ARHGEF2

ARHGEF2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5EFX
Ідентифікатори
Символи	ARHGEF2, GEF, GEF-H1, GEFH1, LFP40, P40, Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 2, NEDMHM, Lfc
Зовнішні ІД	OMIM: 607560 MGI: 103264 HomoloGene: 3468 GeneCards: ARHGEF2
Пов'язані генетичні захворювання
	бічний аміотрофічний склероз
Онтологія гена
Молекулярна функція	• microtubule binding; • zinc ion binding; • transcription factor binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • guanyl-nucleotide exchange factor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • везикула; • гіалоплазма; • комплекс Ґольджі; • cell projection; • мембрана; • focal adhesion; • bicellular tight junction; • веретено поділу; • клітинна мембрана; • dendritic shaft; • ruffle membrane; • міжклітинні контакти; • soma; • мікротрубочка; • цитоскелет; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • podosome; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • GO:0009327 protein-containing complex; • glutamatergic synapse; • postsynaptic density, intracellular component;
Біологічний процес	• GO:0007243 intracellular signal transduction; • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to osmotic stress; • negative regulation of necroptotic process; • actin filament organization; • процес імунної системи; • negative regulation of neurogenesis; • cellular response to tumor necrosis factor; • поділ клітини; • cellular response to muramyl dipeptide; • cellular hyperosmotic response; • negative regulation of microtubule depolymerization; • regulation of cell population proliferation; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors; • GO:0000767 cell morphogenesis; • establishment of mitotic spindle orientation; • positive regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • клітинний цикл; • regulation of Rho protein signal transduction; • intracellular protein transport; • вроджений імунітет; • regulation of small GTPase mediated signal transduction; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of podosome assembly; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • positive regulation of neuron differentiation; • asymmetric neuroblast division; • positive regulation of neuron migration; • multicellular organism development; • нейробіологія розвитку; • диференціація клітин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	9181
	16800
	ENSG00000116584
	ENSMUSG00000028059
	Q92974
	Q60875
NM_001162383; NM_001162384; NM_004723; NM_001350110; NM_001350111;
	NM_001350112
	NM_001198911; NM_001198912; NM_001198913; NM_008487; NM_001377126
NP_001155855; NP_001155856; NP_004714; NP_001337039; NP_001337040;
	NP_001337041
	NP_001185840; NP_001185841; NP_001185842; NP_032513; NP_001364055
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ARHGEF2 (англ. Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 986 амінокислот, а молекулярна маса — 111 543^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRIESLTRA	RIDRSRELAS	KTREKEKMKE	AKDARYTNGH	LFTTISVSGM
TMCYACNKSI	TAKEALICPT	CNVTIHNRCK	DTLANCTKVK	QKQQKAALLK
NNTALQSVSL	RSKTTIRERP	SSAIYPSDSF	RQSLLGSRRG	RSSLSLAKSV
STTNIAGHFN	DESPLGLRRI	LSQSTDSLNM	RNRTLSVESL	IDEAEVIYSE
LMSDFEMDEK	DFAADSWSLA	VDSSFLQQHK	KEVMKQQDVI	YELIQTELHH
VRTLKIMTRL	FRTGMLEELH	LEPGVVQGLF	PCVDELSDIH	TRFLSQLLER
RRQALCPGST	RNFVIHRLGD	LLISQFSGPS	AEQMCKTYSE	FCSRHSKALK
LYKELYARDK	RFQQFIRKVT	RPAVLKRHGV	QECILLVTQR	ITKYPLLISR
ILQHSHGIEE	ERQDLTTALG	LVKELLSNVD	EGIYQLEKGA	RLQEIYNRMD
PRAQTPVPGK	GPFGREELLR	RKLIHDGCLL	WKTATGRFKD	VLVLLMTDVL
VFLQEKDQKY	IFPTLDKPSV	VSLQNLIVRD	IANQEKGMFL	ISAAPPEMYE
VHTASRDDRS	TWIRVIQQSV	RTCPSREDFP	LIETEDEAYL	RRIKMELQQK
DRALVELLRE	KVGLFAEMTH	FQAEEDGGSG	MALPTLPRGL	FRSESLESPR
GERLLQDAIR	EVEGLKDLLV	GPGVELLLTP	REPALPLEPD	SGGNTSPGVT
ANGEARTFNG	SIELCRADSD	SSQRDRNGNQ	LRSPQEEALQ	RLVNLYGLLH
GLQAAVAQQD	TLMEARFPEG	PERREKLCRA	NSRDGEAGRA	GAAPVAPEKQ
ATELALLQRQ	HALLQEELRR	CRRLGEERAT	EAGSLEARLR	ESEQARALLE
REAEEARRQL	AALGQTEPLP	AEAPWARRPV	DPRRRSLPAG	DALYLSFNPP
QPSRGTDRLD	LPVTTRSVHR	NFEDRERQEL	GSPEERLQDS	SDPDTGSEEE
GSSRLSPPHS	PRDFTRMQDI	PEETESRDGE	AVASES

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, щільних контактах.

Література

Ren Y., Li R., Zheng Y., Busch H. (1998). Cloning and characterization of GEF-H1, a microtubule-associated guanine nucleotide exchange factor for Rac and Rho GTPases. J. Biol. Chem. 273: 34954—34960. PMID 9857026 DOI:10.1074/jbc.273.52.34954
Krendel M., Zenke F.T., Bokoch G.M. (2002). Nucleotide exchange factor GEF-H1 mediates cross-talk between microtubules and the actin cytoskeleton. Nat. Cell Biol. 4: 294—301. PMID 11912491 DOI:10.1038/ncb773
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Callow M.G., Zozulya S., Gishizky M.L., Jallal B., Smeal T. (2005). PAK4 mediates morphological changes through the regulation of GEF-H1. J. Cell Sci. 118: 1861—1872. PMID 15827085 DOI:10.1242/jcs.02313
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Birkenfeld J., Nalbant P., Yoon S.-H., Bokoch G.M. (2008). Cellular functions of GEF-H1, a microtubule-regulated Rho-GEF: is altered GEF-H1 activity a crucial determinant of disease pathogenesis?. Trends Cell Biol. 18: 210—219. PMID 18394899 DOI:10.1016/j.tcb.2008.02.006

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ARHGEF2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:682 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q92974 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ARHGEF2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:682 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q92974 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

ARHGEF2

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук