificales species. Int J Evol Biol. 2012;2012:859264. doi:10.1155/2012/859264