[go: up one dir, main page]

Hipoksijski nadregulirani protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom HYOU1.[5][6][7]

HYOU1
Identifikatori
AliasiHYOU1
Vanjski ID-jeviOMIM: 601746 MGI: 108030 HomoloGene: 4658 GeneCards: HYOU1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 11 (čovjek)
Hrom.Hromosom 11 (čovjek)[1]
Hromosom 11 (čovjek)
Genomska lokacija za HYOU1
Genomska lokacija za HYOU1
Bend11q23.3Početak119,044,188 bp[1]
Kraj119,057,227 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[2]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za HYOU1
Genomska lokacija za HYOU1
Bend9|9 A5.2Početak44,290,787 bp[2]
Kraj44,303,666 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija nucleotide binding
chaperone binding
ATP binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta endocytic vesicle lumen
endoplasmic reticulum lumen
membrana
focal adhesion
smooth endoplasmic reticulum
endoplasmic reticulum chaperone complex
extracellular region
Endoplazmatski retikulum
Egzosom
Biološki proces negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced neuron intrinsic apoptotic signaling pathway
negative regulation of apoptotic process
receptor-mediated endocytosis
response to endoplasmic reticulum stress
endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport
IRE1-mediated unfolded protein response
response to ischemia
cellular response to hypoxia
negative regulation of hypoxia-induced intrinsic apoptotic signaling pathway
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001130991
NM_006389

NM_021395

RefSeq (bjelančevina)

NP_001124463
NP_006380

NP_067370

Lokacija (UCSC)Chr 11: 119.04 – 119.06 MbChr 9: 44.29 – 44.3 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Protein kodiran ovim genom pripada porodici proteina toplotnog šoka 70. Ovaj gen ima tri iRNK zbog upotrebe alternativnih mjesta za transkripciju. Cis-djelujući segment nalazi se na 5' kraju egzona 1A, koji je uključen u indukciju ovisnu o stresu. Transkript koji počinje s egzonom 1B prvenstveno je induciran hipoksijom, što rezultira nakupljanjem ovog proteina u endoplazmatskom retikulumu (ER).

Smatra se da protein kodiran ovim genom igra važnu ulogu u savijanju proteina i lučenju u ER. Budući da je potiskivanje proteina povezano s ubrzanom apoptozom, također se sugerira da ima važnu citoprotektivnu ulogu u ćelijskim poremećajima uzrokovanim hipoksijom. Pokazalo se da je ovaj protein nadreguliran u tumorima, posebno u tumorima dojke, pa je povezan s invazivnošću tumora.

Postoji i alternativno mjesto za translaciju ovog gena kojem nedostaje signalni peptid. Ovaj protein bez signalnog peptida je samo tri aminokiseline kraći od zrelog proteina u ER-u, a smatra se da ima funkciju održavanja u citosolu.[7]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 999 aminokiselina, a molekulska težina 111.335 Da.[8].

1020304050
MADKVRRQRPRRRVCWALVAVLLADLLALSDTLAVMSVDLGSESMKVAIV
KPGVPMEIVLNKESRRKTPVIVTLKENERFFGDSAASMAIKNPKATLRYF
QHLLGKQADNPHVALYQARFPEHELTFDPQRQTVHFQISSQLQFSPEEVL
GMVLNYSRSLAEDFAEQPIKDAVITVPVFFNQAERRAVLQAARMAGLKVL
QLINDNTATALSYGVFRRKDINTTAQNIMFYDMGSGSTVCTIVTYQMVKT
KEAGMQPQLQIRGVGFDRTLGGLEMELRLRERLAGLFNEQRKGQRAKDVR
ENPRAMAKLLREANRLKTVLSANADHMAQIEGLMDDVDFKAKVTRVEFEE
LCADLFERVPGPVQQALQSAEMSLDEIEQVILVGGATRVPRVQEVLLKAV
GKEELGKNINADEAAAMGAVYQAAALSKAFKVKPFVVRDAVVYPILVEFT
REVEEEPGIHSLKHNKRVLFSRMGPYPQRKVITFNRYSHDFNFHINYGDL
GFLGPEDLRVFGSQNLTTVKLKGVGDSFKKYPDYESKGIKAHFNLDESGV
LSLDRVESVFETLVEDSAEEESTLTKLGNTISSLFGGGTTPDAKENGTDT
VQEEEESPAEGSKDEPGEQVELKEEAEAPVEDGSQPPPPEPKGDATPEGE
KATEKENGDKSEAQKPSEKAEAGPEGVAPAPEGEKKQKPARKRRMVEEIG
VELVVLDLPDLPEDKLAQSVQKLQDLTLRDLEKQEREKAANSLEAFIFET
QDKLYQPEYQEVSTEEQREEISGKLSAASTWLEDEGVGATTVMLKEKLAE
LRKLCQGLFFRVEERKKWPERLSALDNLLNHSSMFLKGARLIPEMDQIFT
EVEMTTLEKVINETWAWKNATLAEQAKLPATEKPVLLSKDIEAKMMALDR
EVQYLLNKAKFTKPRPRPKDKNGTRAEPPLNASASDQGEKVIPPAGQTED
AEPISEPEKVETGSEPGDTEPLELGGPGAEPEQKEQSTGQKRPLKNDEL

Reference

uredi
  1. ^ a b c ENSG00000149428 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000280682, ENSG00000149428 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032115 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Ikeda J, Kaneda S, Kuwabara K, Ogawa S, Kobayashi T, Matsumoto M, Yura T, Yanagi H (Feb 1997). "Cloning and expression of cDNA encoding the human 150 kDa oxygen-regulated protein, ORP150". Biochem Biophys Res Commun. 230 (1): 94–9. doi:10.1006/bbrc.1996.5890. PMID 9020069.
  6. ^ Ozawa K, Kuwabara K, Tamatani M, Takatsuji K, Tsukamoto Y, Kaneda S, Yanagi H, Stern DM, Eguchi Y, Tsujimoto Y, Ogawa S, Tohyama M (Mar 1999). "150-kDa oxygen-regulated protein (ORP150) suppresses hypoxia-induced apoptotic cell death". J Biol Chem. 274 (10): 6397–404. doi:10.1074/jbc.274.10.6397. PMID 10037731.
  7. ^ a b "Entrez Gene: HYOU1 hypoxia up-regulated 1".
  8. ^ "UniProt, Q9Y4L1". Pristupljeno 23. 8. 2021.

Dopunska literatura

uredi