TRIM24

TRIM24
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2YYN, 3O33, 3O34, 3O35, 3O36, 3O37, 4YAB, 4YAD, 4YAT, 4YAX, 4YBM, 4YBS, 4YBT, 4YC9, 4ZQL
Ідентифікатори
Символи	TRIM24, PTC6, RNF82, TF1A, TIF1, TIF1A, TIF1ALPHA, hTIF1, tripartite motif containing 24
Зовнішні ІД	OMIM: 603406 MGI: 109275 HomoloGene: 20830 GeneCards: TRIM24
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein kinase activity; • sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • zinc ion binding; • p53 binding; • chromatin binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • methylated histone binding; • estrogen response element binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nuclear receptor binding; • lysine-acetylated histone binding; • signaling receptor binding; • protein tyrosine kinase activity; • transferase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • внутрішньоклітинний; • perichromatin fibrils; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of protein stability; • calcium ion homeostasis; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • regulation of vitamin D receptor signaling pathway; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • cellular response to estrogen stimulus; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • protein phosphorylation; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • GO:0044257 protein catabolic process; • Убіквітин-залежний протеоліз; • protein autophosphorylation; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of cell population proliferation; • peptidyl-tyrosine phosphorylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	8805
	21848
	ENSG00000122779
	ENSMUSG00000029833
	O15164
	Q64127
	NM_003852; NM_015905
	NM_001272064; NM_001272076; NM_145076
	NP_003843; NP_056989
	NP_001258993; NP_001259005; NP_659542
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRIM24 (англ. Tripartite motif containing 24) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 050 амінокислот, а молекулярна маса — 116 831^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVAVEKAVA	AAAAASAAAS	GGPSAAPSGE	NEAESRQGPD	SERGGEAARL
NLLDTCAVCH	QNIQSRAPKL	LPCLHSFCQR	CLPAPQRYLM	LPAPMLGSAE
TPPPVPAPGS	PVSGSSPFAT	QVGVIRCPVC	SQECAERHII	DNFFVKDTTE
VPSSTVEKSN	QVCTSCEDNA	EANGFCVECV	EWLCKTCIRA	HQRVKFTKDH
TVRQKEEVSP	EAVGVTSQRP	VFCPFHKKEQ	LKLYCETCDK	LTCRDCQLLE
HKEHRYQFIE	EAFQNQKVII	DTLITKLMEK	TKYIKFTGNQ	IQNRIIEVNQ
NQKQVEQDIK	VAIFTLMVEI	NKKGKALLHQ	LESLAKDHRM	KLMQQQQEVA
GLSKQLEHVM	HFSKWAVSSG	SSTALLYSKR	LITYRLRHLL	RARCDASPVT
NNTIQFHCDP	SFWAQNIINL	GSLVIEDKES	QPQMPKQNPV	VEQNSQPPSG
LSSNQLSKFP	TQISLAQLRL	QHMQQQVMAQ	RQQVQRRPAP	VGLPNPRMQG
PIQQPSISHQ	QPPPRLINFQ	NHSPKPNGPV	LPPHPQQLRY	PPNQNIPRQA
IKPNPLQMAF	LAQQAIKQWQ	ISSGQGTPST	TNSTSSTPSS	PTITSAAGYD
GKAFGSPMID	LSSPVGGSYN	LPSLPDIDCS	STIMLDNIVR	KDTNIDHGQP
RPPSNRTVQS	PNSSVPSPGL	AGPVTMTSVH	PPIRSPSASS	VGSRGSSGSS
SKPAGADSTH	KVPVVMLEPI	RIKQENSGPP	ENYDFPVVIV	KQESDEESRP
QNANYPRSIL	TSLLLNSSQS	STSEETVLRS	DAPDSTGDQP	GLHQDNSSNG
KSEWLDPSQK	SPLHVGETRK	EDDPNEDWCA	VCQNGGELLC	CEKCPKVFHL
SCHVPTLTNF	PSGEWICTFC	RDLSKPEVEY	DCDAPSHNSE	KKKTEGLVKL
TPIDKRKCER	LLLFLYCHEM	SLAFQDPVPL	TVPDYYKIIK	NPMDLSTIKK
RLQEDYSMYS	KPEDFVADFR	LIFQNCAEFN	EPDSEVANAG	IKLENYFEEL
LKNLYPEKRF	PKPEFRNESE	DNKFSDDSDD	DFVQPRKKRL	KSIEERQLLK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Thenot S., Henriquet C., Rochefort H., Cavailles V. (1997). Differential interaction of nuclear receptors with the putative human transcriptional coactivator hTIF1. J. Biol. Chem. 272: 12062—12068. PMID 9115274 DOI:10.1074/jbc.272.18.12062
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Klugbauer S., Rabes H.M. (1999). The transcription coactivator HTIF1 and a related protein are fused to the RET receptor tyrosine kinase in childhood papillary thyroid carcinomas. Oncogene. 18: 4388—4393. PMID 10439047 DOI:10.1038/sj.onc.1202824
Teyssier C., Ou C.Y., Khetchoumian K., Losson R., Stallcup M.R. (2006). Transcriptional intermediary factor 1alpha mediates physical interaction and functional synergy between the coactivator-associated arginine methyltransferase 1 and glucocorticoid receptor-interacting protein 1 nuclear receptor coactivators. Mol. Endocrinol. 20: 1276—1286. PMID 16322096 DOI:10.1210/me.2005-0393
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11812 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-25 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O15164 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11812 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-25 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, O15164 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]