RLIM

RLIM
Ідентифікатори
Символи	RLIM, NY-REN-43, RNF12, ring finger protein, LIM domain interacting, MRX61, TOKAS
Зовнішні ІД	OMIM: 300379 MGI: 1342291 HomoloGene: 7920 GeneCards: RLIM
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001106 transcription corepressor activity; • зв'язування з іоном металу; • transferase activity; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• transcription repressor complex; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • Убіквітин-залежний протеоліз; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • protein polyubiquitination; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; • random inactivation of X chromosome; • regulation of dosage compensation by inactivation of X chromosome;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	51132
	19820
	ENSG00000131263
	ENSMUSG00000056537
	Q9NVW2
	Q9WTV7
	NM_183353; NM_016120
	NM_011276; NM_001358205
	NP_057204; NP_899196
	NP_035406; NP_001345134
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RLIM (англ. Ring finger protein, LIM domain interacting) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 624 амінокислот, а молекулярна маса — 68 549^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MENSDSNDKG	SGDQSAAQRR	SQMDRLDREE	AFYQFVNNLS	EEDYRLMRDN
NLLGTPGEST	EEELLRRLQQ	IKEGPPPQNS	DENRGGDSSD	DVSNGDSIID
WLNSVRQTGN	TTRSGQRGNQ	SWRAVSRTNP	NSGDFRFSLE	INVNRNNGSQ
NSENENEPSA	RRSSGENVEN	NSQRQVENPR	SESTSARPSR	SERNSTEALT
EVPPTRGQRR	ARSRSPDHRR	TRARAERSRS	PLHPMSEIPR	RSHHSISSQT
FEHPLVNETE	GSSRTRHHVT	LRQQISGPEL	LSRGLFAASG	TRNASQGAGS
SDTAASGEST	GSGQRPPTIV	LDLQVRRVRP	GEYRQRDSIA	SRTRSRSQTP
NNTVTYESER	GGFRRTFSRS	ERAGVRTYVS	TIRIPIRRIL	NTGLSETTSV
AIQTMLRQIM	TGFGELSYFM	YSDSDSEPTG	SVSNRNMERA	ESRSGRGGSG
GGSSSGSSSS	SSSSSSSSSS	SSSSSSPSSS	SGGESSETSS	DLFEGSNEGS
SSSGSSGARR	EGRHRAPVTF	DESGSLPFLS	LAQFFLLNED	DDDQPRGLTK
EQIDNLAMRS	FGENDALKTC	SVCITEYTEG	NKLRKLPCSH	EYHVHCIDRW
LSENSTCPIC	RRAVLASGNR	ESVV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Her Y.R., Chung I.K. (2009). Ubiquitin ligase RLIM modulates telomere length homeostasis through a proteolysis of TRF1. J. Biol. Chem. 284: 8557—8566. PMID 19164295 DOI:10.1074/jbc.M806702200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13429 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 13 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NVW2 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також

Хромосома X

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13429 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 13 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9NVW2 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

RLIM

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук