[go: up one dir, main page]

Idi na sadržaj

DDX50

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
DDX50
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2E29

Identifikatori
AliasiDDX50
Vanjski ID-jeviOMIM: 610373 MGI: 2182303 HomoloGene: 56986 GeneCards: DDX50
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 10 (čovjek)
Hrom.Hromosom 10 (čovjek)[1]
Hromosom 10 (čovjek)
Genomska lokacija za DDX50
Genomska lokacija za DDX50
Bend10q22.1Početak68,901,286 bp[1]
Kraj68,946,847 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 10 (miš)
Hrom.Hromosom 10 (miš)[2]
Hromosom 10 (miš)
Genomska lokacija za DDX50
Genomska lokacija za DDX50
Bend10|10 B4Početak62,451,674 bp[2]
Kraj62,486,997 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija nucleotide binding
hydrolase activity
ATP binding
GO:0008026 helicase activity
nucleic acid binding
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta ćelijska membrana
membrana
jedro
Jedarce
citoplazma
Biološki proces RNA secondary structure unwinding
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_024045

NM_053183
NM_001358819
NM_001358820

RefSeq (bjelančevina)

NP_076950

NP_444413
NP_001345748
NP_001345749

Lokacija (UCSC)Chr 10: 68.9 – 68.95 MbChr 10: 62.45 – 62.49 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

ATP-ovisna RNK-helikaza DDX50 je enzim koji je kod ljudi kodiran genom DDX50.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 737 aminokiselina, а molekulska težina 82 565[7]

1020304050
MPGKLLWGDIMELEAPLEESESQKKERQKSDRRKSRHHYDSDEKSETREN
GVTDDLDAPKAKKSKMKEKLNGDTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLPNGD
IDEYEKKSKRVSSLDTSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETIK
LLKGRGVTYLFPIQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQ
RNQETIKKSRSPKVLVLAPTRELANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQ
SQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLSKLRHVVLDEVDQMLDLGF
AEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMKSRYEQVDL
VGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKK
NVTEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAAR
GLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQL
RYVEQKAGITFKRVGVPSTMDLVKSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQ
RLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLITSDKGFVTMTLESLEEIQD
VSCAWKELNRKLSSNAVSQITRMCLLKGNMGVCFDVPTTESERLQAEWHD
SDWILSVPAKLPEIEEYYDGNTSSNSRQRSGWSSGRSGRSGRSGGRSGGR
SGRQSRQGSRSGSRQDGRRRSGNRNRSRSGGHKRSFD

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Proteini DEAD-kutija, karakterizirani konzerviranim motivom Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), su pretpostavljene RNK helikaze. Uključeni su u brojne ćelijske procese koji obuhvataju promjenu sekundarnu strukturu RNK, kao što su inicijacija translacije, jedarno i mitohondrijsko spajanje i ribosoma i sklapanje splajsosoma. Na osnovu njihovih obrazaca distribucije, vjeruje se da su neki članovi ove porodice proteina iz DEAD-kutij uključeni u embriogenezu, spermatogenezu i ćelijski rast i diobu. Ovaj gen kodira DEAD-boksni enzim koji može biti uključen u sintezu ili preradu ribosomske RNK. Ovaj gen i DDX21, koji se također naziva RH-II/GuA, imaju slične genomske strukture i u tandemskoj su orijentaciji na hromosomu 10, što sugerira da su dva gena nastala duplikacijom gena u evoluciji. Ovaj gen ima pseudogene na hromosomima 2, 3 i 4. Alternativna prerada ovog gena stvara višestruke varijante transkripta, ali priroda pune dužine svih ostalih varijanti ni nije definirana.[6]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000107625 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020076 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Valdez BC, Yang H, Hong E, Sequitin AM (Mar 2002). "Genomic structure of newly identified paralogue of RNA helicase II/Gu: detection of pseudogenes and multiple alternatively spliced mRNAs". Gene. 284 (1–2): 53–61. doi:10.1016/S0378-1119(01)00888-5. PMID 11891046.
  6. ^ a b "Entrez Gene: DDX50 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 50".
  7. ^ "UniProt, Q9BQ39". Pristupljeno 31. 8. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]