RNF12

RNF12
Identificadors
Àlies	RLIM (HUGO), NY-REN-43, RNF12, ring finger protein, LIM domain interacting, MRX61, TOKAS
Identif. externs	OMIM: 300379 MGI: 1342291 HomoloGene: 7920 GeneCards: RLIM OMA: RLIM - orthologs
Localització del gen (humà)
	Cromosoma: X (humà)
Fi	74.614.624 bp
Localització del gen (ratolí)
	Cromosoma: X (ratolí)
Fi	103.024.890 bp
Patró d'expressió d'ARN
	Més explicacions
	middle temporal gyrus ; ; cartilage tissue ; ; tendó d'Aquil·les; ; Brodmann area 46 ; ; Gir postcentral; ; internal globus pallidus ; ; Escorça entorrinal; ; Brodmann area 23 ; ; tendon of biceps brachii ; ; pars compacta ;
	Més explicacions
	gastrula ; ; cumulus cell ; ; artèria caròtide interna; ; zigot; ; Gonadal ridge ; ; artèria caròtide externa ; ; ectoderma; ; otic vesicle ; ; Rostral migratory stream ; ; otic placode ;
	Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica
Funció molecular	transcription corepressor activity ; metal ion binding ; transferase activity ; ubiquitin-protein transferase activity ; ubiquitin protein ligase activity ; unió proteica ;
Component cel·lular	transcription repressor complex ; nucli cel·lular ; citosol ; nucleoplasma ;
Procés biològic	negative regulation of transcription, DNA-templated ; transcripció, plantilla d'ADN ; protein ubiquitination ; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process ; protein polyubiquitination ; regulació de la transcripció, modelat amb ADN ; negative regulation of transcription by RNA polymerase II ; ubiquitin-dependent protein catabolic process ; negative regulation of DNA-binding transcription factor activity ; random inactivation of X chromosome ; regulation of dosage compensation by inactivation of X chromosome ;
	Fonts: Amigo / QuickGO
Ortòlegs
	51132
	19820
	ENSG00000131263
	ENSMUSG00000056537
	Q9NVW2
	Q9WTV7
	NM_183353; NM_016120
	NM_011276; NM_001358205
	NP_057204; NP_899196
	NP_035406; NP_001345134
	Wikidata
Veure/Editar gen humà	Veure/Editar gen del ratolí

La lligasa RLIM de proteïna-ubiqüitina E3 (en anglès: E3 ubiquitin-protein ligase RLIM) és un enzim que en humans està codificat pel gen RLIM.^[5]^[6]

La proteïna codificada per aquest gen és un dit de zinc RING-H2. Segons han observat els científics, es tracta d'una lligasa d'ubiqüitina que té com a diana el domini d'unió LIM 1 (LDB1/CLIM), i provoca una degradació proteasòmica de LDB1. Tant RLIM com LDB1 són co-repressors de LHX1/LIM-1, un factor de transcripció homeodomini. S'han descrit variants transcripcionals per splicing alternatiu que codifiquen per la mateixa proteïna.^[6]

Rnf12 té un paper important al procés de la inactivació del cromosoma X, i està regulat negativament per factors de pluripotència en cèl·lules mare embrionàries. ^[7]

Interaccions

S'ha demostrat la interacció de RNF12 amb receptor d'estrogen alfa.^[8]

Referències

↑ ^1,0 ^1,1 ^1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000131263 - Ensembl, May 2017
↑ ^2,0 ^2,1 ^2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000056537 – Ensembl, May 2017
↑ «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
↑ Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jager D, Jager E, Knuth A, Chen YT, Old LJ «Antigens recognized by autologous antibody in patients with renal-cell carcinoma». Int J Cancer, 83, 4, Novembre 1999, pàg. 456–464. DOI: 10.1002/(SICI)1097-0215(19991112)83:4<456::AID-IJC4>3.0.CO;2-5. PMID: 10508479.
↑ ^6,0 ^6,1 «Entrez Gene: RNF12 ring finger protein 12».
↑ Navarro, P.; Moffat, M.; Mullin, N.P.; Chambers, I. «The X-inactivation trans-activator Rnf12 is negatively regulated by pluripotency factors in embryonic stem cells». Hum Genet, 130, 2, 2011, pàg. 255-64. DOI: 10.1007/s00439-011-0998-5 [Consulta: 2 agost 2013].
↑ Johnsen, Steven A; Güngör Cenap, Prenzel Tanja, Riethdorf Sabine, Riethdorf Lutz, Taniguchi-Ishigaki Naoko, Rau Thomas, Tursun Baris, Furlow J David, Sauter Guido, Scheffner Martin, Pantel Klaus, Gannon Frank, Bach Ingolf «Regulation of estrogen-dependent transcription by the LIM cofactors CLIM and RLIM in breast cancer». Cancer Res. [United States], 69, 1, Gener 2009, pàg. 128–136. DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-08-1630. PMC: 2713826. PMID: 19117995.

