[go: up one dir, main page]

Idi na sadržaj

STH (gen)

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
Verzija za štampanje više nije podržana i može davati greške. Ažurirajte oznake i koristite ugrađenu mogućnost štampanja preglednika.
STH (gen)
Identifikatori
AliasiSTH
Vanjski ID-jeviOMIM: 607067 HomoloGene: 88448 GeneCards: STH
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 17 (čovjek)
Hrom.Hromosom 17 (čovjek)[1]
Hromosom 17 (čovjek)
Genomska lokacija za STH (gen)
Genomska lokacija za STH (gen)
Bend17q21.31Početak45,999,250 bp[1]
Kraj45,999,694 bp[1]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta jedro
citoplazma
perinuklearno područje citoplazme
Biološki proces positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001007532

n/a

RefSeq (bjelančevina)

NP_001007533

n/a

Lokacija (UCSC)Chr 17: 46 – 46 Mbn/a
PubMed pretraga[2]n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Saitohin je protein koji je kod ljudi kodiran genom STH.[3][4][5]

Dužina polipeptidnog lanca je 128 aminokiselina, a molekulska težina 13 652[6]

Aminokiselinska sekvenca

Simboli
1020304050
MSEGGGQVSCIFAAPTRLCRWPALIECGVNLTQPLCEWMIQVARDRTLSL
AWEVASLLTLSSSEVGLEGVGTIWPSSYSSEESSRNGAEQGRQLSIEGPF
QGQNCPSHPAAALPLPMRGESQATSCQV

Kloniranje i ekspresija

Tokom ispitivanja EST-a u ljudskom tau lokusu, Conrad et al. (2002) identificirali su gen koga su označili saitohin ili STH, u čast pokojnog dr. Tsuanao Saitoh-a i njegove laboratorije. Gen STH kodira predviđeni protein od 128 aminokiselina.

Koristeći višestruku cDNK biblioteku tkiva, otkrili su da je najjača ekspresija STH u posteljici, mišićima, fetusnom mozgu i mozgu odraslih, sa slabijom ekspresijom u srcu, bubrezima, želucu, testisima i nadbubrežnoj žlijezdi. U centralnom nervnom sistemu najsnažnija ekspresija je bila je u sljepoočnom režnju, hipotalamusu, meduli i kičmenoj moždini, s slabijom ekspresijom u ostalim dijelovima mozga. Došlo je do značajnog preklapanja sa općom ekspresijom tau tkiva i CNS-a, iako su postojale neke razlike. Rezultati su pokazali da STH nije pod regulacijom promotora tau, ali može imati neke regionalne regulatorne elemente s tau genom.

Analizom genomske sekvence, utvrdili su da je gen STH bez introna, a proučavanjem genomske sekvence, lokalizirali su gen STH unutar introna devet gena tau, približno 2,5 kb nizvodno od egzona 9, na hromosomu 17q21. Ova lokacija bila je zanimljiva jer se većina mutacija ćeonosljepoočne demencije javlja u ili oko ovog introna i susjednih tau egzona. Gen STH očitava se u smislenom pravcu, u odnosu na tau.

Molekulska genetika

Conrad et al. (2002) su identificirali jednonukleotidni polimorfizam, A do G, koji je promijenio gln7 u arg (Q7R).[7] Inicijalne genetičke studije polimorfizma Q7R pokazale su povezanost s kasno nastalom Alzheimerovom bolešću (AD), sugerirajući da bi STH mogao biti faktor koji doprinosi AD. Među 203 slučaja kasnog početka (stariji od 65 godina) AD i 309 kontrola, Cook et al. (2002) nisu pronašli dokaze o povezanosti polimorfizma Q7R i AD.[8]

