DDX3Y

DDX3Y
Ідентифікатори
Символи	DDX3Y, DBY, DEAD-box helicase 3, Y-linked, DEAD-box helicase 3 Y-linked
Зовнішні ІД	OMIM: 400010 MGI: 1349406 HomoloGene: 55839 GeneCards: DDX3Y
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • nucleotide binding; • hydrolase activity; • ATP binding; • GO:0008026 helicase activity; • RNA binding; • nucleic acid binding;
Клітинна компонента	• cytoplasmic ribonucleoprotein granule; • мембрана; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма; • ядерце;
Біологічний процес	• translational initiation; • регуляція експресії генів; • RNA secondary structure unwinding; • chromosome segregation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	8653
	26900
	ENSG00000067048
	ENSMUSG00000069045
	O15523
	Q62095
	NM_001122665; NM_001302552; NM_004660; NM_001324195
	NM_012008
	NP_001116137; NP_001289481; NP_001311124; NP_004651
	NP_036138
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DDX3Y (англ. DEAD-box helicase 3, Y-linked) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на Y-хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 660 амінокислот, а молекулярна маса — 73 154^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSHVVVKNDP	ELDQQLANLD	LNSEKQSGGA	STASKGRYIP	PHLRNREASK
GFHDKDSSGW	SCSKDKDAYS	SFGSRDSRGK	PGYFSERGSG	SRGRFDDRGR
SDYDGIGNRE	RPGFGRFERS	GHSRWCDKSV	EDDWSKPLPP	SERLEQELFS
GGNTGINFEK	YDDIPVEATG	SNCPPHIENF	SDIDMGEIIM	GNIELTRYTR
PTPVQKHAIP	IIKGKRDLMA	CAQTGSGKTA	AFLLPILSQI	YTDGPGEALK
AVKENGRYGR	RKQYPISLVL	APTRELAVQI	YEEARKFSYR	SRVRPCVVYG
GADIGQQIRD	LERGCHLLVA	TPGRLVDMME	RGKIGLDFCK	YLVLDEADRM
LDMGFEPQIR	RIVEQDTMPP	KGVRHTMMFS	ATFPKEIQML	ARDFLDEYIF
LAVGRVGSTS	ENITQKVVWV	EDLDKRSFLL	DILGATGSDS	LTLVFVETKK
GADSLEDFLY	HEGYACTSIH	GDRSQRDREE	ALHQFRSGKS	PILVATAVAA
RGLDISNVRH	VINFDLPSDI	EEYVHRIGRT	GRVGNLGLAT	SFFNEKNMNI
TKDLLDLLVE	AKQEVPSWLE	NMAYEHHYKG	GSRGRSKSNR	FSGGFGARDY
RQSSGSSSSG	FGASRGSSSR	SGGGGYGNSR	GFGGGGYGGF	YNSDGYGGNY
NSQGVDWWGN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Lahn B.T., Page D.C. (1997). Functional coherence of the human Y chromosome. Science. 278: 675—680. PMID 9381176 DOI:10.1126/science.278.5338.675
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Sekiguchi T., Iida H., Fukumura J., Nishimoto T. (2004). Human DDX3Y, the Y-encoded isoform of RNA helicase DDX3, rescues a hamster temperature-sensitive ET24 mutant cell line with a DDX3X mutation. Exp. Cell Res. 300: 213—222. PMID 15383328 DOI:10.1016/j.yexcr.2004.07.005
Ditton H.J., Zimmer J., Kamp C., Rajpert-De Meyts E., Vogt P.H. (2004). The AZFa gene DBY (DDX3Y) is widely transcribed but the protein is limited to the male germ cells by translation control. Hum. Mol. Genet. 13: 2333—2341. PMID 15294876 DOI:10.1093/hmg/ddh240
Goulet I., Boisvenue S., Mokas S., Mazroui R., Cote J. (2008). TDRD3, a novel Tudor domain-containing protein, localizes to cytoplasmic stress granules. Hum. Mol. Genet. 17: 3055—3074. PMID 18632687 DOI:10.1093/hmg/ddn203

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2699 (англ.) . Архів оригіналу за 6 липня 2017. Процитовано 13 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-06 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O15523 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також

Хромосома Y

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2699 (англ.) . Архів оригіналу за 6 липня 2017. Процитовано 13 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-06 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, O15523 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]