Ubikvitin ligáza

Ubikvitin ligáza (též ubiquitin ligáza nebo enzym E3) je jakýkoliv enzym, který katalyzuje konečný přenos malého proteinu ubiquitinu na cílový substrát. Jedná se o poslední krok v procesu ubiquitinylace proteinů. Ubuiquitin je přenesen buď z SH skupiny cysteinu přímo na molekule enzymu E3, nebo (u ligáz obsahujících RING finger) přímo z enzymu E2. Cílem je aminoskupina lysinu na substrátu, případně N-terminální aminoskupina proteinu. Řada ubiquitinylačních reakcí za sebou se označuje jako polyubiquitinylace a obvykle je signálem pro degradaci proteinu, na který byla taková značka přidána.^[1]

Dnes je známo velké množství ubiquitin ligáz, např. v lidském genomu jich je více než 600. Ty jsou zpravidla klasifikovány do tří tříd:^[2]

• RING ubiquitin ligázy – nejrozsáhlejší skupina ubiquitin ligáz, které pracují jako monomery nebo dimery. Obsahují tzv. RING finger (z angl. výrazu "really interesting new gene"), který váže zinečnatý iont, případně podobný U-box motiv, který zinek neváže. Katalyzují jednokrokový přenos z enzymu E2 na molekulu substrátu. Speciální podtřídou RING ubiquitin ligáz jsou cullin-RING ubiquitin ligázy (CRLs), které se skládají z několika podjednotek vázajících se na kostru cullinu. Další známou RING ubiquitin ligázou je APC/C komplex, resp. jeho RING podjednotka Apc11.
• HECT ubiquitin ligázy – skupina ubiquitin ligáz obsahujících tzv. motiv HECT (homologous to the E6AP carboxyl terminus). Přenáší ubiquitin z E2 nejprve na vlastní cysteinový zbytek a teprve následně na substrát. HECT jsou tvořeny dvěma laloky, jeden slouží k vazbě E2 a druhý obsahuje zmíněný katalytický cystein (oba laloky mohou během katalytického cyklu měnit svou vzájemnou prostorovou orientaci). N-terminální část je zodpovědná za substrátovou specifitu a podle jejího typu se ještě dále rozlišují Nedd4 ubiquitin ligázy (obsahující WW motiv s dvěma tryptofany) a HERC ubiquitin ligázy (které mají jednu nebo více RCC1-like domén)
• RBR ubiquitin ligázy – z anglického sousloví "RING-betweenRING-RING", odkazujícího na fakt, že obsahují RING1 doménu a RING2 doménu, mezi nimiž je tzv. "betweenRING" doména. RING1 slouží k vazbě E2, zatímco RING2 obsahuje katalytický cystein. RBR často obsahují další dodatečné domény.

Tento článek je příliš stručný nebo postrádá důležité informace. Pomozte Wikipedii tím, že jej vhodně rozšíříte. Nevkládejte však bez oprávnění cizí texty.