U dvije različite grupe AD pacijenata sa ukupno 247 osoba, Seripa et al. (2004) nisu pronašli vezu između polimorfizma Q7R i AD. Međutim, STH G alel (arg7) povećao je rizik od AD kod pacijenata koji su također nosili alel APOE4, što sugerira da polimorfizam STH može biti modifikator APOE4.[9] Među 499 pacijenata s AD, 91 bolesnikom s frontotemporalnom demencijom i 402 kontrolne skupine, Verpillat et al. (2002) nisu pronašli značajne razlike u distribuciji polimorfizma Q7R. Zabilježen je trend povećanja učestalosti genotipa RR kod pacijenata sa AD, u odnosu na kontrolu i trend povećanja frekvencije genotipa QQ kod pacijenata sa FTD, u odnosu na kontrolu. Autori su primijetili da je Q alel dio haplotipa H1 tau, a R alela halotipa H2.[10] De Silva et al. (2003) iznijeli su dokaze koji sugeriraju da su Q varijanta i QQ genotip polimorfizma Q7R u genu STH snažno povezani s progresivnom supranukleusnom paralizom: 47 od 49 (95,9%) oboljelih pacijenata imalo je QQ genotip, dok je 37 od 62 (59,7%) kontrola imale genotip QQ. Međutim, autori su primijetili da je Q alel ujedno najčešći haplotip u normalnim kontrolama.[8][11]

Reference

  1. ^ a b c ENSG00000281139 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000256762, ENSG00000281139 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ Conrad C, Vianna C, Freeman M, Davies P (maj 2002). "A polymorphic gene nested within an intron of the tau gene: implications for Alzheimer's disease". Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (11): 7751–6. doi:10.1073/pnas.112194599. PMC 124341. PMID 12032355.
  4. ^ Gao L, Tse SW, Conrad C, Andreadis A (Nov 2005). "Saitohin, which is nested in the tau locus and confers allele-specific susceptibility to several neurodegenerative diseases, interacts with peroxiredoxin 6". J Biol Chem. 280 (47): 39268–72. doi:10.1074/jbc.M506116200. PMID 16186110.
  5. ^ "Entrez Gene: STH saitohin".
  6. ^ "UniProt, Q8IWL8". Pristupljeno 12. 6. 2021.
  7. ^ Conrad, C., Vianna, C., Freeman, M., Davies, P. A polymorphic gene nested within an intron of the tau gene: implications for Alzheimer's disease. Proc. Nat. Acad. Sci. 99: 7751-7756, 2002. PubMed: 12032355
  8. ^ a b Cook, L., Brayne, C. E., Easton, D., Evans, J. G., Xuereb, J., Cairns, N. J., Rubinsztein, D. C. No evidence for an association between saitohin Q7R polymorphism and Alzheimer's disease. (Letter) Ann. Neurol. 52: 690-691, 2002. [PubMed]: 12402275
  9. ^ Seripa, D., Matera, M. G., D'Andrea, R. P., Gravina, C., Masullo, C., Daniele, A., Bizzarro, A., Rinaldi, M., Antuono, P., Wekstein, D. R., Dal Forno, G., Fazio, V. M. Alzheimer disease risk associated with APOE4 is modified by STH gene polymorphism. Neurology 62: 1631-1633, 2004. [PubMed]: 15136700
  10. ^ Verpillat, P., Ricard, S., Hannequin, D., Dubois, B., Bou, J., Camuzat, A., Pradier, L., Frebourg, T., Brice, A., Clerget-Darpoux, F., Deleuze, J.-F., Campion, D., the French Study Group on Alzheimer's Disease and Frontotemporal Dementia. Is the saitohin gene involved in neurodegenerative diseases? Ann. Neurol. 52: 829-832, 2002. [PubMed]: 12447938.
  11. ^ de Silva, R., Hope, A., Pittman, A., Weale, M. E., Morris, H. R., Wood, N. W., Lees, A. J. Strong association of the Saitohin gene Q7 variant with progressive supranuclear palsy. Neurology 61: 407-409, 2003. [PubMed]: 12913211

Dopunska literatura