Corticoviridae

Corticoviridae
Aufbau des Phagen PM2
Systematik
Klassifikation: Viren Realm: Varidnaviria[1] Reich: Bamfordvirae[1] Phylum: Preplasmiviricota[1] Klasse: Tectiliviricetes[1] Ordnung: Vinavirales[1] Familie: Corticoviridae Gattung: Corticovirus Art: Pseudoalteromonas Phage PM2
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA zirkulär Baltimore: Gruppe 1 Symmetrie: ikosaedrisch T=21 Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Corticoviridae
Links
ICTV Taxon History: 201903034 NCBI Taxonomy: 10659 (Familie), 10660 (Gattung) NCBI Reference: AF155037 (Typusspezies) ViralZone (Expasy, SIB): 14 (Familie), 533 (Gattung)

Die Virusfamilie Corticoviridae (lateinisch cortex ‚Rinde, Kruste‘) umfasst nur eine monotypische Gattung Corticovirus von Bakteriophagen. Die einzige bislang (Stand März 2019) vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigte Spezies Corticovirus PM2 (früher Pseudoalteromonas-Virus PM2, mit Pseudoalteromonas-Phage PM2, auch PM2-Phage, ursprünglich Alteromonas-Phage PM2 genannt) hat ein zirkuläres, doppelsträngiges DNA-Genom und ein ca. 56 nm im Durchmesser großes, unbehülltes ikosaedrischen Kapsid.

Die Kapsomere sind aus Trimeren des Kapsidproteins P2 aufgebaut; an den Ecken der Ikosaeder-Struktur befinden sich Fortsätze (spikes), die durch das Virusprotein P1 gebildet werden. Innerhalb (!) des Kapsids befindet sich ein Lipidmembran-Bläschen, das aus Virusproteinen und der Lipidmembran des Wirtsbakteriums besteht. Dieses innere Membranbläschen hat der PM2-Phage mit den Tectiviridae gemein, es dient jedoch dem PM2-Phagen nicht zur Injektion der DNA in das Wirtsbakterium.

Das ringförmige Genom ist in stark verdrillter Form (supercoiled) innerhalb des Membranbläschens verpackt. Die doppelsträngige DNA ist 10.079 bp (Basenpaare) groß und codiert für neun Strukturproteine (P1-P9), fünf Nicht-Strukturproteine (P12-16) und sieben Genprodukte unbekannter Funktion.

Bisher sind zwei marine Bakterienspezies, Pseudoalteromonas BAL-31 und ER72M2, als Wirte für den PM2-Phagen identifiziert.

Das National Center for Biotechnology Information (NCBI) nennt neben den ICTV-bestätigten Spezies weitere Kandidaten:

• Gattung Corticovirus

• Spezies Corticovirus Cr39582 (veraltet Pseudoalteromonas virus Cr39582), mit Pseudoalteromonas phage Cr39582
• Spezies Corticovirus PM2 (veraltet Pseudoalteromonas virus PM2)
• Spezies „Pseudoalteromonas phage GXT1010“ (vorgeschlagen)^[2]

• R. T. Espejo, E. S. Canelo: Properties of bacteriophage PM2: A lipid-containing bacterial virus. Virology (1968) 34, S. 738–747
• H. M. Kivelä, N. Kalkkinnen, Dennis H. Bamford: Bacteriophage PM2 has a protein capsid surrounding a spherical lipid-protein core. Journal of Virology (2002) 76, S. 8169–8178
• C.M. Fauquet, M.A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London, San Diego, 2004
• David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (Hrsg.): Fields’ Virology, 4. Auflage, Philadelphia 2001

• NCBI: Genomsequenz des PM2-Phagen

1. ↑ ^{a b c d e} ICTV: ICTV Taxonomy history: Pseudoalteromonas virus Cr39582, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
2. ↑ NCBI: Pseudoalteromonas phage GXT1010 (species)