Bibliografia

Rual JF; Hirozane-Kishikawa, Tomoko; Dricot, Amélie; Li, Ning; Berriz, Gabriel F.; Gibbons, Francis D.; Dreze, Matija; Venkatesan K; Hao T; 3 «Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network». Nature, 437, 7062, 2005, pàg. 1173–1178. DOI: 10.1038/nature04209. PMID: 16189514.
Ota T; Otsuki, Tetsuji; Sugiyama, Tomoyasu; Irie, Ryotaro; Wakamatsu, Ai; Hayashi, Koji; Sato, Hiroyuki; Suzuki Y; Nishikawa T; 3 «Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs». Nat. Genet., 36, 1, 2004, pàg. 40–45. DOI: 10.1038/ng1285. PMID: 14702039.
Hiratani I; Ohmori, SY; Taira, M; Yamamoto N; Mochizuki T; 3 «Selective degradation of excess Ldb1 by Rnf12/RLIM confers proper Ldb1 expression levels and Xlim-1/Ldb1 stoichiometry in Xenopus organizer functions». Development, 130, 17, 2003, pàg. 4161–4175. DOI: 10.1242/dev.00621. PMID: 12874135.
Strausberg RL; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, GD; Feingold EA; Grouse LH; 3 «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 99, 26, 2003, pàg. 16899–16903. DOI: 10.1073/pnas.242603899. PMC: 139241. PMID: 12477932.
Ostendorff HP; Schlüter, Anne; Bossenz, Michael; Scheffner, Martin; Bach, Ingolf; Peirano RI; Peters MA; 3 «Ubiquitination-dependent cofactor exchange on LIM homeodomain transcription factors». Nature, 416, 6876, 2002, pàg. 99–103. DOI: 10.1038/416099a. PMID: 11882901.
Ostendorff HP; Copeland, NG; Gilbert, DJ; Jenkins, NA; Lichter, P; Bach, I; Bossenz M; Mincheva A; 3 «Functional characterization of the gene encoding RLIM, the correpressor of LIM homeodomain factors». Genomics, 69, 1, 2001, pàg. 120–130. DOI: 10.1006/geno.2000.6311. PMID: 11013082.
Bach I; Rodriguez-Esteban, Concepción; Carrière, Catherine; Bhushan, Anil; Krones, Anna; Rose, David W.; Glass, Christopher K.; Rodriguez-Esteban C; Carrière C; 3 «RLIM inhibits functional activity of LIM homeodomain transcription factors via recruitment of the histone deacetylase complex». Nat. Genet., 22, 4, 1999, pàg. 394–399. DOI: 10.1038/11970. PMID: 10431247.

[refGRCh38Ensembl-1] 1,0 ^1,1 ^1,2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000131263 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] 2,0 ^2,1 ^2,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000056537 – Ensembl, May 2017

[3] «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid10508479-5] Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jager D, Jager E, Knuth A, Chen YT, Old LJ «Antigens recognized by autologous antibody in patients with renal-cell carcinoma». Int J Cancer, 83, 4, Novembre 1999, pàg. 456–464. DOI: 10.1002/(SICI)1097-0215(19991112)83:4<456::AID-IJC4>3.0.CO;2-5. PMID: 10508479.

[entrez-6] 6,0 ^6,1 «Entrez Gene: RNF12 ring finger protein 12».

[7] Navarro, P.; Moffat, M.; Mullin, N.P.; Chambers, I. «The X-inactivation trans-activator Rnf12 is negatively regulated by pluripotency factors in embryonic stem cells». Hum Genet, 130, 2, 2011, pàg. 255-64. DOI: 10.1007/s00439-011-0998-5 [Consulta: 2 agost 2013].

[pmid19117995-8] Johnsen, Steven A; Güngör Cenap, Prenzel Tanja, Riethdorf Sabine, Riethdorf Lutz, Taniguchi-Ishigaki Naoko, Rau Thomas, Tursun Baris, Furlow J David, Sauter Guido, Scheffner Martin, Pantel Klaus, Gannon Frank, Bach Ingolf «Regulation of estrogen-dependent transcription by the LIM cofactors CLIM and RLIM in breast cancer». Cancer Res. [United States], 69, 1, Gener 2009, pàg. 128–136. DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-08-1630. PMC: 2713826. PMID: 19117995.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]